RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547169.5

CTDSP2-202, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 1,340 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-202ENST00000547169 MED14O60244 1454 aa22.91■■□□□ 1.26
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CTDSP2-202ENST00000547169 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.89■■□□□ 1.26
CTDSP2-202ENST00000547169 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CTDSP2-202ENST00000547169 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CTDSP2-202ENST00000547169 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDSP2-202ENST00000547169 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.87■■□□□ 1.25
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CTDSP2-202ENST00000547169 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.83■■□□□ 1.25
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CTDSP2-202ENST00000547169 BCANQ96GW7 911 aa22.78■■□□□ 1.24
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CTDSP2-202ENST00000547169 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
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CTDSP2-202ENST00000547169 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.7■■□□□ 1.22
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CTDSP2-202ENST00000547169 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.67■■□□□ 1.22
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CTDSP2-202ENST00000547169 MYOM2P54296 1465 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDSP2-202ENST00000547169 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDSP2-202ENST00000547169 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.59■■□□□ 1.21
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CTDSP2-202ENST00000547169 PIK3C2GO75747 1445 aa22.58■■□□□ 1.21
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CTDSP2-202ENST00000547169 TONSLQ96HA7 1378 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDSP2-202ENST00000547169 LAMC1P11047 1609 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-202ENST00000547169 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
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CTDSP2-202ENST00000547169 TMEM94Q12767 1356 aa22.46■■□□□ 1.19
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CTDSP2-202ENST00000547169 SIRT1Q96EB6 747 aa22.43■■□□□ 1.18
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CTDSP2-202ENST00000547169 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.4■■□□□ 1.18
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CTDSP2-202ENST00000547169 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.37■■□□□ 1.17
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CTDSP2-202ENST00000547169 MSH6P52701 1360 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDSP2-202ENST00000547169 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2-202ENST00000547169 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.33■■□□□ 1.16
CTDSP2-202ENST00000547169 DLC1Q96QB1 1528 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-202ENST00000547169 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2-202ENST00000547169 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2-202ENST00000547169 PRAM1Q96QH2 718 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2-202ENST00000547169 POGKQ9P215 609 aa22.3■■□□□ 1.16
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