RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551219.5

PTPRR-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRR, Length 2,966 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-211ENST00000551219 NECTIN2Q92692 538 aa8.83□□□□□ -1
PTPRR-211ENST00000551219 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.83□□□□□ -1
PTPRR-211ENST00000551219 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PTPRR-211ENST00000551219 PREX2Q70Z35 1606 aa8.82□□□□□ -1
PTPRR-211ENST00000551219 JPH4Q96JJ6 628 aa8.82□□□□□ -1
PTPRR-211ENST00000551219 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PTPRR-211ENST00000551219 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.81□□□□□ -1
PTPRR-211ENST00000551219 ATP10AO60312 1499 aa8.81□□□□□ -1
PTPRR-211ENST00000551219 A2MP01023 1474 aa8.81□□□□□ -1
PTPRR-211ENST00000551219 ERBINQ96RT1 1412 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-211ENST00000551219 IQGAP3Q86VI3 1631 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-211ENST00000551219 NEUROD2Q15784 382 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-211ENST00000551219 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
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PTPRR-211ENST00000551219 CLASP1Q7Z460 1538 aa8.78□□□□□ -1
PTPRR-211ENST00000551219 PLA2R1Q13018 1463 aa8.78□□□□□ -1
PTPRR-211ENST00000551219 MAGI2Q86UL8 1455 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRR-211ENST00000551219 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.77□□□□□ -1
PTPRR-211ENST00000551219 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.77□□□□□ -1.01
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PTPRR-211ENST00000551219 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 CRBNQ96SW2 442 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 CDCA7LQ96GN5 454 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 SYCP2Q9BX26 1530 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.75□□□□□ -1.01
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PTPRR-211ENST00000551219 PANK3Q9H999 370 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 KDM2BQ8NHM5 1336 aa8.75□□□□□ -1.01
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PTPRR-211ENST00000551219 ERCC6Q03468 1493 aa8.75□□□□□ -1.01
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PTPRR-211ENST00000551219 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 CDCA8Q53HL2 280 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 STAC3Q96MF2 364 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 PIK3C2GO75747 1445 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 ZNF428Q96B54 188 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 WDR7Q9Y4E6 1490 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 IQGAP1P46940 1657 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 SCAPERQ9BY12 1400 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 MADDQ8WXG6 1647 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 ZNF521Q96K83 1311 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 ABCC2Q92887 1545 aa8.72□□□□□ -1.01
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PTPRR-211ENST00000551219 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa8.71□□□□□ -1.01
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PTPRR-211ENST00000551219 TTC37Q6PGP7 1564 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRR-211ENST00000551219 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
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PTPRR-211ENST00000551219 KNSTRNQ9Y448 316 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 PPP2R1AP30153 589 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 GOLGA2Q08379 1002 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 TRPM2O94759 1503 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 NINLQ9Y2I6 1382 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 GSE1Q14687 1217 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 SLFN5Q08AF3 891 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 C20orf194Q5TEA3 1177 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.67□□□□□ -1.02
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PTPRR-211ENST00000551219 CEP152O94986 1710 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 PTPRTO14522 1441 aa8.67□□□□□ -1.02
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PTPRR-211ENST00000551219 SHROOM2Q13796 1616 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 ABCC1P33527 1531 aa8.66□□□□□ -1.02
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PTPRR-211ENST00000551219 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 PROM2Q8N271 834 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 E9PSI1 815 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 IL27Q8NEV9 243 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRR-211ENST00000551219 ZMYM3Q14202 1370 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-211ENST00000551219 ARAP3Q8WWN8 1544 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-211ENST00000551219 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.64□□□□□ -1.03
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