RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533080.5

TSPAN18-211, Transcript of tetraspanin 18, humanhuman

TSL 3

Gene TSPAN18, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18-211ENST00000533080 NOS1P29475 1434 aa30.38■■■□□ 2.45
TSPAN18-211ENST00000533080 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
TSPAN18-211ENST00000533080 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.31■■■□□ 2.44
TSPAN18-211ENST00000533080 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
TSPAN18-211ENST00000533080 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.3■■■□□ 2.44
TSPAN18-211ENST00000533080 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
TSPAN18-211ENST00000533080 PHLPP1O60346 1717 aa30.29■■■□□ 2.44
TSPAN18-211ENST00000533080 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.29■■■□□ 2.44
TSPAN18-211ENST00000533080 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.28■■■□□ 2.44
TSPAN18-211ENST00000533080 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.25■■■□□ 2.43
TSPAN18-211ENST00000533080 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.25■■■□□ 2.43
TSPAN18-211ENST00000533080 TBX22Q9Y458 520 aa30.23■■■□□ 2.43
TSPAN18-211ENST00000533080 ZFYVE9O95405 1425 aa30.22■■■□□ 2.43
TSPAN18-211ENST00000533080 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
TSPAN18-211ENST00000533080 C14orf37Q86TY3 774 aa30.22■■■□□ 2.43
TSPAN18-211ENST00000533080 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.22■■■□□ 2.43
TSPAN18-211ENST00000533080 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
TSPAN18-211ENST00000533080 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPAN18-211ENST00000533080 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
TSPAN18-211ENST00000533080 ADGRL2O95490 1459 aa30.19■■■□□ 2.42
TSPAN18-211ENST00000533080 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.19■■■□□ 2.42
TSPAN18-211ENST00000533080 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.16■■■□□ 2.42
TSPAN18-211ENST00000533080 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
TSPAN18-211ENST00000533080 ATF3P18847 181 aa30.15■■■□□ 2.42
TSPAN18-211ENST00000533080 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.15■■■□□ 2.42
TSPAN18-211ENST00000533080 PIK3R4Q99570 1358 aa30.14■■■□□ 2.41
TSPAN18-211ENST00000533080 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
TSPAN18-211ENST00000533080 DIP2AQ14689 1571 aa30.1■■■□□ 2.41
TSPAN18-211ENST00000533080 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.1■■■□□ 2.41
TSPAN18-211ENST00000533080 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
TSPAN18-211ENST00000533080 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.09■■■□□ 2.41
TSPAN18-211ENST00000533080 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
TSPAN18-211ENST00000533080 LRP6O75581 1613 aa30.07■■■□□ 2.4
TSPAN18-211ENST00000533080 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP30.07■■■□□ 2.4
TSPAN18-211ENST00000533080 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
TSPAN18-211ENST00000533080 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.06■■■□□ 2.4
TSPAN18-211ENST00000533080 TRIM52Q96A61 297 aa30.05■■■□□ 2.4
TSPAN18-211ENST00000533080 RXRBP28702 533 aa30.04■■■□□ 2.4
TSPAN18-211ENST00000533080 SHPRHQ149N8 1683 aa30.04■■■□□ 2.4
TSPAN18-211ENST00000533080 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.04■■■□□ 2.4
TSPAN18-211ENST00000533080 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
TSPAN18-211ENST00000533080 DCCP43146 1447 aa29.99■■■□□ 2.39
TSPAN18-211ENST00000533080 TRPM2O94759 1503 aa29.99■■■□□ 2.39
TSPAN18-211ENST00000533080 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
TSPAN18-211ENST00000533080 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.98■■■□□ 2.39
TSPAN18-211ENST00000533080 BRINP3Q76B58 766 aa29.97■■■□□ 2.39
TSPAN18-211ENST00000533080 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
TSPAN18-211ENST00000533080 UNC13BO14795 1591 aa29.95■■■□□ 2.39
TSPAN18-211ENST00000533080 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
