RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, humanhuman

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STIP1-208ENST00000540501 SLIT1O75093 1534 aa37.02■■■■□ 3.52
STIP1-208ENST00000540501 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37■■■■□ 3.51
STIP1-208ENST00000540501 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.99■■■■□ 3.51
STIP1-208ENST00000540501 EID1Q9Y6B2 187 aa36.99■■■■□ 3.51
STIP1-208ENST00000540501 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36.99■■■■□ 3.51
STIP1-208ENST00000540501 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
STIP1-208ENST00000540501 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.98■■■■□ 3.51
STIP1-208ENST00000540501 PPLO60437 1756 aa36.98■■■■□ 3.51
STIP1-208ENST00000540501 IFT172Q9UG01 1749 aa36.97■■■■□ 3.51
STIP1-208ENST00000540501 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.97■■■■□ 3.51
STIP1-208ENST00000540501 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.96■■■■□ 3.51
STIP1-208ENST00000540501 ZFYVE9O95405 1425 aa36.95■■■■□ 3.51
STIP1-208ENST00000540501 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
STIP1-208ENST00000540501 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.93■■■■□ 3.5
STIP1-208ENST00000540501 MYOM2P54296 1465 aa36.92■■■■□ 3.5
STIP1-208ENST00000540501 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
STIP1-208ENST00000540501 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.9■■■■□ 3.5
STIP1-208ENST00000540501 FBXO41Q8TF61 875 aa36.87■■■■□ 3.49
STIP1-208ENST00000540501 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.87■■■■□ 3.49
STIP1-208ENST00000540501 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
STIP1-208ENST00000540501 LTKP29376 864 aa36.82■■■■□ 3.48
STIP1-208ENST00000540501 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
STIP1-208ENST00000540501 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.81■■■■□ 3.48
STIP1-208ENST00000540501 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.79■■■■□ 3.48
STIP1-208ENST00000540501 HSPA2P54652 639 aa36.79■■■■□ 3.48
STIP1-208ENST00000540501 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
STIP1-208ENST00000540501 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.78■■■■□ 3.48
STIP1-208ENST00000540501 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.76■■■■□ 3.47
STIP1-208ENST00000540501 MED14O60244 1454 aa36.75■■■■□ 3.47
STIP1-208ENST00000540501 PIK3C2GO75747 1445 aa36.74■■■■□ 3.47
STIP1-208ENST00000540501 BCANQ96GW7 911 aa36.71■■■■□ 3.47
STIP1-208ENST00000540501 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.7■■■■□ 3.47
STIP1-208ENST00000540501 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.69■■■■□ 3.46
STIP1-208ENST00000540501 LAMC1P11047 1609 aa36.69■■■■□ 3.46
STIP1-208ENST00000540501 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
STIP1-208ENST00000540501 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.68■■■■□ 3.46
STIP1-208ENST00000540501 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
STIP1-208ENST00000540501 IQGAP1P46940 1657 aa36.65■■■■□ 3.46
STIP1-208ENST00000540501 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.65■■■■□ 3.46
STIP1-208ENST00000540501 DIP2AQ14689 1571 aa36.65■■■■□ 3.46
STIP1-208ENST00000540501 STRCQ7RTU9 1775 aa36.64■■■■□ 3.46
STIP1-208ENST00000540501 NBPF8Q3BBV2 869 aa36.62■■■■□ 3.45
STIP1-208ENST00000540501 TBX22Q9Y458 520 aa36.62■■■■□ 3.45
STIP1-208ENST00000540501 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.61■■■■□ 3.45
STIP1-208ENST00000540501 ALKQ9UM73 1620 aa36.6■■■■□ 3.45
STIP1-208ENST00000540501 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.59■■■■□ 3.45
STIP1-208ENST00000540501 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.59■■■■□ 3.45
STIP1-208ENST00000540501 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.57■■■■□ 3.44
STIP1-208ENST00000540501 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.56■■■■□ 3.44
