RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532557.5

MDP1-208, Transcript of magnesium dependent phosphatase 1, human

TSL 2

Gene MDP1, Length 562 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDP1-208	ENST00000532557	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MDP1-208	ENST00000532557	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
MDP1-208	ENST00000532557	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MDP1-208	ENST00000532557	LAMC1	P11047	1609 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MDP1-208	ENST00000532557	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MDP1-208	ENST00000532557	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MDP1-208	ENST00000532557	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MDP1-208	ENST00000532557	PIK3C2G	O75747	1445 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MDP1-208	ENST00000532557	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MDP1-208	ENST00000532557	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MDP1-208	ENST00000532557	RGL3	Q3MIN7	710 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MDP1-208	ENST00000532557	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MDP1-208	ENST00000532557	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MDP1-208	ENST00000532557	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		13.03	□□□□□ -0.32
MDP1-208	ENST00000532557	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
MDP1-208	ENST00000532557	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
MDP1-208	ENST00000532557	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
MDP1-208	ENST00000532557	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	13.03	□□□□□ -0.32
MDP1-208	ENST00000532557	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		13.03	□□□□□ -0.32
MDP1-208	ENST00000532557	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		13.03	□□□□□ -0.32
MDP1-208	ENST00000532557	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.32
MDP1-208	ENST00000532557	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
MDP1-208	ENST00000532557	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
MDP1-208	ENST00000532557	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
MDP1-208	ENST00000532557	DIP2A	Q14689	1571 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MDP1-208	ENST00000532557	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MDP1-208	ENST00000532557	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MDP1-208	ENST00000532557	ADGRB1	O14514	1584 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MDP1-208	ENST00000532557	IQGAP1	P46940	1657 aa		13	□□□□□ -0.33
MDP1-208	ENST00000532557	MED14	O60244	1454 aa		13	□□□□□ -0.33
MDP1-208	ENST00000532557	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		13	□□□□□ -0.33
MDP1-208	ENST00000532557	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
MDP1-208	ENST00000532557	ALK	Q9UM73	1620 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MDP1-208	ENST00000532557	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MDP1-208	ENST00000532557	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		12.97	□□□□□ -0.33
MDP1-208	ENST00000532557	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		12.97	□□□□□ -0.33
MDP1-208	ENST00000532557	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
MDP1-208	ENST00000532557	EID1	Q9Y6B2	187 aa		12.96	□□□□□ -0.33
MDP1-208	ENST00000532557	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		12.96	□□□□□ -0.34
MDP1-208	ENST00000532557	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
MDP1-208	ENST00000532557	LTK	P29376	864 aa		12.95	□□□□□ -0.34
MDP1-208	ENST00000532557	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		12.95	□□□□□ -0.34
MDP1-208	ENST00000532557	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		12.93	□□□□□ -0.34
MDP1-208	ENST00000532557	PIK3R4	Q99570	1358 aa		12.93	□□□□□ -0.34
MDP1-208	ENST00000532557	DLC1	Q96QB1	1528 aa		12.93	□□□□□ -0.34
MDP1-208	ENST00000532557	TECPR2	O15040	1411 aa		12.92	□□□□□ -0.34
MDP1-208	ENST00000532557	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		12.92	□□□□□ -0.34
MDP1-208	ENST00000532557	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
MDP1-208	ENST00000532557	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
MDP1-208	ENST00000532557	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MDP1-208	ENST00000532557	CPS1	P31327	1500 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MDP1-208	ENST00000532557	STRC	Q7RTU9	1775 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MDP1-208	ENST00000532557	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
MDP1-208	ENST00000532557	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
MDP1-208	ENST00000532557	USP47	Q96K76	1375 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MDP1-208	ENST00000532557	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MDP1-208	ENST00000532557	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
MDP1-208	ENST00000532557	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MDP1-208	ENST00000532557	TBX22	Q9Y458	520 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MDP1-208	ENST00000532557	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
MDP1-208	ENST00000532557	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MDP1-208	ENST00000532557	NWD1	Q149M9	1564 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MDP1-208	ENST00000532557	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
MDP1-208	ENST00000532557	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
MDP1-208	ENST00000532557	MET	P08581	1390 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MDP1-208	ENST00000532557	ABCC11	Q96J66	1382 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MDP1-208	ENST00000532557	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	12.87	□□□□□ -0.35
MDP1-208	ENST00000532557	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
MDP1-208	ENST00000532557	PTCH1	Q13635	1447 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MDP1-208	ENST00000532557	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MDP1-208	ENST00000532557	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MDP1-208	ENST00000532557	SIRT1	Q96EB6	747 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MDP1-208	ENST00000532557	PTPRU	Q92729	1446 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MDP1-208	ENST00000532557	HSPA2	P54652	639 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MDP1-208	ENST00000532557	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
MDP1-208	ENST00000532557	ADGRB2	O60241	1585 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MDP1-208	ENST00000532557	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
MDP1-208	ENST00000532557	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MDP1-208	ENST00000532557	SLC24A1	O60721	1099 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MDP1-208	ENST00000532557	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MDP1-208	ENST00000532557	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MDP1-208	ENST00000532557	TESK2	Q96S53	571 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MDP1-208	ENST00000532557	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MDP1-208	ENST00000532557	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
MDP1-208	ENST00000532557	BCAN	Q96GW7	911 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MDP1-208	ENST00000532557	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MDP1-208	ENST00000532557	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		12.77	□□□□□ -0.36
MDP1-208	ENST00000532557	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
MDP1-208	ENST00000532557	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MDP1-208	ENST00000532557	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MDP1-208	ENST00000532557	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MDP1-208	ENST00000532557	KCNA6	P17658	529 aa		12.76	□□□□□ -0.37
MDP1-208	ENST00000532557	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		12.75	□□□□□ -0.37
MDP1-208	ENST00000532557	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
MDP1-208	ENST00000532557	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		12.75	□□□□□ -0.37
MDP1-208	ENST00000532557	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		12.75	□□□□□ -0.37
MDP1-208	ENST00000532557	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
MDP1-208	ENST00000532557	PRAM1	Q96QH2	718 aa		12.74	□□□□□ -0.37
MDP1-208	ENST00000532557	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		12.74	□□□□□ -0.37
MDP1-208	ENST00000532557	CCDC7	Q96M83	1385 aa		12.73	□□□□□ -0.37

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