RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535551.1

PGA3-202, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 3

Gene PGA3, Length 1,449 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-202ENST00000535551 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
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PGA3-202ENST00000535551 TRPM2O94759 1503 aa14.94□□□□□ -0.02
PGA3-202ENST00000535551 FOXD1Q16676 465 aa14.93□□□□□ -0.02
PGA3-202ENST00000535551 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa14.93□□□□□ -0.02
PGA3-202ENST00000535551 IQGAP1P46940 1657 aa14.93□□□□□ -0.02
PGA3-202ENST00000535551 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
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PGA3-202ENST00000535551 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.92□□□□□ -0.02
PGA3-202ENST00000535551 CLTCL1P53675 1640 aa14.91□□□□□ -0.02
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PGA3-202ENST00000535551 NEFLP07196 543 aa14.91□□□□□ -0.02
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PGA3-202ENST00000535551 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.89□□□□□ -0.03
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PGA3-202ENST00000535551 IQSEC2Q5JU85 1478 aa14.89□□□□□ -0.03
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PGA3-202ENST00000535551 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.03
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PGA3-202ENST00000535551 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.79□□□□□ -0.04
PGA3-202ENST00000535551 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.79□□□□□ -0.04
PGA3-202ENST00000535551 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
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PGA3-202ENST00000535551 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
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PGA3-202ENST00000535551 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa14.77□□□□□ -0.05
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PGA3-202ENST00000535551 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa14.76□□□□□ -0.05
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PGA3-202ENST00000535551 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
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PGA3-202ENST00000535551 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.73□□□□□ -0.05
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PGA3-202ENST00000535551 KCNA6P17658 529 aa14.69□□□□□ -0.06
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PGA3-202ENST00000535551 BCANQ96GW7 911 aa14.68□□□□□ -0.06
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PGA3-202ENST00000535551 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.67□□□□□ -0.06
PGA3-202ENST00000535551 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PGA3-202ENST00000535551 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.66□□□□□ -0.06
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PGA3-202ENST00000535551 LAMC1P11047 1609 aa14.64□□□□□ -0.07
PGA3-202ENST00000535551 RGL3Q3MIN7 710 aa14.64□□□□□ -0.07
PGA3-202ENST00000535551 STAC3Q96MF2 364 aa14.64□□□□□ -0.07
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PGA3-202ENST00000535551 PIK3C2GO75747 1445 aa14.62□□□□□ -0.07
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PGA3-202ENST00000535551 METP08581 1390 aa14.58□□□□□ -0.08
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PGA3-202ENST00000535551 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa14.57□□□□□ -0.08
PGA3-202ENST00000535551 MSH6P52701 1360 aa14.56□□□□□ -0.08
PGA3-202ENST00000535551 TECPR2O15040 1411 aa14.55□□□□□ -0.08
PGA3-202ENST00000535551 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PGA3-202ENST00000535551 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.54□□□□□ -0.08
PGA3-202ENST00000535551 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.54□□□□□ -0.08
PGA3-202ENST00000535551 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PGA3-202ENST00000535551 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.53□□□□□ -0.08
PGA3-202ENST00000535551 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.53□□□□□ -0.08
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