STIP1-208ENST00000540501 PIK3R4Q99570 1358 aa36.54■■■■□ 3.44
STIP1-208ENST00000540501 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
STIP1-208ENST00000540501 SLC26A8Q96RN1 970 aa36.52■■■■□ 3.44
STIP1-208ENST00000540501 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
STIP1-208ENST00000540501 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
STIP1-208ENST00000540501 GPRASP1Q5JY77 1395 aa36.48■■■■□ 3.43
STIP1-208ENST00000540501 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.45■■■■□ 3.43
STIP1-208ENST00000540501 ADGRB1O14514 1584 aa36.44■■■■□ 3.42
STIP1-208ENST00000540501 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.42■■■■□ 3.42
STIP1-208ENST00000540501 METP08581 1390 aa36.41■■■■□ 3.42
STIP1-208ENST00000540501 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.4■■■■□ 3.42
STIP1-208ENST00000540501 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
STIP1-208ENST00000540501 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.39■■■■□ 3.42
STIP1-208ENST00000540501 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.42
STIP1-208ENST00000540501 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
STIP1-208ENST00000540501 ABCC11Q96J66 1382 aa36.36■■■■□ 3.41
STIP1-208ENST00000540501 KCNA6P17658 529 aa36.35■■■■□ 3.41
STIP1-208ENST00000540501 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.33■■■■□ 3.41
STIP1-208ENST00000540501 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.33■■■■□ 3.41
STIP1-208ENST00000540501 SIRT1Q96EB6 747 aa36.32■■■■□ 3.4
STIP1-208ENST00000540501 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
STIP1-208ENST00000540501 TECPR2O15040 1411 aa36.31■■■■□ 3.4
STIP1-208ENST00000540501 DLC1Q96QB1 1528 aa36.29■■■■□ 3.4
STIP1-208ENST00000540501 NWD1Q149M9 1564 aa36.29■■■■□ 3.4
STIP1-208ENST00000540501 PTPRUQ92729 1446 aa36.29■■■■□ 3.4
STIP1-208ENST00000540501 STK26Q9P289 416 aa36.28■■■■□ 3.4
STIP1-208ENST00000540501 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
STIP1-208ENST00000540501 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.26■■■■□ 3.4
STIP1-208ENST00000540501 CERKQ8TCT0 537 aa36.25■■■■□ 3.39
STIP1-208ENST00000540501 PTCH1Q13635 1447 aa36.25■■■■□ 3.39
STIP1-208ENST00000540501 CPS1P31327 1500 aa36.24■■■■□ 3.39
STIP1-208ENST00000540501 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP36.24■■■■□ 3.39
STIP1-208ENST00000540501 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.24■■■■□ 3.39
STIP1-208ENST00000540501 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
STIP1-208ENST00000540501 USP47Q96K76 1375 aa36.22■■■■□ 3.39
STIP1-208ENST00000540501 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
STIP1-208ENST00000540501 SLC24A1O60721 1099 aa36.18■■■■□ 3.38
STIP1-208ENST00000540501 POGKQ9P215 609 aa36.18■■■■□ 3.38
STIP1-208ENST00000540501 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
STIP1-208ENST00000540501 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
STIP1-208ENST00000540501 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.14■■■■□ 3.38
STIP1-208ENST00000540501 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.13■■■■□ 3.37
STIP1-208ENST00000540501 PRAM1Q96QH2 718 aa36.13■■■■□ 3.37
STIP1-208ENST00000540501 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
STIP1-208ENST00000540501 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.11■■■■□ 3.37
STIP1-208ENST00000540501 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa36.08■■■■□ 3.37
STIP1-208ENST00000540501 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa36.08■■■■□ 3.37
STIP1-208ENST00000540501 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
STIP1-208ENST00000540501 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.07■■■■□ 3.36
STIP1-208ENST00000540501 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.04■■■■□ 3.36
STIP1-208ENST00000540501 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms