RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 MSH6P52701 1360 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRU-209ENST00000526080 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRU-209ENST00000526080 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRU-209ENST00000526080 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PTPRU-209ENST00000526080 JCADQ9P266 1359 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRU-209ENST00000526080 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRU-209ENST00000526080 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRU-209ENST00000526080 SLAIN2Q9P270 581 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-209ENST00000526080 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-209ENST00000526080 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRU-209ENST00000526080 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRU-209ENST00000526080 LRP6O75581 1613 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRU-209ENST00000526080 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-209ENST00000526080 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-209ENST00000526080 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-209ENST00000526080 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-209ENST00000526080 SHPRHQ149N8 1683 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-209ENST00000526080 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-209ENST00000526080 DIP2AQ14689 1571 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-209ENST00000526080 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRU-209ENST00000526080 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRU-209ENST00000526080 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRU-209ENST00000526080 UNC13BO14795 1591 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-209ENST00000526080 TBX22Q9Y458 520 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-209ENST00000526080 BCANQ96GW7 911 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-209ENST00000526080 PIK3R4Q99570 1358 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-209ENST00000526080 E9PCH4 1651 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-209ENST00000526080 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-209ENST00000526080 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-209ENST00000526080 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-209ENST00000526080 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-209ENST00000526080 APLP2Q06481 763 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-209ENST00000526080 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-209ENST00000526080 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-209ENST00000526080 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-209ENST00000526080 TRPM2O94759 1503 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRU-209ENST00000526080 PTPRUQ92729 1446 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-209ENST00000526080 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-209ENST00000526080 DCCP43146 1447 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-209ENST00000526080 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-209ENST00000526080 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-209ENST00000526080 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-209ENST00000526080 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-209ENST00000526080 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-209ENST00000526080 ATF3P18847 181 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-209ENST00000526080 BRINP3Q76B58 766 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-209ENST00000526080 C14orf37Q86TY3 774 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-209ENST00000526080 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-209ENST00000526080 TRIM52Q96A61 297 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-209ENST00000526080 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-209ENST00000526080 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-209ENST00000526080 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-209ENST00000526080 MST1RQ04912 1400 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-209ENST00000526080 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-209ENST00000526080 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-209ENST00000526080 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRU-209ENST00000526080 RXRBP28702 533 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRU-209ENST00000526080 ROCK1Q13464 1354 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-209ENST00000526080 AFF2P51816 1311 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-209ENST00000526080 RGS12O14924 1447 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-209ENST00000526080 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-209ENST00000526080 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-209ENST00000526080 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-209ENST00000526080 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-209ENST00000526080 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-209ENST00000526080 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-209ENST00000526080 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-209ENST00000526080 LAMC1P11047 1609 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-209ENST00000526080 METP08581 1390 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRU-209ENST00000526080 EP400Q96L91 3159 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-209ENST00000526080 NUP155O75694 1391 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-209ENST00000526080 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-209ENST00000526080 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRU-209ENST00000526080 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
PTPRU-209ENST00000526080 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
PTPRU-209ENST00000526080 C8orf37Q96NL8 207 aa21.32■■□□□ 1
PTPRU-209ENST00000526080 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.32■■□□□ 1
PTPRU-209ENST00000526080 CLTCL1P53675 1640 aa21.31■■□□□ 1
PTPRU-209ENST00000526080 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PTPRU-209ENST00000526080 PTCH1Q13635 1447 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-209ENST00000526080 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-209ENST00000526080 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PTPRU-209ENST00000526080 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
PTPRU-209ENST00000526080 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRU-209ENST00000526080 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRU-209ENST00000526080 ATRNO75882 1429 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRU-209ENST00000526080 ADAMTS2O95450 1211 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRU-209ENST00000526080 NGLY1Q96IV0 654 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRU-209ENST00000526080 KIF1BO60333 1816 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRU-209ENST00000526080 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
PTPRU-209ENST00000526080 MYOM2P54296 1465 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRU-209ENST00000526080 ORAI2Q96SN7 254 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRU-209ENST00000526080 USP21Q9UK80 565 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRU-209ENST00000526080 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
PTPRU-209ENST00000526080 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRU-209ENST00000526080 PXDNQ92626 1479 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRU-209ENST00000526080 HFM1A2PYH4 1435 aa21.15■□□□□ 0.98
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