RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 DCAF11Q8TEB1 546 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 PPLO60437 1756 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 ZFYVE9O95405 1425 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 MYOM2P54296 1465 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 PRAG1Q86YV5 1406 aa11.73□□□□□ -0.53
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CS-216ENST00000549221 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 STAG3Q9UJ98 1225 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 RIMS2Q9UQ26 1411 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-216ENST00000549221 ARHGAP23Q9P227 1491 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-216ENST00000549221 TMEM2Q9UHN6 1383 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-216ENST00000549221 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-216ENST00000549221 SLIT1O75093 1534 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-216ENST00000549221 PIK3C2GO75747 1445 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-216ENST00000549221 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CS-216ENST00000549221 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-216ENST00000549221 LTKP29376 864 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-216ENST00000549221 RALGAPBQ86X10 1494 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-216ENST00000549221 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-216ENST00000549221 NBPF1Q3BBV0 1214 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-216ENST00000549221 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CS-216ENST00000549221 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa11.65□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 VGFO15240 615 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 HSPA2P54652 639 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 CFAP70Q5T0N1 1121 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 TXNDC2Q86VQ3 553 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 STAC3Q96MF2 364 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 IQGAP1P46940 1657 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 GPRASP1Q5JY77 1395 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 ADGRB1O14514 1584 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 STRCQ7RTU9 1775 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 ALKQ9UM73 1620 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 LAMC1P11047 1609 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 MED14O60244 1454 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 EID1Q9Y6B2 187 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa11.6□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 METP08581 1390 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 TMEM132EQ6IEE7 984 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.55
CS-216ENST00000549221 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-216ENST00000549221 ANKLE2Q86XL3 938 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-216ENST00000549221 SLC26A8Q96RN1 970 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-216ENST00000549221 CARD11Q9BXL7 1154 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-216ENST00000549221 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-216ENST00000549221 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-216ENST00000549221 USP47Q96K76 1375 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-216ENST00000549221 PTPRUQ92729 1446 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-216ENST00000549221 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-216ENST00000549221 BCANQ96GW7 911 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-216ENST00000549221 DIP2AQ14689 1571 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-216ENST00000549221 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-216ENST00000549221 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-216ENST00000549221 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP11.53□□□□□ -0.56
CS-216ENST00000549221 STK26Q9P289 416 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-216ENST00000549221 TRAK1Q9UPV9 953 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-216ENST00000549221 TBX22Q9Y458 520 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-216ENST00000549221 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-216ENST00000549221 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 KNDC1Q76NI1 1749 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 TECPR2O15040 1411 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 CPS1P31327 1500 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 ABCC11Q96J66 1382 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 ROBO2Q9HCK4 1378 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 DLC1Q96QB1 1528 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 TESK2Q96S53 571 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 IQSEC2Q5JU85 1478 aa11.49□□□□□ -0.57
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CS-216ENST00000549221 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 PIK3R4Q99570 1358 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 NWD1Q149M9 1564 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 QRICH2Q9H0J4 1663 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 STRCP1A6NGW2 1772 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 KCNA6P17658 529 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 WAPLQ7Z5K2 1190 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 PRAM1Q96QH2 718 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 PTCH1Q13635 1447 aa11.46□□□□□ -0.57
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