TSPAN18-211ENST00000533080 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
TSPAN18-211ENST00000533080 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
TSPAN18-211ENST00000533080 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.9■■■□□ 2.38
TSPAN18-211ENST00000533080 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
TSPAN18-211ENST00000533080 E9PCH4 1651 aa29.88■■■□□ 2.37
TSPAN18-211ENST00000533080 AFF2P51816 1311 aa29.88■■■□□ 2.37
TSPAN18-211ENST00000533080 ROCK1Q13464 1354 aa29.87■■■□□ 2.37
TSPAN18-211ENST00000533080 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.86■■■□□ 2.37
TSPAN18-211ENST00000533080 PTPRUQ92729 1446 aa29.86■■■□□ 2.37
TSPAN18-211ENST00000533080 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.85■■■□□ 2.37
TSPAN18-211ENST00000533080 MST1RQ04912 1400 aa29.82■■■□□ 2.36
TSPAN18-211ENST00000533080 NUP155O75694 1391 aa29.82■■■□□ 2.36
TSPAN18-211ENST00000533080 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
TSPAN18-211ENST00000533080 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.79■■■□□ 2.36
TSPAN18-211ENST00000533080 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
TSPAN18-211ENST00000533080 C8orf37Q96NL8 207 aa29.78■■■□□ 2.36
TSPAN18-211ENST00000533080 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
TSPAN18-211ENST00000533080 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.78■■■□□ 2.36
TSPAN18-211ENST00000533080 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
TSPAN18-211ENST00000533080 NGLY1Q96IV0 654 aa29.75■■■□□ 2.35
TSPAN18-211ENST00000533080 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.75■■■□□ 2.35
TSPAN18-211ENST00000533080 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.74■■■□□ 2.35
TSPAN18-211ENST00000533080 FOXD1Q16676 465 aa29.73■■■□□ 2.35
TSPAN18-211ENST00000533080 RGS12O14924 1447 aa29.71■■■□□ 2.35
TSPAN18-211ENST00000533080 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.71■■■□□ 2.35
TSPAN18-211ENST00000533080 METP08581 1390 aa29.7■■■□□ 2.35
TSPAN18-211ENST00000533080 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.65■■■□□ 2.34
TSPAN18-211ENST00000533080 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.63■■■□□ 2.33
TSPAN18-211ENST00000533080 ADAMTS2O95450 1211 aa29.63■■■□□ 2.33
TSPAN18-211ENST00000533080 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
TSPAN18-211ENST00000533080 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.61■■■□□ 2.33
TSPAN18-211ENST00000533080 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
TSPAN18-211ENST00000533080 USP21Q9UK80 565 aa29.59■■■□□ 2.33
TSPAN18-211ENST00000533080 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.57■■■□□ 2.32
TSPAN18-211ENST00000533080 PTCH1Q13635 1447 aa29.57■■■□□ 2.32
TSPAN18-211ENST00000533080 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
TSPAN18-211ENST00000533080 ITGAEP38570 1179 aa29.57■■■□□ 2.32
TSPAN18-211ENST00000533080 LAMC1P11047 1609 aa29.56■■■□□ 2.32
TSPAN18-211ENST00000533080 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.55■■■□□ 2.32
TSPAN18-211ENST00000533080 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
TSPAN18-211ENST00000533080 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
TSPAN18-211ENST00000533080 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.52■■■□□ 2.32
TSPAN18-211ENST00000533080 CCDC125Q86Z20 511 aa29.5■■■□□ 2.31
TSPAN18-211ENST00000533080 ORAI2Q96SN7 254 aa29.49■■■□□ 2.31
TSPAN18-211ENST00000533080 CLTCL1P53675 1640 aa29.48■■■□□ 2.31
TSPAN18-211ENST00000533080 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.47■■■□□ 2.31
TSPAN18-211ENST00000533080 HFM1A2PYH4 1435 aa29.46■■■□□ 2.31
TSPAN18-211ENST00000533080 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.46■■■□□ 2.31
TSPAN18-211ENST00000533080 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.45■■■□□ 2.31
TSPAN18-211ENST00000533080 ATRNO75882 1429 aa29.45■■■□□ 2.31
TSPAN18-211ENST00000533080 KIF1BO60333 1816 aa29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 476.4 ms