RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530500.5

ATG13-216, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG13, Length 2,030 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-216ENST00000530500 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.72■■□□□ 1.07
ATG13-216ENST00000530500 IFT172Q9UG01 1749 aa21.72■■□□□ 1.07
ATG13-216ENST00000530500 INSRP06213 1382 aa21.72■■□□□ 1.07
ATG13-216ENST00000530500 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
ATG13-216ENST00000530500 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.71■■□□□ 1.07
ATG13-216ENST00000530500 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.7■■□□□ 1.06
ATG13-216ENST00000530500 SYNMO15061 1565 aa21.69■■□□□ 1.06
ATG13-216ENST00000530500 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.68■■□□□ 1.06
ATG13-216ENST00000530500 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
ATG13-216ENST00000530500 ABCA6Q8N139 1617 aa21.68■■□□□ 1.06
ATG13-216ENST00000530500 ADGRB3O60242 1522 aa21.67■■□□□ 1.06
ATG13-216ENST00000530500 NPATQ14207 1427 aa21.67■■□□□ 1.06
ATG13-216ENST00000530500 GGT6Q6P531 493 aa21.67■■□□□ 1.06
ATG13-216ENST00000530500 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.67■■□□□ 1.06
ATG13-216ENST00000530500 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.66■■□□□ 1.06
ATG13-216ENST00000530500 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.65■■□□□ 1.06
ATG13-216ENST00000530500 MROH2AA6NES4 1674 aa21.65■■□□□ 1.06
ATG13-216ENST00000530500 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.65■■□□□ 1.06
ATG13-216ENST00000530500 ABCC3O15438 1527 aa21.64■■□□□ 1.05
ATG13-216ENST00000530500 PDE3BQ13370 1112 aa21.63■■□□□ 1.05
ATG13-216ENST00000530500 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.63■■□□□ 1.05
ATG13-216ENST00000530500 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ATG13-216ENST00000530500 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.62■■□□□ 1.05
ATG13-216ENST00000530500 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.61■■□□□ 1.05
ATG13-216ENST00000530500 RAPGEF3O95398 923 aa21.6■■□□□ 1.05
ATG13-216ENST00000530500 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.6■■□□□ 1.05
ATG13-216ENST00000530500 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.6■■□□□ 1.05
ATG13-216ENST00000530500 RICTORQ6R327 1708 aa21.59■■□□□ 1.05
ATG13-216ENST00000530500 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.59■■□□□ 1.05
ATG13-216ENST00000530500 NOS1P29475 1434 aa21.59■■□□□ 1.05
ATG13-216ENST00000530500 GLI2P10070 1586 aa21.59■■□□□ 1.05
ATG13-216ENST00000530500 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.59■■□□□ 1.05
ATG13-216ENST00000530500 PPLO60437 1756 aa21.59■■□□□ 1.05
ATG13-216ENST00000530500 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
ATG13-216ENST00000530500 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.58■■□□□ 1.05
ATG13-216ENST00000530500 MYOM1P52179 1685 aa21.58■■□□□ 1.05
ATG13-216ENST00000530500 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
ATG13-216ENST00000530500 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
ATG13-216ENST00000530500 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
ATG13-216ENST00000530500 PIK3C2GO75747 1445 aa21.56■■□□□ 1.04
ATG13-216ENST00000530500 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.56■■□□□ 1.04
ATG13-216ENST00000530500 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
ATG13-216ENST00000530500 ERVK-7P63135 1459 aa21.55■■□□□ 1.04
ATG13-216ENST00000530500 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ATG13-216ENST00000530500 PPP2R1AP30153 589 aa21.53■■□□□ 1.04
ATG13-216ENST00000530500 PIK3C2BO00750 1634 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG13-216ENST00000530500 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ATG13-216ENST00000530500 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ATG13-216ENST00000530500 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG13-216ENST00000530500 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG13-216ENST00000530500 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG13-216ENST00000530500 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ATG13-216ENST00000530500 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG13-216ENST00000530500 ADGRB1O14514 1584 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG13-216ENST00000530500 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
ATG13-216ENST00000530500 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG13-216ENST00000530500 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG13-216ENST00000530500 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG13-216ENST00000530500 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG13-216ENST00000530500 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
ATG13-216ENST00000530500 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.43■■□□□ 1.02
ATG13-216ENST00000530500 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.43■■□□□ 1.02
ATG13-216ENST00000530500 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.43■■□□□ 1.02
ATG13-216ENST00000530500 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ATG13-216ENST00000530500 ZFYVE9O95405 1425 aa21.42■■□□□ 1.02
ATG13-216ENST00000530500 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.42■■□□□ 1.02
ATG13-216ENST00000530500 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.42■■□□□ 1.02
ATG13-216ENST00000530500 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.42■■□□□ 1.02
ATG13-216ENST00000530500 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ATG13-216ENST00000530500 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG13-216ENST00000530500 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG13-216ENST00000530500 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG13-216ENST00000530500 DIP2BQ9P265 1576 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG13-216ENST00000530500 IDI1Q13907 227 aa21.39■■□□□ 1.02
ATG13-216ENST00000530500 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG13-216ENST00000530500 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG13-216ENST00000530500 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG13-216ENST00000530500 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.36■■□□□ 1.01
ATG13-216ENST00000530500 REREQ9P2R6 1566 aa21.35■■□□□ 1.01
ATG13-216ENST00000530500 EVC2Q86UK5 1308 aa21.34■■□□□ 1.01
ATG13-216ENST00000530500 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
ATG13-216ENST00000530500 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.33■■□□□ 1
ATG13-216ENST00000530500 NGEFQ8N5V2 710 aa21.33■■□□□ 1
ATG13-216ENST00000530500 AGLP35573 1532 aa21.32■■□□□ 1
ATG13-216ENST00000530500 ZNF521Q96K83 1311 aa21.31■■□□□ 1
ATG13-216ENST00000530500 USP32Q8NFA0 1604 aa21.31■■□□□ 1
ATG13-216ENST00000530500 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.31■■□□□ 1
ATG13-216ENST00000530500 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
ATG13-216ENST00000530500 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.3■■□□□ 1
ATG13-216ENST00000530500 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.29■■□□□ 1
ATG13-216ENST00000530500 GOLGA2Q08379 1002 aa21.29■■□□□ 1
ATG13-216ENST00000530500 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
ATG13-216ENST00000530500 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.29■■□□□ 1
ATG13-216ENST00000530500 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.29■■□□□ 1
ATG13-216ENST00000530500 TSPOAP1O95153 1857 aa21.28■■□□□ 1
ATG13-216ENST00000530500 MORC1Q86VD1 984 aa21.27■■□□□ 1
ATG13-216ENST00000530500 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.27■□□□□ 0.99
ATG13-216ENST00000530500 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.26■□□□□ 0.99
ATG13-216ENST00000530500 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.25■□□□□ 0.99
ATG13-216ENST00000530500 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms