RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534197.5

GNPTG-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, human

TSL 3

Gene GNPTG, Length 420 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTG-209	ENST00000534197	ZFYVE9	O95405	1425 aa		33.92	■■■■□ 3.02
GNPTG-209	ENST00000534197	KCNA6	P17658	529 aa		33.91	■■■■□ 3.02
GNPTG-209	ENST00000534197	TMEM94	Q12767	1356 aa		33.9	■■■■□ 3.02
GNPTG-209	ENST00000534197	ITGAE	P38570	1179 aa		33.89	■■■■□ 3.02
GNPTG-209	ENST00000534197	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	33.89	■■■■□ 3.02
GNPTG-209	ENST00000534197	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		33.89	■■■■□ 3.02
GNPTG-209	ENST00000534197	NWD1	Q149M9	1564 aa		33.86	■■■■□ 3.01
GNPTG-209	ENST00000534197	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		33.85	■■■■□ 3.01
GNPTG-209	ENST00000534197	BCAN	Q96GW7	911 aa		33.83	■■■■□ 3.01
GNPTG-209	ENST00000534197	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	33.82	■■■■□ 3
GNPTG-209	ENST00000534197	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	33.81	■■■■□ 3
GNPTG-209	ENST00000534197	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		33.81	■■■■□ 3
GNPTG-209	ENST00000534197	NUP155	O75694	1391 aa		33.79	■■■■□ 3
GNPTG-209	ENST00000534197	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	33.79	■■■■□ 3
GNPTG-209	ENST00000534197	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
GNPTG-209	ENST00000534197	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	33.76	■■■□□ 2.99
GNPTG-209	ENST00000534197	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		33.76	■■■□□ 2.99
GNPTG-209	ENST00000534197	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
GNPTG-209	ENST00000534197	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		33.73	■■■□□ 2.99
GNPTG-209	ENST00000534197	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		33.7	■■■□□ 2.99
GNPTG-209	ENST00000534197	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	33.7	■■■□□ 2.99
GNPTG-209	ENST00000534197	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
GNPTG-209	ENST00000534197	TBX22	Q9Y458	520 aa		33.68	■■■□□ 2.98
GNPTG-209	ENST00000534197	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	33.66	■■■□□ 2.98
GNPTG-209	ENST00000534197	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		33.65	■■■□□ 2.98
GNPTG-209	ENST00000534197	MSH6	P52701	1360 aa		33.63	■■■□□ 2.97
GNPTG-209	ENST00000534197	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	33.62	■■■□□ 2.97
GNPTG-209	ENST00000534197	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	33.6	■■■□□ 2.97
GNPTG-209	ENST00000534197	DIP2A	Q14689	1571 aa		33.6	■■■□□ 2.97
GNPTG-209	ENST00000534197	SLAIN2	Q9P270	581 aa		33.58	■■■□□ 2.97
GNPTG-209	ENST00000534197	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		33.55	■■■□□ 2.96
GNPTG-209	ENST00000534197	PTPRU	Q92729	1446 aa		33.54	■■■□□ 2.96
GNPTG-209	ENST00000534197	NAIP	Q13075	1403 aa		33.53	■■■□□ 2.96
GNPTG-209	ENST00000534197	PIK3R4	Q99570	1358 aa		33.52	■■■□□ 2.96
GNPTG-209	ENST00000534197	PHLPP1	O60346	1717 aa		33.52	■■■□□ 2.96
GNPTG-209	ENST00000534197	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	33.52	■■■□□ 2.96
GNPTG-209	ENST00000534197	TRPM2	O94759	1503 aa		33.51	■■■□□ 2.95
GNPTG-209	ENST00000534197	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		33.51	■■■□□ 2.95
GNPTG-209	ENST00000534197	CLTCL1	P53675	1640 aa		33.5	■■■□□ 2.95
GNPTG-209	ENST00000534197	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		33.48	■■■□□ 2.95
GNPTG-209	ENST00000534197	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		33.47	■■■□□ 2.95
GNPTG-209	ENST00000534197	C14orf37	Q86TY3	774 aa		33.46	■■■□□ 2.95
GNPTG-209	ENST00000534197	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
GNPTG-209	ENST00000534197	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
GNPTG-209	ENST00000534197	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
GNPTG-209	ENST00000534197	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		33.42	■■■□□ 2.94
GNPTG-209	ENST00000534197	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		33.42	■■■□□ 2.94
GNPTG-209	ENST00000534197	KIF1B	O60333	1816 aa		33.4	■■■□□ 2.94
GNPTG-209	ENST00000534197	MET	P08581	1390 aa		33.39	■■■□□ 2.94
GNPTG-209	ENST00000534197	POTEA	Q6S8J7	498 aa		33.37	■■■□□ 2.93
GNPTG-209	ENST00000534197	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		33.37	■■■□□ 2.93
GNPTG-209	ENST00000534197	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.36	■■■□□ 2.93
GNPTG-209	ENST00000534197	ATF3	P18847	181 aa		33.36	■■■□□ 2.93
GNPTG-209	ENST00000534197	JCAD	Q9P266	1359 aa		33.35	■■■□□ 2.93
GNPTG-209	ENST00000534197	TRIM52	Q96A61	297 aa		33.32	■■■□□ 2.92
GNPTG-209	ENST00000534197	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
GNPTG-209	ENST00000534197	BRINP3	Q76B58	766 aa		33.27	■■■□□ 2.92
GNPTG-209	ENST00000534197	LRP6	O75581	1613 aa		33.26	■■■□□ 2.91
GNPTG-209	ENST00000534197	DCC	P43146	1447 aa		33.26	■■■□□ 2.91
GNPTG-209	ENST00000534197	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
GNPTG-209	ENST00000534197	MST1R	Q04912	1400 aa		33.23	■■■□□ 2.91
GNPTG-209	ENST00000534197	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
GNPTG-209	ENST00000534197	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		33.22	■■■□□ 2.91
GNPTG-209	ENST00000534197	SHPRH	Q149N8	1683 aa		33.22	■■■□□ 2.91
GNPTG-209	ENST00000534197	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		33.2	■■■□□ 2.91
GNPTG-209	ENST00000534197	FOXD1	Q16676	465 aa		33.19	■■■□□ 2.9
GNPTG-209	ENST00000534197	PPL	O60437	1756 aa		33.19	■■■□□ 2.9
GNPTG-209	ENST00000534197	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		33.18	■■■□□ 2.9
GNPTG-209	ENST00000534197	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		33.17	■■■□□ 2.9
GNPTG-209	ENST00000534197	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		33.16	■■■□□ 2.9
GNPTG-209	ENST00000534197	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
GNPTG-209	ENST00000534197	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
GNPTG-209	ENST00000534197	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		33.1	■■■□□ 2.89
GNPTG-209	ENST00000534197	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		33.1	■■■□□ 2.89
GNPTG-209	ENST00000534197	PTCH1	Q13635	1447 aa		33.09	■■■□□ 2.89
GNPTG-209	ENST00000534197	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33.08	■■■□□ 2.89
GNPTG-209	ENST00000534197	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
GNPTG-209	ENST00000534197	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
GNPTG-209	ENST00000534197	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
GNPTG-209	ENST00000534197	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
GNPTG-209	ENST00000534197	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		33.03	■■■□□ 2.88
GNPTG-209	ENST00000534197	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		33.02	■■■□□ 2.88
GNPTG-209	ENST00000534197	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		33.01	■■■□□ 2.87
GNPTG-209	ENST00000534197	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		33.01	■■■□□ 2.87
GNPTG-209	ENST00000534197	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.99	■■■□□ 2.87
GNPTG-209	ENST00000534197	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.99	■■■□□ 2.87
GNPTG-209	ENST00000534197	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.98	■■■□□ 2.87
GNPTG-209	ENST00000534197	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.97	■■■□□ 2.87
GNPTG-209	ENST00000534197	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
GNPTG-209	ENST00000534197	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
GNPTG-209	ENST00000534197	ORAI2	Q96SN7	254 aa		32.96	■■■□□ 2.87
GNPTG-209	ENST00000534197	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		32.96	■■■□□ 2.87
GNPTG-209	ENST00000534197	LAMC1	P11047	1609 aa		32.95	■■■□□ 2.87
GNPTG-209	ENST00000534197	AFF2	P51816	1311 aa		32.89	■■■□□ 2.86
GNPTG-209	ENST00000534197	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
GNPTG-209	ENST00000534197	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.85	■■■□□ 2.85
GNPTG-209	ENST00000534197	STK26	Q9P289	416 aa		32.85	■■■□□ 2.85
GNPTG-209	ENST00000534197	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		32.84	■■■□□ 2.85
GNPTG-209	ENST00000534197	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.84	■■■□□ 2.85
GNPTG-209	ENST00000534197	RXRB	P28702	533 aa		32.83	■■■□□ 2.85

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