RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543505.5

PGA3-208, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 3

Gene PGA3, Length 1,627 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-208ENST00000543505 ADGRB3O60242 1522 aa16.24■□□□□ 0.19
PGA3-208ENST00000543505 MYO5BQ9ULV0 1848 aa16.23■□□□□ 0.19
PGA3-208ENST00000543505 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PGA3-208ENST00000543505 BCANQ96GW7 911 aa16.21■□□□□ 0.19
PGA3-208ENST00000543505 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
PGA3-208ENST00000543505 ZFYVE9O95405 1425 aa16.2■□□□□ 0.18
PGA3-208ENST00000543505 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.2■□□□□ 0.18
PGA3-208ENST00000543505 MSH6P52701 1360 aa16.2■□□□□ 0.18
PGA3-208ENST00000543505 LRP6O75581 1613 aa16.2■□□□□ 0.18
PGA3-208ENST00000543505 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
PGA3-208ENST00000543505 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa16.2■□□□□ 0.18
PGA3-208ENST00000543505 JCADQ9P266 1359 aa16.19■□□□□ 0.18
PGA3-208ENST00000543505 SLC52A1Q9NWF4 448 aa16.18■□□□□ 0.18
PGA3-208ENST00000543505 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa16.17■□□□□ 0.18
PGA3-208ENST00000543505 RIMS2Q9UQ26 1411 aa16.16■□□□□ 0.18
PGA3-208ENST00000543505 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16.16■□□□□ 0.18
PGA3-208ENST00000543505 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
PGA3-208ENST00000543505 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa16.15■□□□□ 0.18
PGA3-208ENST00000543505 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16.14■□□□□ 0.17
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PGA3-208ENST00000543505 ADGRL2O95490 1459 aa16.13■□□□□ 0.17
PGA3-208ENST00000543505 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.13■□□□□ 0.17
PGA3-208ENST00000543505 TRIM52Q96A61 297 aa16.12■□□□□ 0.17
PGA3-208ENST00000543505 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PGA3-208ENST00000543505 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PGA3-208ENST00000543505 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PGA3-208ENST00000543505 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa16.1■□□□□ 0.17
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PGA3-208ENST00000543505 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
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PGA3-208ENST00000543505 C14orf37Q86TY3 774 aa16.08■□□□□ 0.17
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PGA3-208ENST00000543505 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa16.08■□□□□ 0.17
PGA3-208ENST00000543505 SHPRHQ149N8 1683 aa16.08■□□□□ 0.16
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PGA3-208ENST00000543505 C19orf44Q9H6X5 657 aa16.08■□□□□ 0.16
PGA3-208ENST00000543505 DIP2AQ14689 1571 aa16.07■□□□□ 0.16
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PGA3-208ENST00000543505 BRINP3Q76B58 766 aa16.07■□□□□ 0.16
PGA3-208ENST00000543505 E9PCH4 1651 aa16.07■□□□□ 0.16
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PGA3-208ENST00000543505 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
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PGA3-208ENST00000543505 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PGA3-208ENST00000543505 ATF3P18847 181 aa16.05■□□□□ 0.16
PGA3-208ENST00000543505 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa16.05■□□□□ 0.16
PGA3-208ENST00000543505 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
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PGA3-208ENST00000543505 UNC13BO14795 1591 aa16.03■□□□□ 0.16
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PGA3-208ENST00000543505 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.97■□□□□ 0.15
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PGA3-208ENST00000543505 NHSL1Q5SYE7 1610 aa15.96■□□□□ 0.15
PGA3-208ENST00000543505 METP08581 1390 aa15.96■□□□□ 0.15
PGA3-208ENST00000543505 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PGA3-208ENST00000543505 RGS12O14924 1447 aa15.95■□□□□ 0.14
PGA3-208ENST00000543505 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa15.95■□□□□ 0.14
PGA3-208ENST00000543505 DCCP43146 1447 aa15.94■□□□□ 0.14
PGA3-208ENST00000543505 C8orf37Q96NL8 207 aa15.94■□□□□ 0.14
PGA3-208ENST00000543505 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PGA3-208ENST00000543505 NUP155O75694 1391 aa15.93■□□□□ 0.14
PGA3-208ENST00000543505 PNPLA6Q8IY17 1366 aa15.93■□□□□ 0.14
PGA3-208ENST00000543505 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa15.92■□□□□ 0.14
PGA3-208ENST00000543505 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PGA3-208ENST00000543505 ROCK1Q13464 1354 aa15.9■□□□□ 0.14
PGA3-208ENST00000543505 NALCNQ8IZF0 1738 aa15.9■□□□□ 0.14
PGA3-208ENST00000543505 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PGA3-208ENST00000543505 ADAMTS2O95450 1211 aa15.89■□□□□ 0.13
PGA3-208ENST00000543505 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa15.88■□□□□ 0.13
PGA3-208ENST00000543505 ITGAEP38570 1179 aa15.87■□□□□ 0.13
PGA3-208ENST00000543505 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PGA3-208ENST00000543505 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PGA3-208ENST00000543505 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa15.87■□□□□ 0.13
PGA3-208ENST00000543505 NGLY1Q96IV0 654 aa15.86■□□□□ 0.13
PGA3-208ENST00000543505 ORAI2Q96SN7 254 aa15.86■□□□□ 0.13
PGA3-208ENST00000543505 C1orf167Q5SNV9 1468 aa15.86■□□□□ 0.13
PGA3-208ENST00000543505 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa15.85■□□□□ 0.13
PGA3-208ENST00000543505 CLTCL1P53675 1640 aa15.84■□□□□ 0.13
PGA3-208ENST00000543505 LAMC1P11047 1609 aa15.83■□□□□ 0.12
PGA3-208ENST00000543505 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
PGA3-208ENST00000543505 ROBO2Q9HCK4 1378 aa15.82■□□□□ 0.12
PGA3-208ENST00000543505 USP21Q9UK80 565 aa15.81■□□□□ 0.12
PGA3-208ENST00000543505 EP400Q96L91 3159 aa15.8■□□□□ 0.12
PGA3-208ENST00000543505 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
PGA3-208ENST00000543505 ATAD2Q6PL18 1390 aa15.77■□□□□ 0.12
PGA3-208ENST00000543505 ATRNO75882 1429 aa15.77■□□□□ 0.11
PGA3-208ENST00000543505 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
PGA3-208ENST00000543505 PTCH1Q13635 1447 aa15.75■□□□□ 0.11
PGA3-208ENST00000543505 KIF1BO60333 1816 aa15.75■□□□□ 0.11
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