RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548759.1

DTX1-204, Transcript of deltex E3 ubiquitin ligase 1, humanhuman

TSL 2

Gene DTX1, Length 940 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX1-204ENST00000548759 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
DTX1-204ENST00000548759 KCNA6P17658 529 aa41.95■■■■■ 4.31
DTX1-204ENST00000548759 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41.93■■■■■ 4.3
DTX1-204ENST00000548759 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.91■■■■■ 4.3
DTX1-204ENST00000548759 ZFYVE9O95405 1425 aa41.9■■■■■ 4.3
DTX1-204ENST00000548759 ALKQ9UM73 1620 aa41.9■■■■■ 4.3
DTX1-204ENST00000548759 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.9■■■■■ 4.3
DTX1-204ENST00000548759 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
DTX1-204ENST00000548759 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.87■■■■■ 4.29
DTX1-204ENST00000548759 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
DTX1-204ENST00000548759 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa41.85■■■■■ 4.29
DTX1-204ENST00000548759 NAIPQ13075 1403 aa41.83■■■■■ 4.29
DTX1-204ENST00000548759 TMEM94Q12767 1356 aa41.82■■■■■ 4.29
DTX1-204ENST00000548759 ILDR2Q71H61 639 aa41.81■■■■■ 4.28
DTX1-204ENST00000548759 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
DTX1-204ENST00000548759 TBX22Q9Y458 520 aa41.76■■■■■ 4.28
DTX1-204ENST00000548759 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
DTX1-204ENST00000548759 TRIM52Q96A61 297 aa41.74■■■■■ 4.27
DTX1-204ENST00000548759 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
DTX1-204ENST00000548759 HFM1A2PYH4 1435 aa41.67■■■■■ 4.26
DTX1-204ENST00000548759 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
DTX1-204ENST00000548759 NWD1Q149M9 1564 aa41.65■■■■■ 4.26
DTX1-204ENST00000548759 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.64■■■■■ 4.26
DTX1-204ENST00000548759 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa41.62■■■■■ 4.25
DTX1-204ENST00000548759 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
DTX1-204ENST00000548759 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
DTX1-204ENST00000548759 MSH6P52701 1360 aa41.57■■■■■ 4.25
DTX1-204ENST00000548759 FAM135BQ49AJ0 1406 aa41.56■■■■■ 4.24
DTX1-204ENST00000548759 PIK3R4Q99570 1358 aa41.51■■■■■ 4.24
DTX1-204ENST00000548759 C14orf37Q86TY3 774 aa41.51■■■■■ 4.24
DTX1-204ENST00000548759 DIP2AQ14689 1571 aa41.5■■■■■ 4.23
DTX1-204ENST00000548759 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
DTX1-204ENST00000548759 TRPM2O94759 1503 aa41.49■■■■■ 4.23
DTX1-204ENST00000548759 SLAIN2Q9P270 581 aa41.49■■■■■ 4.23
DTX1-204ENST00000548759 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa41.49■■■■■ 4.23
DTX1-204ENST00000548759 CLTCL1P53675 1640 aa41.48■■■■■ 4.23
DTX1-204ENST00000548759 SOCS7O14512 581 aa41.46■■■■■ 4.23
DTX1-204ENST00000548759 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa41.42■■■■■ 4.22
DTX1-204ENST00000548759 PTPRUQ92729 1446 aa41.41■■■■■ 4.22
DTX1-204ENST00000548759 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
DTX1-204ENST00000548759 FOXD1Q16676 465 aa41.39■■■■■ 4.22
DTX1-204ENST00000548759 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.38■■■■■ 4.21
DTX1-204ENST00000548759 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa41.37■■■■■ 4.21
DTX1-204ENST00000548759 KIF1BO60333 1816 aa41.36■■■■■ 4.21
DTX1-204ENST00000548759 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa41.36■■■■■ 4.21
DTX1-204ENST00000548759 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa41.34■■■■■ 4.21
DTX1-204ENST00000548759 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa41.34■■■■■ 4.21
DTX1-204ENST00000548759 ATF3P18847 181 aa41.34■■■■■ 4.21
DTX1-204ENST00000548759 METP08581 1390 aa41.34■■■■■ 4.21
