RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551594.1

CTDSP2-207, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP2, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-207ENST00000551594 RGL3Q3MIN7 710 aa27.46■■□□□ 1.99
CTDSP2-207ENST00000551594 ZFYVE9O95405 1425 aa27.46■■□□□ 1.99
CTDSP2-207ENST00000551594 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
CTDSP2-207ENST00000551594 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.45■■□□□ 1.98
CTDSP2-207ENST00000551594 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
CTDSP2-207ENST00000551594 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDSP2-207ENST00000551594 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
CTDSP2-207ENST00000551594 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CTDSP2-207ENST00000551594 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDSP2-207ENST00000551594 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDSP2-207ENST00000551594 MED14O60244 1454 aa27.39■■□□□ 1.98
CTDSP2-207ENST00000551594 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
CTDSP2-207ENST00000551594 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.39■■□□□ 1.98
CTDSP2-207ENST00000551594 IQGAP1P46940 1657 aa27.36■■□□□ 1.97
CTDSP2-207ENST00000551594 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.36■■□□□ 1.97
CTDSP2-207ENST00000551594 PPLO60437 1756 aa27.35■■□□□ 1.97
CTDSP2-207ENST00000551594 NEUROD1Q13562 356 aa27.35■■□□□ 1.97
CTDSP2-207ENST00000551594 BCANQ96GW7 911 aa27.35■■□□□ 1.97
CTDSP2-207ENST00000551594 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.32■■□□□ 1.96
CTDSP2-207ENST00000551594 IFT172Q9UG01 1749 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDSP2-207ENST00000551594 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDSP2-207ENST00000551594 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
CTDSP2-207ENST00000551594 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.27■■□□□ 1.96
CTDSP2-207ENST00000551594 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CTDSP2-207ENST00000551594 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.25■■□□□ 1.95
CTDSP2-207ENST00000551594 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.25■■□□□ 1.95
CTDSP2-207ENST00000551594 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.23■■□□□ 1.95
CTDSP2-207ENST00000551594 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.23■■□□□ 1.95
CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
CTDSP2-207ENST00000551594 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.21■■□□□ 1.95
CTDSP2-207ENST00000551594 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.19■■□□□ 1.94
CTDSP2-207ENST00000551594 TBX22Q9Y458 520 aa27.19■■□□□ 1.94
CTDSP2-207ENST00000551594 MYOM2P54296 1465 aa27.18■■□□□ 1.94
CTDSP2-207ENST00000551594 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.15■■□□□ 1.94
CTDSP2-207ENST00000551594 DIP2AQ14689 1571 aa27.14■■□□□ 1.94
CTDSP2-207ENST00000551594 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.14■■□□□ 1.94
CTDSP2-207ENST00000551594 ALKQ9UM73 1620 aa27.14■■□□□ 1.94
CTDSP2-207ENST00000551594 PIK3C2GO75747 1445 aa27.14■■□□□ 1.93
CTDSP2-207ENST00000551594 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.14■■□□□ 1.93
CTDSP2-207ENST00000551594 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CTDSP2-207ENST00000551594 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.12■■□□□ 1.93
CTDSP2-207ENST00000551594 METP08581 1390 aa27.11■■□□□ 1.93
CTDSP2-207ENST00000551594 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
CTDSP2-207ENST00000551594 TONSLQ96HA7 1378 aa27.09■■□□□ 1.93
CTDSP2-207ENST00000551594 KCNA6P17658 529 aa27.09■■□□□ 1.93
CTDSP2-207ENST00000551594 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.09■■□□□ 1.93
CTDSP2-207ENST00000551594 STAC3Q96MF2 364 aa27.09■■□□□ 1.93
CTDSP2-207ENST00000551594 PTPRUQ92729 1446 aa27.07■■□□□ 1.92
CTDSP2-207ENST00000551594 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
CTDSP2-207ENST00000551594 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDSP2-207ENST00000551594 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDSP2-207ENST00000551594 PIK3R4Q99570 1358 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDSP2-207ENST00000551594 NWD1Q149M9 1564 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDSP2-207ENST00000551594 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDSP2-207ENST00000551594 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDSP2-207ENST00000551594 CPS1P31327 1500 aa27■■□□□ 1.91
CTDSP2-207ENST00000551594 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
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CTDSP2-207ENST00000551594 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-207ENST00000551594 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-207ENST00000551594 CERKQ8TCT0 537 aa26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-207ENST00000551594 STK26Q9P289 416 aa26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-207ENST00000551594 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-207ENST00000551594 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CTDSP2-207ENST00000551594 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
CTDSP2-207ENST00000551594 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDSP2-207ENST00000551594 ADGRB1O14514 1584 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDSP2-207ENST00000551594 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CTDSP2-207ENST00000551594 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CTDSP2-207ENST00000551594 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CTDSP2-207ENST00000551594 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDSP2-207ENST00000551594 TMEM94Q12767 1356 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDSP2-207ENST00000551594 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDSP2-207ENST00000551594 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDSP2-207ENST00000551594 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDSP2-207ENST00000551594 ABCC11Q96J66 1382 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDSP2-207ENST00000551594 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDSP2-207ENST00000551594 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP2-207ENST00000551594 TECPR2O15040 1411 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP2-207ENST00000551594 PTCH1Q13635 1447 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP2-207ENST00000551594 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP2-207ENST00000551594 C14orf37Q86TY3 774 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDSP2-207ENST00000551594 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.83■■□□□ 1.88
CTDSP2-207ENST00000551594 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CTDSP2-207ENST00000551594 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDSP2-207ENST00000551594 PRAM1Q96QH2 718 aa26.79■■□□□ 1.88
CTDSP2-207ENST00000551594 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
CTDSP2-207ENST00000551594 SIRT1Q96EB6 747 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDSP2-207ENST00000551594 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDSP2-207ENST00000551594 DLC1Q96QB1 1528 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDSP2-207ENST00000551594 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDSP2-207ENST00000551594 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDSP2-207ENST00000551594 POGKQ9P215 609 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDSP2-207ENST00000551594 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDSP2-207ENST00000551594 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CTDSP2-207ENST00000551594 MSH6P52701 1360 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDSP2-207ENST00000551594 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
CTDSP2-207ENST00000551594 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDSP2-207ENST00000551594 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDSP2-207ENST00000551594 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.74■■□□□ 1.87
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