RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551690.1

PPP1CC-209, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 3

Gene PPP1CC, Length 603 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-209	ENST00000551690	MSH6	P52701	1360 aa		33.51	■■■□□ 2.96
PPP1CC-209	ENST00000551690	NWD1	Q149M9	1564 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PPP1CC-209	ENST00000551690	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PPP1CC-209	ENST00000551690	PHLPP1	O60346	1717 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PPP1CC-209	ENST00000551690	JCAD	Q9P266	1359 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PPP1CC-209	ENST00000551690	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
PPP1CC-209	ENST00000551690	ZFYVE9	O95405	1425 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PPP1CC-209	ENST00000551690	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
PPP1CC-209	ENST00000551690	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PPP1CC-209	ENST00000551690	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PPP1CC-209	ENST00000551690	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
PPP1CC-209	ENST00000551690	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PPP1CC-209	ENST00000551690	ADGRL2	O95490	1459 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PPP1CC-209	ENST00000551690	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
PPP1CC-209	ENST00000551690	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
PPP1CC-209	ENST00000551690	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
PPP1CC-209	ENST00000551690	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93
PPP1CC-209	ENST00000551690	C14orf37	Q86TY3	774 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PPP1CC-209	ENST00000551690	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PPP1CC-209	ENST00000551690	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
PPP1CC-209	ENST00000551690	TBX22	Q9Y458	520 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PPP1CC-209	ENST00000551690	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
PPP1CC-209	ENST00000551690	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PPP1CC-209	ENST00000551690	LRP6	O75581	1613 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PPP1CC-209	ENST00000551690	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PPP1CC-209	ENST00000551690	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
PPP1CC-209	ENST00000551690	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	33.24	■■■□□ 2.91
PPP1CC-209	ENST00000551690	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PPP1CC-209	ENST00000551690	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PPP1CC-209	ENST00000551690	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PPP1CC-209	ENST00000551690	TRIM52	Q96A61	297 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PPP1CC-209	ENST00000551690	ATF3	P18847	181 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PPP1CC-209	ENST00000551690	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PPP1CC-209	ENST00000551690	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PPP1CC-209	ENST00000551690	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
PPP1CC-209	ENST00000551690	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
PPP1CC-209	ENST00000551690	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	33.18	■■■□□ 2.9
PPP1CC-209	ENST00000551690	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
PPP1CC-209	ENST00000551690	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PPP1CC-209	ENST00000551690	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
PPP1CC-209	ENST00000551690	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
PPP1CC-209	ENST00000551690	BRINP3	Q76B58	766 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PPP1CC-209	ENST00000551690	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
PPP1CC-209	ENST00000551690	PIK3R4	Q99570	1358 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PPP1CC-209	ENST00000551690	PTPRU	Q92729	1446 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PPP1CC-209	ENST00000551690		E9PCH4	1651 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PPP1CC-209	ENST00000551690	UNC13B	O14795	1591 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PPP1CC-209	ENST00000551690	DIP2A	Q14689	1571 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PPP1CC-209	ENST00000551690	SHPRH	Q149N8	1683 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PPP1CC-209	ENST00000551690	RXRB	P28702	533 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PPP1CC-209	ENST00000551690	TRPM2	O94759	1503 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PPP1CC-209	ENST00000551690	AFF2	P51816	1311 aa		33	■■■□□ 2.87
PPP1CC-209	ENST00000551690	NUP155	O75694	1391 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PPP1CC-209	ENST00000551690	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PPP1CC-209	ENST00000551690	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PPP1CC-209	ENST00000551690	DCC	P43146	1447 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PPP1CC-209	ENST00000551690	MST1R	Q04912	1400 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PPP1CC-209	ENST00000551690	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
PPP1CC-209	ENST00000551690	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.95	■■■□□ 2.86
PPP1CC-209	ENST00000551690	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PPP1CC-209	ENST00000551690	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PPP1CC-209	ENST00000551690	MET	P08581	1390 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PPP1CC-209	ENST00000551690	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
PPP1CC-209	ENST00000551690	ITGAE	P38570	1179 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PPP1CC-209	ENST00000551690	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
PPP1CC-209	ENST00000551690	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
PPP1CC-209	ENST00000551690	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
PPP1CC-209	ENST00000551690	C8orf37	Q96NL8	207 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PPP1CC-209	ENST00000551690	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PPP1CC-209	ENST00000551690	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PPP1CC-209	ENST00000551690	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
PPP1CC-209	ENST00000551690	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PPP1CC-209	ENST00000551690	RGS12	O14924	1447 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PPP1CC-209	ENST00000551690	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
PPP1CC-209	ENST00000551690	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PPP1CC-209	ENST00000551690	ADAMTS2	O95450	1211 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PPP1CC-209	ENST00000551690	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PPP1CC-209	ENST00000551690	NGLY1	Q96IV0	654 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PPP1CC-209	ENST00000551690	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PPP1CC-209	ENST00000551690	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PPP1CC-209	ENST00000551690	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
PPP1CC-209	ENST00000551690	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PPP1CC-209	ENST00000551690	ORAI2	Q96SN7	254 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PPP1CC-209	ENST00000551690	CLTCL1	P53675	1640 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PPP1CC-209	ENST00000551690	USP21	Q9UK80	565 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PPP1CC-209	ENST00000551690	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PPP1CC-209	ENST00000551690	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PPP1CC-209	ENST00000551690	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
PPP1CC-209	ENST00000551690	PTCH1	Q13635	1447 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PPP1CC-209	ENST00000551690	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PPP1CC-209	ENST00000551690	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
PPP1CC-209	ENST00000551690	LAMC1	P11047	1609 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PPP1CC-209	ENST00000551690	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
PPP1CC-209	ENST00000551690	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
PPP1CC-209	ENST00000551690	KIF1B	O60333	1816 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PPP1CC-209	ENST00000551690	ATRN	O75882	1429 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PPP1CC-209	ENST00000551690	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
PPP1CC-209	ENST00000551690	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PPP1CC-209	ENST00000551690	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PPP1CC-209	ENST00000551690	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78

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