RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523077.1

HSF4-223, Transcript of heat shock transcription factor 4, human

TSL 2

Gene HSF4, Length 828 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HSF4-223	ENST00000523077	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		28.19	■■■□□ 2.1
HSF4-223	ENST00000523077	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
HSF4-223	ENST00000523077	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
HSF4-223	ENST00000523077	TMEM94	Q12767	1356 aa		28.18	■■■□□ 2.1
HSF4-223	ENST00000523077	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		28.18	■■■□□ 2.1
HSF4-223	ENST00000523077	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		28.17	■■■□□ 2.1
HSF4-223	ENST00000523077	ITGAE	P38570	1179 aa		28.16	■■■□□ 2.1
HSF4-223	ENST00000523077	NWD1	Q149M9	1564 aa		28.13	■■■□□ 2.09
HSF4-223	ENST00000523077	BCAN	Q96GW7	911 aa		28.1	■■■□□ 2.09
HSF4-223	ENST00000523077	ZFYVE9	O95405	1425 aa		28.09	■■■□□ 2.09
HSF4-223	ENST00000523077	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
HSF4-223	ENST00000523077	KCNA6	P17658	529 aa		28.09	■■■□□ 2.09
HSF4-223	ENST00000523077	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
HSF4-223	ENST00000523077	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
HSF4-223	ENST00000523077	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		28.09	■■■□□ 2.09
HSF4-223	ENST00000523077	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
HSF4-223	ENST00000523077	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		28.06	■■■□□ 2.08
HSF4-223	ENST00000523077	PHLPP1	O60346	1717 aa		28.06	■■■□□ 2.08
HSF4-223	ENST00000523077	NUP155	O75694	1391 aa		28.04	■■■□□ 2.08
HSF4-223	ENST00000523077	NAIP	Q13075	1403 aa		28.01	■■■□□ 2.07
HSF4-223	ENST00000523077	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		28	■■■□□ 2.07
HSF4-223	ENST00000523077	MSH6	P52701	1360 aa		27.99	■■■□□ 2.07
HSF4-223	ENST00000523077	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
HSF4-223	ENST00000523077	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
HSF4-223	ENST00000523077	CLTCL1	P53675	1640 aa		27.98	■■■□□ 2.07
HSF4-223	ENST00000523077	KIF1B	O60333	1816 aa		27.97	■■■□□ 2.07
HSF4-223	ENST00000523077	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		27.95	■■■□□ 2.06
HSF4-223	ENST00000523077	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		27.95	■■■□□ 2.06
HSF4-223	ENST00000523077	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
HSF4-223	ENST00000523077	POTEA	Q6S8J7	498 aa		27.94	■■■□□ 2.06
HSF4-223	ENST00000523077	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
HSF4-223	ENST00000523077	TRPM2	O94759	1503 aa		27.91	■■■□□ 2.06
HSF4-223	ENST00000523077	DIP2A	Q14689	1571 aa		27.9	■■■□□ 2.06
HSF4-223	ENST00000523077	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
HSF4-223	ENST00000523077	HFM1	A2PYH4	1435 aa		27.9	■■■□□ 2.06
HSF4-223	ENST00000523077	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		27.88	■■■□□ 2.05
HSF4-223	ENST00000523077	SLAIN2	Q9P270	581 aa		27.88	■■■□□ 2.05
HSF4-223	ENST00000523077	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
HSF4-223	ENST00000523077	C14orf37	Q86TY3	774 aa		27.86	■■■□□ 2.05
HSF4-223	ENST00000523077	JCAD	Q9P266	1359 aa		27.83	■■■□□ 2.05
HSF4-223	ENST00000523077	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		27.82	■■■□□ 2.04
HSF4-223	ENST00000523077	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
HSF4-223	ENST00000523077	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		27.82	■■■□□ 2.04
HSF4-223	ENST00000523077	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
HSF4-223	ENST00000523077	LRP6	O75581	1613 aa		27.79	■■■□□ 2.04
HSF4-223	ENST00000523077	TBX22	Q9Y458	520 aa		27.78	■■■□□ 2.04
HSF4-223	ENST00000523077	PPL	O60437	1756 aa		27.78	■■■□□ 2.04
HSF4-223	ENST00000523077	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	27.77	■■■□□ 2.04
HSF4-223	ENST00000523077	SHPRH	Q149N8	1683 aa		27.75	■■■□□ 2.03
HSF4-223	ENST00000523077	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
HSF4-223	ENST00000523077	PTPRU	Q92729	1446 aa		27.73	■■■□□ 2.03
