RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527006.1

TSTA3-205, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 412 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-205ENST00000527006 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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TSTA3-205ENST00000527006 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.48■□□□□ 0.87
TSTA3-205ENST00000527006 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.47■□□□□ 0.87
TSTA3-205ENST00000527006 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.47■□□□□ 0.87
TSTA3-205ENST00000527006 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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TSTA3-205ENST00000527006 SLIT1O75093 1534 aa20.43■□□□□ 0.86
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TSTA3-205ENST00000527006 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.41■□□□□ 0.86
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TSTA3-205ENST00000527006 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
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TSTA3-205ENST00000527006 MED14O60244 1454 aa20.27■□□□□ 0.84
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TSTA3-205ENST00000527006 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.07■□□□□ 0.8
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TSTA3-205ENST00000527006 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
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TSTA3-205ENST00000527006 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.03■□□□□ 0.8
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TSTA3-205ENST00000527006 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
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TSTA3-205ENST00000527006 EVC2Q86UK5 1308 aa19.99■□□□□ 0.79
TSTA3-205ENST00000527006 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
TSTA3-205ENST00000527006 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.79
TSTA3-205ENST00000527006 C14orf37Q86TY3 774 aa19.98■□□□□ 0.79
TSTA3-205ENST00000527006 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
TSTA3-205ENST00000527006 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa19.98■□□□□ 0.79
TSTA3-205ENST00000527006 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
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