RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544902.5

TFDP1-208, Transcript of transcription factor Dp-1, human

TSL 2

Gene TFDP1, Length 1,571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TFDP1-208	ENST00000544902	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TFDP1-208	ENST00000544902	MED14	O60244	1454 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TFDP1-208	ENST00000544902	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
TFDP1-208	ENST00000544902	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
TFDP1-208	ENST00000544902	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
TFDP1-208	ENST00000544902	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
TFDP1-208	ENST00000544902	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TFDP1-208	ENST00000544902	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TFDP1-208	ENST00000544902	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TFDP1-208	ENST00000544902	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TFDP1-208	ENST00000544902	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
TFDP1-208	ENST00000544902	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.53	■■■□□ 2.8
TFDP1-208	ENST00000544902	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
TFDP1-208	ENST00000544902	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TFDP1-208	ENST00000544902	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
TFDP1-208	ENST00000544902	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TFDP1-208	ENST00000544902	PPL	O60437	1756 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TFDP1-208	ENST00000544902	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TFDP1-208	ENST00000544902	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TFDP1-208	ENST00000544902	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TFDP1-208	ENST00000544902	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TFDP1-208	ENST00000544902	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TFDP1-208	ENST00000544902	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TFDP1-208	ENST00000544902	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TFDP1-208	ENST00000544902	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
TFDP1-208	ENST00000544902	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TFDP1-208	ENST00000544902	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TFDP1-208	ENST00000544902	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TFDP1-208	ENST00000544902	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.34	■■■□□ 2.77
TFDP1-208	ENST00000544902	TBX22	Q9Y458	520 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TFDP1-208	ENST00000544902	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TFDP1-208	ENST00000544902	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TFDP1-208	ENST00000544902	DIP2A	Q14689	1571 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TFDP1-208	ENST00000544902	MET	P08581	1390 aa		32.26	■■■□□ 2.76
TFDP1-208	ENST00000544902	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TFDP1-208	ENST00000544902	MYOM2	P54296	1465 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TFDP1-208	ENST00000544902	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
TFDP1-208	ENST00000544902	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TFDP1-208	ENST00000544902	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
TFDP1-208	ENST00000544902	PTPRU	Q92729	1446 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TFDP1-208	ENST00000544902	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TFDP1-208	ENST00000544902	KCNA6	P17658	529 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TFDP1-208	ENST00000544902	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TFDP1-208	ENST00000544902	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TFDP1-208	ENST00000544902	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.2	■■■□□ 2.74
TFDP1-208	ENST00000544902	CPS1	P31327	1500 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TFDP1-208	ENST00000544902	PIK3R4	Q99570	1358 aa		32.17	■■■□□ 2.74
TFDP1-208	ENST00000544902	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
TFDP1-208	ENST00000544902	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TFDP1-208	ENST00000544902	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TFDP1-208	ENST00000544902	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TFDP1-208	ENST00000544902	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
TFDP1-208	ENST00000544902	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TFDP1-208	ENST00000544902	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TFDP1-208	ENST00000544902	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
TFDP1-208	ENST00000544902	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
TFDP1-208	ENST00000544902	STAC3	Q96MF2	364 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TFDP1-208	ENST00000544902	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
TFDP1-208	ENST00000544902	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
TFDP1-208	ENST00000544902	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
TFDP1-208	ENST00000544902	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TFDP1-208	ENST00000544902	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TFDP1-208	ENST00000544902	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.04	■■■□□ 2.72
TFDP1-208	ENST00000544902	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.04	■■■□□ 2.72
TFDP1-208	ENST00000544902	LAMC1	P11047	1609 aa		32.03	■■■□□ 2.72
TFDP1-208	ENST00000544902	STK26	Q9P289	416 aa		32.02	■■■□□ 2.72
TFDP1-208	ENST00000544902	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.01	■■■□□ 2.71
TFDP1-208	ENST00000544902	ADGRB1	O14514	1584 aa		32	■■■□□ 2.71
TFDP1-208	ENST00000544902	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TFDP1-208	ENST00000544902	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
TFDP1-208	ENST00000544902	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
TFDP1-208	ENST00000544902	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		31.97	■■■□□ 2.71
TFDP1-208	ENST00000544902	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		31.97	■■■□□ 2.71
TFDP1-208	ENST00000544902	PTCH1	Q13635	1447 aa		31.93	■■■□□ 2.7
TFDP1-208	ENST00000544902	ABCC11	Q96J66	1382 aa		31.93	■■■□□ 2.7
TFDP1-208	ENST00000544902	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		31.92	■■■□□ 2.7
TFDP1-208	ENST00000544902	TECPR2	O15040	1411 aa		31.91	■■■□□ 2.7
TFDP1-208	ENST00000544902	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		31.91	■■■□□ 2.7
TFDP1-208	ENST00000544902	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		31.9	■■■□□ 2.7
TFDP1-208	ENST00000544902	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		31.9	■■■□□ 2.7
TFDP1-208	ENST00000544902	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		31.89	■■■□□ 2.7
TFDP1-208	ENST00000544902	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		31.89	■■■□□ 2.7
TFDP1-208	ENST00000544902	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		31.89	■■■□□ 2.69
TFDP1-208	ENST00000544902	C14orf37	Q86TY3	774 aa		31.87	■■■□□ 2.69
TFDP1-208	ENST00000544902	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		31.87	■■■□□ 2.69
TFDP1-208	ENST00000544902	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.85	■■■□□ 2.69
TFDP1-208	ENST00000544902	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TFDP1-208	ENST00000544902	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
TFDP1-208	ENST00000544902	MSH6	P52701	1360 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TFDP1-208	ENST00000544902	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		31.82	■■■□□ 2.68
TFDP1-208	ENST00000544902	TOM1	O60784	492 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TFDP1-208	ENST00000544902	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	31.8	■■■□□ 2.68
TFDP1-208	ENST00000544902	PRAM1	Q96QH2	718 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TFDP1-208	ENST00000544902	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TFDP1-208	ENST00000544902	DLC1	Q96QB1	1528 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TFDP1-208	ENST00000544902	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TFDP1-208	ENST00000544902	SIRT1	Q96EB6	747 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TFDP1-208	ENST00000544902	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TFDP1-208	ENST00000544902	PIP4K2B	P78356	416 aa		31.77	■■■□□ 2.68
TFDP1-208	ENST00000544902	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68

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