DTX1-204ENST00000548759 CADPS2Q86UW7 1296 aa41.32■■■■■ 4.21
DTX1-204ENST00000548759 VGFO15240 615 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
DTX1-204ENST00000548759 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.3■■■■■ 4.2
DTX1-204ENST00000548759 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa41.27■■■■■ 4.2
DTX1-204ENST00000548759 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
DTX1-204ENST00000548759 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
DTX1-204ENST00000548759 RGL3Q3MIN7 710 aa41.15■■■■■ 4.18
DTX1-204ENST00000548759 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.15■■■■■ 4.18
DTX1-204ENST00000548759 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.15■■■■■ 4.18
DTX1-204ENST00000548759 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
DTX1-204ENST00000548759 PHLPP1O60346 1717 aa41.13■■■■■ 4.17
DTX1-204ENST00000548759 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
DTX1-204ENST00000548759 BRINP3Q76B58 766 aa41.08■■■■■ 4.17
DTX1-204ENST00000548759 JCADQ9P266 1359 aa41.08■■■■■ 4.17
DTX1-204ENST00000548759 DCCP43146 1447 aa41.08■■■■■ 4.17
DTX1-204ENST00000548759 PPLO60437 1756 aa41.04■■■■■ 4.16
DTX1-204ENST00000548759 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa41.03■■■■■ 4.16
DTX1-204ENST00000548759 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.01■■■■■ 4.15
DTX1-204ENST00000548759 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa41.01■■■■■ 4.15
DTX1-204ENST00000548759 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.99■■■■■ 4.15
DTX1-204ENST00000548759 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.99■■■■■ 4.15
DTX1-204ENST00000548759 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
DTX1-204ENST00000548759 MST1RQ04912 1400 aa40.98■■■■■ 4.15
DTX1-204ENST00000548759 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
DTX1-204ENST00000548759 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.95■■■■■ 4.15
DTX1-204ENST00000548759 PTCH1Q13635 1447 aa40.94■■■■■ 4.14
DTX1-204ENST00000548759 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
DTX1-204ENST00000548759 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa40.89■■■■■ 4.14
DTX1-204ENST00000548759 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40.88■■■■■ 4.14
DTX1-204ENST00000548759 NALCNQ8IZF0 1738 aa40.88■■■■■ 4.13
DTX1-204ENST00000548759 POTEAQ6S8J7 498 aa40.88■■■■■ 4.13
DTX1-204ENST00000548759 STK26Q9P289 416 aa40.88■■■■■ 4.13
DTX1-204ENST00000548759 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
DTX1-204ENST00000548759 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.84■■■■■ 4.13
DTX1-204ENST00000548759 TMEM132EQ6IEE7 984 aa40.84■■■■■ 4.13
DTX1-204ENST00000548759 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
DTX1-204ENST00000548759 C1orf167Q5SNV9 1468 aa40.81■■■■■ 4.12
DTX1-204ENST00000548759 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
DTX1-204ENST00000548759 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
DTX1-204ENST00000548759 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
DTX1-204ENST00000548759 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
DTX1-204ENST00000548759 IFT172Q9UG01 1749 aa40.78■■■■■ 4.12
DTX1-204ENST00000548759 WAPLQ7Z5K2 1190 aa40.77■■■■■ 4.12
DTX1-204ENST00000548759 ORAI2Q96SN7 254 aa40.77■■■■■ 4.12
DTX1-204ENST00000548759 PIK3C2GO75747 1445 aa40.76■■■■■ 4.11
DTX1-204ENST00000548759 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
DTX1-204ENST00000548759 LRP6O75581 1613 aa40.75■■■■■ 4.11
DTX1-204ENST00000548759 SHPRHQ149N8 1683 aa40.73■■■■■ 4.11
DTX1-204ENST00000548759 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
DTX1-204ENST00000548759 ABCC11Q96J66 1382 aa40.72■■■■■ 4.11
DTX1-204ENST00000548759 NHSL1Q5SYE7 1610 aa40.71■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms