RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZFYVE9O95405 1425 aa24.34■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.34■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EID1Q9Y6B2 187 aa24.31■■□□□ 1.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.29■■□□□ 1.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.27■■□□□ 1.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.26■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LTKP29376 864 aa24.24■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.24■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.22■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DIP2AQ14689 1571 aa24.22■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.22■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PPLO60437 1756 aa24.21■■□□□ 1.47
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IFT172Q9UG01 1749 aa24.19■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CPS1P31327 1500 aa24.19■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.18■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.17■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.17■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.17■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.15■■□□□ 1.46
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.13■■□□□ 1.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NWD1Q149M9 1564 aa24.13■■□□□ 1.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.11■■□□□ 1.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.09■■□□□ 1.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PIK3R4Q99570 1358 aa24.07■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MYOM2P54296 1465 aa24.05■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CERKQ8TCT0 537 aa24.04■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TBX22Q9Y458 520 aa24.04■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BCANQ96GW7 911 aa24.02■■□□□ 1.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LAMC1P11047 1609 aa24.01■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC26A8Q96RN1 970 aa24■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-211ENST00000533653 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.99■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PIK3C2GO75747 1445 aa23.98■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ALKQ9UM73 1620 aa23.98■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KCNA6P17658 529 aa23.97■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-211ENST00000533653 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RGL3Q3MIN7 710 aa23.95■■□□□ 1.42
GMDS-AS1-211ENST00000533653 STAC3Q96MF2 364 aa23.95■■□□□ 1.42
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.94■■□□□ 1.42
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FBXO41Q8TF61 875 aa23.89■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.89■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.89■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.89■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.88■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PTPRUQ92729 1446 aa23.88■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-211ENST00000533653 METP08581 1390 aa23.88■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PTCH1Q13635 1447 aa23.87■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.86■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.85■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.85■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMEM94Q12767 1356 aa23.85■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TECPR2O15040 1411 aa23.83■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.82■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.79■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADGRB1O14514 1584 aa23.78■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MSH6P52701 1360 aa23.77■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DCCP43146 1447 aa23.76■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.76■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.76■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TOM1O60784 492 aa23.75■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-211ENST00000533653 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ABCC11Q96J66 1382 aa23.74■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DLC1Q96QB1 1528 aa23.74■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.73■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.73■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.72■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.72■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.71■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.69■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TONSLQ96HA7 1378 aa23.68■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-211ENST00000533653 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.68■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.68■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.67■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NEUROD1Q13562 356 aa23.67■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.67■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SIRT1Q96EB6 747 aa23.66■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C14orf37Q86TY3 774 aa23.65■■□□□ 1.38
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