HSF4-223	ENST00000523077	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
HSF4-223	ENST00000523077	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		27.71	■■■□□ 2.03
HSF4-223	ENST00000523077	ATF3	P18847	181 aa		27.7	■■■□□ 2.02
HSF4-223	ENST00000523077	IFT172	Q9UG01	1749 aa		27.7	■■■□□ 2.02
HSF4-223	ENST00000523077	PIK3R4	Q99570	1358 aa		27.69	■■■□□ 2.02
HSF4-223	ENST00000523077	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		27.68	■■■□□ 2.02
HSF4-223	ENST00000523077	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		27.67	■■■□□ 2.02
HSF4-223	ENST00000523077	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		27.67	■■■□□ 2.02
HSF4-223	ENST00000523077	TRIM52	Q96A61	297 aa		27.66	■■■□□ 2.02
HSF4-223	ENST00000523077	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		27.66	■■■□□ 2.02
HSF4-223	ENST00000523077	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		27.65	■■■□□ 2.02
HSF4-223	ENST00000523077	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		27.62	■■■□□ 2.01
HSF4-223	ENST00000523077	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
HSF4-223	ENST00000523077	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		27.62	■■■□□ 2.01
HSF4-223	ENST00000523077	BRINP3	Q76B58	766 aa		27.61	■■■□□ 2.01
HSF4-223	ENST00000523077	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
HSF4-223	ENST00000523077	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
HSF4-223	ENST00000523077	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
HSF4-223	ENST00000523077	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
HSF4-223	ENST00000523077	MET	P08581	1390 aa		27.6	■■■□□ 2.01
HSF4-223	ENST00000523077	FOXD1	Q16676	465 aa		27.56	■■■□□ 2
HSF4-223	ENST00000523077	DCC	P43146	1447 aa		27.56	■■■□□ 2
HSF4-223	ENST00000523077	MST1R	Q04912	1400 aa		27.56	■■■□□ 2
HSF4-223	ENST00000523077	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
HSF4-223	ENST00000523077	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
HSF4-223	ENST00000523077	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		27.49	■■□□□ 1.99
HSF4-223	ENST00000523077	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		27.48	■■□□□ 1.99
HSF4-223	ENST00000523077	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		27.47	■■□□□ 1.99
HSF4-223	ENST00000523077	AFF2	P51816	1311 aa		27.46	■■□□□ 1.99
HSF4-223	ENST00000523077	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	27.46	■■□□□ 1.99
HSF4-223	ENST00000523077	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		27.46	■■□□□ 1.99
HSF4-223	ENST00000523077	RXRB	P28702	533 aa		27.45	■■□□□ 1.98
HSF4-223	ENST00000523077	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		27.44	■■□□□ 1.98
HSF4-223	ENST00000523077	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		27.44	■■□□□ 1.98
HSF4-223	ENST00000523077	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		27.43	■■□□□ 1.98
HSF4-223	ENST00000523077	PTCH1	Q13635	1447 aa		27.42	■■□□□ 1.98
HSF4-223	ENST00000523077	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		27.4	■■□□□ 1.98
HSF4-223	ENST00000523077	C8orf37	Q96NL8	207 aa		27.4	■■□□□ 1.98
HSF4-223	ENST00000523077	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		27.4	■■□□□ 1.98
HSF4-223	ENST00000523077	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		27.38	■■□□□ 1.97
HSF4-223	ENST00000523077	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	27.38	■■□□□ 1.97
HSF4-223	ENST00000523077	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	27.38	■■□□□ 1.97
HSF4-223	ENST00000523077	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	27.38	■■□□□ 1.97
HSF4-223	ENST00000523077	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		27.37	■■□□□ 1.97
HSF4-223	ENST00000523077	RGS12	O14924	1447 aa		27.36	■■□□□ 1.97
HSF4-223	ENST00000523077	LAMC1	P11047	1609 aa		27.36	■■□□□ 1.97
HSF4-223	ENST00000523077	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		27.36	■■□□□ 1.97
HSF4-223	ENST00000523077	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		27.34	■■□□□ 1.97
HSF4-223	ENST00000523077	ADAMTS2	O95450	1211 aa		27.33	■■□□□ 1.97

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