RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529481.1

LRP5-204, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene LRP5, Length 551 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-204ENST00000529481 ATP10BO94823 1461 aa15.17■□□□□ 0.02
LRP5-204ENST00000529481 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
LRP5-204ENST00000529481 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
LRP5-204ENST00000529481 PKD2Q13563 968 aa15.16■□□□□ 0.02
LRP5-204ENST00000529481 TMC2Q8TDI7 906 aa15.16■□□□□ 0.02
LRP5-204ENST00000529481 RICTORQ6R327 1708 aa15.16■□□□□ 0.02
LRP5-204ENST00000529481 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.029e-6■■■□□ 18.8
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LRP5-204ENST00000529481 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.09■□□□□ 0.01
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LRP5-204ENST00000529481 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15□□□□□ -0.01
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LRP5-204ENST00000529481 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.98□□□□□ -0.01
LRP5-204ENST00000529481 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
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LRP5-204ENST00000529481 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
LRP5-204ENST00000529481 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
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LRP5-204ENST00000529481 NCOA1Q15788 1441 aa14.93□□□□□ -0.02
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LRP5-204ENST00000529481 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LRP5-204ENST00000529481 SAMD9Q5K651 1589 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP5-204ENST00000529481 C3P01024 1663 aa14.91□□□□□ -0.02
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LRP5-204ENST00000529481 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.83□□□□□ -0.04
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LRP5-204ENST00000529481 AGLP35573 1532 aa14.76□□□□□ -0.05
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LRP5-204ENST00000529481 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.74□□□□□ -0.05
LRP5-204ENST00000529481 MAP3K1Q13233 1512 aa14.74□□□□□ -0.05
LRP5-204ENST00000529481 PLA2R1Q13018 1463 aa14.74□□□□□ -0.05
LRP5-204ENST00000529481 STAC3Q96MF2 364 aa14.72□□□□□ -0.05
LRP5-204ENST00000529481 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LRP5-204ENST00000529481 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LRP5-204ENST00000529481 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.71□□□□□ -0.05
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