RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536072.6

EDC4-202, Transcript of enhancer of mRNA decapping 4, humanhuman

TSL 2

Gene EDC4, Length 2,375 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4-202ENST00000536072 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.53■■□□□ 1.2
EDC4-202ENST00000536072 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
EDC4-202ENST00000536072 PANK3Q9H999 370 aa22.53■■□□□ 1.2
EDC4-202ENST00000536072 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
EDC4-202ENST00000536072 MYOM2P54296 1465 aa22.53■■□□□ 1.2
EDC4-202ENST00000536072 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.52■■□□□ 1.2
EDC4-202ENST00000536072 GLI2P10070 1586 aa22.52■■□□□ 1.2
EDC4-202ENST00000536072 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.51■■□□□ 1.19
EDC4-202ENST00000536072 ADGRB3O60242 1522 aa22.49■■□□□ 1.19
EDC4-202ENST00000536072 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
EDC4-202ENST00000536072 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.49■■□□□ 1.19
EDC4-202ENST00000536072 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.49■■□□□ 1.19
EDC4-202ENST00000536072 IFT172Q9UG01 1749 aa22.49■■□□□ 1.19
EDC4-202ENST00000536072 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
EDC4-202ENST00000536072 NOS1P29475 1434 aa22.47■■□□□ 1.19
EDC4-202ENST00000536072 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.46■■□□□ 1.19
EDC4-202ENST00000536072 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
EDC4-202ENST00000536072 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.45■■□□□ 1.18
EDC4-202ENST00000536072 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.45■■□□□ 1.18
EDC4-202ENST00000536072 DIP2BQ9P265 1576 aa22.44■■□□□ 1.18
EDC4-202ENST00000536072 NLRP13Q86W25 1043 aa22.43■■□□□ 1.18
EDC4-202ENST00000536072 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.42■■□□□ 1.18
EDC4-202ENST00000536072 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
EDC4-202ENST00000536072 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
EDC4-202ENST00000536072 CDCA8Q53HL2 280 aa22.41■■□□□ 1.18
EDC4-202ENST00000536072 TSPOAP1O95153 1857 aa22.39■■□□□ 1.17
EDC4-202ENST00000536072 SYNMO15061 1565 aa22.38■■□□□ 1.17
EDC4-202ENST00000536072 PPLO60437 1756 aa22.37■■□□□ 1.17
EDC4-202ENST00000536072 PIK3C2GO75747 1445 aa22.36■■□□□ 1.17
EDC4-202ENST00000536072 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.36■■□□□ 1.17
EDC4-202ENST00000536072 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.35■■□□□ 1.17
EDC4-202ENST00000536072 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.35■■□□□ 1.17
EDC4-202ENST00000536072 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.35■■□□□ 1.17
EDC4-202ENST00000536072 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
EDC4-202ENST00000536072 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
EDC4-202ENST00000536072 PIK3C2BO00750 1634 aa22.34■■□□□ 1.17
EDC4-202ENST00000536072 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
EDC4-202ENST00000536072 ERVK-7P63135 1459 aa22.33■■□□□ 1.17
EDC4-202ENST00000536072 IDI1Q13907 227 aa22.33■■□□□ 1.16
EDC4-202ENST00000536072 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
EDC4-202ENST00000536072 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.32■■□□□ 1.16
EDC4-202ENST00000536072 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.32■■□□□ 1.16
EDC4-202ENST00000536072 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.32■■□□□ 1.16
EDC4-202ENST00000536072 MYOM1P52179 1685 aa22.32■■□□□ 1.16
EDC4-202ENST00000536072 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
EDC4-202ENST00000536072 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
EDC4-202ENST00000536072 SLC24A1O60721 1099 aa22.3■■□□□ 1.16
EDC4-202ENST00000536072 NUDCQ9Y266 331 aa22.3■■□□□ 1.16
EDC4-202ENST00000536072 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
EDC4-202ENST00000536072 ADGRB1O14514 1584 aa22.28■■□□□ 1.16
EDC4-202ENST00000536072 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.28■■□□□ 1.16
EDC4-202ENST00000536072 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.28■■□□□ 1.16
EDC4-202ENST00000536072 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
EDC4-202ENST00000536072 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.27■■□□□ 1.16
EDC4-202ENST00000536072 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.26■■□□□ 1.15
EDC4-202ENST00000536072 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
EDC4-202ENST00000536072 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.25■■□□□ 1.15
EDC4-202ENST00000536072 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
EDC4-202ENST00000536072 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.24■■□□□ 1.15
EDC4-202ENST00000536072 PPP2R1AP30153 589 aa22.24■■□□□ 1.15
EDC4-202ENST00000536072 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
EDC4-202ENST00000536072 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.23■■□□□ 1.15
EDC4-202ENST00000536072 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.2■■□□□ 1.15
EDC4-202ENST00000536072 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.2■■□□□ 1.15
EDC4-202ENST00000536072 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.19■■□□□ 1.14
EDC4-202ENST00000536072 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.19■■□□□ 1.14
EDC4-202ENST00000536072 REREQ9P2R6 1566 aa22.19■■□□□ 1.14
EDC4-202ENST00000536072 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.18■■□□□ 1.14
EDC4-202ENST00000536072 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.18■■□□□ 1.14
EDC4-202ENST00000536072 AGLP35573 1532 aa22.17■■□□□ 1.14
EDC4-202ENST00000536072 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
EDC4-202ENST00000536072 MLECQ14165 292 aa22.17■■□□□ 1.14
EDC4-202ENST00000536072 ZFYVE9O95405 1425 aa22.16■■□□□ 1.14
EDC4-202ENST00000536072 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.16■■□□□ 1.14
EDC4-202ENST00000536072 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.16■■□□□ 1.14
EDC4-202ENST00000536072 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.15■■□□□ 1.14
EDC4-202ENST00000536072 INSRP06213 1382 aa22.15■■□□□ 1.14
EDC4-202ENST00000536072 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.13■■□□□ 1.13
EDC4-202ENST00000536072 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.13■■□□□ 1.13
EDC4-202ENST00000536072 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.13■■□□□ 1.13
EDC4-202ENST00000536072 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
EDC4-202ENST00000536072 STK26Q9P289 416 aa22.12■■□□□ 1.13
EDC4-202ENST00000536072 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
EDC4-202ENST00000536072 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
EDC4-202ENST00000536072 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.11■■□□□ 1.13
EDC4-202ENST00000536072 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
EDC4-202ENST00000536072 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC4-202ENST00000536072 PDE3BQ13370 1112 aa22.09■■□□□ 1.13
EDC4-202ENST00000536072 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.08■■□□□ 1.13
EDC4-202ENST00000536072 EVC2Q86UK5 1308 aa22.08■■□□□ 1.13
EDC4-202ENST00000536072 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.08■■□□□ 1.12
EDC4-202ENST00000536072 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.07■■□□□ 1.12
EDC4-202ENST00000536072 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.07■■□□□ 1.12
EDC4-202ENST00000536072 CABP2Q9NPB3 220 aa22.04■■□□□ 1.12
EDC4-202ENST00000536072 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.03■■□□□ 1.12
EDC4-202ENST00000536072 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.02■■□□□ 1.12
EDC4-202ENST00000536072 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
EDC4-202ENST00000536072 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
EDC4-202ENST00000536072 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.01■■□□□ 1.11
EDC4-202ENST00000536072 PRAM1Q96QH2 718 aa22.01■■□□□ 1.11
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