RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 MED14O60244 1454 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-224ENST00000551155 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
CS-224ENST00000551155 IQGAP1P46940 1657 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-224ENST00000551155 NEURL4Q96JN8 1562 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-224ENST00000551155 CCDC144AA2RUR9 1427 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-224ENST00000551155 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP13.75□□□□□ -0.21
CS-224ENST00000551155 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
CS-224ENST00000551155 LTKP29376 864 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-224ENST00000551155 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
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CS-224ENST00000551155 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
CS-224ENST00000551155 ZFYVE9O95405 1425 aa13.72□□□□□ -0.21
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CS-224ENST00000551155 BCANQ96GW7 911 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-224ENST00000551155 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-224ENST00000551155 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-224ENST00000551155 VGFO15240 615 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
CS-224ENST00000551155 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-224ENST00000551155 PPLO60437 1756 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-224ENST00000551155 RGL3Q3MIN7 710 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-224ENST00000551155 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
CS-224ENST00000551155 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-224ENST00000551155 DIP2AQ14689 1571 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-224ENST00000551155 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
CS-224ENST00000551155 PCGF6Q9BYE7 350 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-224ENST00000551155 SLC26A8Q96RN1 970 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-224ENST00000551155 TBX22Q9Y458 520 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-224ENST00000551155 IFT172Q9UG01 1749 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-224ENST00000551155 LTBP4Q8N2S1 1624 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-224ENST00000551155 CPS1P31327 1500 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-224ENST00000551155 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-224ENST00000551155 CERKQ8TCT0 537 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-224ENST00000551155 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
CS-224ENST00000551155 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
CS-224ENST00000551155 STAC3Q96MF2 364 aa13.6□□□□□ -0.23
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CS-224ENST00000551155 PIK3R4Q99570 1358 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-224ENST00000551155 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-224ENST00000551155 STRCP1A6NGW2 1772 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-224ENST00000551155 KCNA6P17658 529 aa13.59□□□□□ -0.23
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CS-224ENST00000551155 MYOM2P54296 1465 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-224ENST00000551155 NWD1Q149M9 1564 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-224ENST00000551155 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
CS-224ENST00000551155 ALKQ9UM73 1620 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-224ENST00000551155 DCAF11Q8TEB1 546 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-224ENST00000551155 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-224ENST00000551155 LAMC1P11047 1609 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-224ENST00000551155 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
CS-224ENST00000551155 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
CS-224ENST00000551155 PIK3C2GO75747 1445 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-224ENST00000551155 LRRC7Q96NW7 1537 aa13.53□□□□□ -0.24
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CS-224ENST00000551155 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-224ENST00000551155 METP08581 1390 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-224ENST00000551155 NRXN1Q9ULB1 1477 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-224ENST00000551155 NEUROD1Q13562 356 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-224ENST00000551155 FBXO41Q8TF61 875 aa13.51□□□□□ -0.25
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CS-224ENST00000551155 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CS-224ENST00000551155 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CS-224ENST00000551155 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa13.5□□□□□ -0.25
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CS-224ENST00000551155 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CS-224ENST00000551155 CLSPNQ9HAW4 1339 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-224ENST00000551155 TOM1O60784 492 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-224ENST00000551155 TMEM94Q12767 1356 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-224ENST00000551155 UBAP1LF5GYI3 381 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-224ENST00000551155 CFAP70Q5T0N1 1121 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-224ENST00000551155 L3MBTL2Q969R5 705 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-224ENST00000551155 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-224ENST00000551155 MSH6P52701 1360 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 C14orf37Q86TY3 774 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 PRAG1Q86YV5 1406 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 TONSLQ96HA7 1378 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 KNDC1Q76NI1 1749 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 TMEM132EQ6IEE7 984 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 PTCH1Q13635 1447 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 ABCC11Q96J66 1382 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 C19orf44Q9H6X5 657 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 TECPR2O15040 1411 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 SIRT1Q96EB6 747 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 STK26Q9P289 416 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
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CS-224ENST00000551155 ATF3P18847 181 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 POTEHQ6S545 545 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 ROBO2Q9HCK4 1378 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 ADGRB1O14514 1584 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-224ENST00000551155 DCCP43146 1447 aa13.39□□□□□ -0.27
CS-224ENST00000551155 FAM135BQ49AJ0 1406 aa13.39□□□□□ -0.27
CS-224ENST00000551155 NALCNQ8IZF0 1738 aa13.39□□□□□ -0.27
CS-224ENST00000551155 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa13.39□□□□□ -0.27
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