RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522519.5

MSC-AS1-208, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 1,537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-208ENST00000522519 ANKLE2Q86XL3 938 aa23■■□□□ 1.27
MSC-AS1-208ENST00000522519 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23■■□□□ 1.27
MSC-AS1-208ENST00000522519 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.98■■□□□ 1.27
MSC-AS1-208ENST00000522519 LTKP29376 864 aa22.97■■□□□ 1.27
MSC-AS1-208ENST00000522519 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
MSC-AS1-208ENST00000522519 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.95■■□□□ 1.26
MSC-AS1-208ENST00000522519 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.95■■□□□ 1.26
MSC-AS1-208ENST00000522519 EID1Q9Y6B2 187 aa22.95■■□□□ 1.26
MSC-AS1-208ENST00000522519 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.93■■□□□ 1.26
MSC-AS1-208ENST00000522519 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
MSC-AS1-208ENST00000522519 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.89■■□□□ 1.26
MSC-AS1-208ENST00000522519 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
MSC-AS1-208ENST00000522519 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.26
MSC-AS1-208ENST00000522519 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
MSC-AS1-208ENST00000522519 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.89■■□□□ 1.25
MSC-AS1-208ENST00000522519 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
MSC-AS1-208ENST00000522519 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.88■■□□□ 1.25
MSC-AS1-208ENST00000522519 DIP2AQ14689 1571 aa22.88■■□□□ 1.25
MSC-AS1-208ENST00000522519 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
MSC-AS1-208ENST00000522519 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
MSC-AS1-208ENST00000522519 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.86■■□□□ 1.25
MSC-AS1-208ENST00000522519 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
MSC-AS1-208ENST00000522519 RGL3Q3MIN7 710 aa22.84■■□□□ 1.25
MSC-AS1-208ENST00000522519 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.82■■□□□ 1.24
MSC-AS1-208ENST00000522519 MYOM2P54296 1465 aa22.82■■□□□ 1.24
MSC-AS1-208ENST00000522519 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
MSC-AS1-208ENST00000522519 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.81■■□□□ 1.24
MSC-AS1-208ENST00000522519 NWD1Q149M9 1564 aa22.8■■□□□ 1.24
MSC-AS1-208ENST00000522519 LAMC1P11047 1609 aa22.79■■□□□ 1.24
MSC-AS1-208ENST00000522519 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
MSC-AS1-208ENST00000522519 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.78■■□□□ 1.24
MSC-AS1-208ENST00000522519 ALKQ9UM73 1620 aa22.77■■□□□ 1.24
MSC-AS1-208ENST00000522519 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
MSC-AS1-208ENST00000522519 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
MSC-AS1-208ENST00000522519 BCANQ96GW7 911 aa22.76■■□□□ 1.23
MSC-AS1-208ENST00000522519 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.76■■□□□ 1.23
MSC-AS1-208ENST00000522519 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.76■■□□□ 1.23
MSC-AS1-208ENST00000522519 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
MSC-AS1-208ENST00000522519 PIK3C2GO75747 1445 aa22.76■■□□□ 1.23
MSC-AS1-208ENST00000522519 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
MSC-AS1-208ENST00000522519 CPS1P31327 1500 aa22.74■■□□□ 1.23
MSC-AS1-208ENST00000522519 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.74■■□□□ 1.23
MSC-AS1-208ENST00000522519 TBX22Q9Y458 520 aa22.72■■□□□ 1.23
MSC-AS1-208ENST00000522519 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.71■■□□□ 1.23
MSC-AS1-208ENST00000522519 PIK3R4Q99570 1358 aa22.7■■□□□ 1.22
MSC-AS1-208ENST00000522519 NEUROD1Q13562 356 aa22.69■■□□□ 1.22
MSC-AS1-208ENST00000522519 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.69■■□□□ 1.22
MSC-AS1-208ENST00000522519 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.69■■□□□ 1.22
MSC-AS1-208ENST00000522519 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.68■■□□□ 1.22
MSC-AS1-208ENST00000522519 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.68■■□□□ 1.22
MSC-AS1-208ENST00000522519 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
MSC-AS1-208ENST00000522519 STAC3Q96MF2 364 aa22.67■■□□□ 1.22
MSC-AS1-208ENST00000522519 METP08581 1390 aa22.65■■□□□ 1.22
MSC-AS1-208ENST00000522519 PTPRUQ92729 1446 aa22.65■■□□□ 1.22
MSC-AS1-208ENST00000522519 KCNA6P17658 529 aa22.64■■□□□ 1.21
MSC-AS1-208ENST00000522519 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.64■■□□□ 1.21
MSC-AS1-208ENST00000522519 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.63■■□□□ 1.21
MSC-AS1-208ENST00000522519 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.63■■□□□ 1.21
MSC-AS1-208ENST00000522519 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.63■■□□□ 1.21
MSC-AS1-208ENST00000522519 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.62■■□□□ 1.21
MSC-AS1-208ENST00000522519 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.62■■□□□ 1.21
MSC-AS1-208ENST00000522519 TONSLQ96HA7 1378 aa22.61■■□□□ 1.21
MSC-AS1-208ENST00000522519 ADGRB1O14514 1584 aa22.61■■□□□ 1.21
MSC-AS1-208ENST00000522519 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
MSC-AS1-208ENST00000522519 CERKQ8TCT0 537 aa22.57■■□□□ 1.2
MSC-AS1-208ENST00000522519 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.57■■□□□ 1.2
MSC-AS1-208ENST00000522519 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.57■■□□□ 1.2
MSC-AS1-208ENST00000522519 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.56■■□□□ 1.2
MSC-AS1-208ENST00000522519 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
MSC-AS1-208ENST00000522519 PTCH1Q13635 1447 aa22.55■■□□□ 1.2
MSC-AS1-208ENST00000522519 TECPR2O15040 1411 aa22.54■■□□□ 1.2
MSC-AS1-208ENST00000522519 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
MSC-AS1-208ENST00000522519 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
MSC-AS1-208ENST00000522519 TMEM94Q12767 1356 aa22.52■■□□□ 1.2
MSC-AS1-208ENST00000522519 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
MSC-AS1-208ENST00000522519 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.52■■□□□ 1.19
MSC-AS1-208ENST00000522519 DLC1Q96QB1 1528 aa22.5■■□□□ 1.19
MSC-AS1-208ENST00000522519 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
MSC-AS1-208ENST00000522519 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.49■■□□□ 1.19
MSC-AS1-208ENST00000522519 ABCC11Q96J66 1382 aa22.48■■□□□ 1.19
MSC-AS1-208ENST00000522519 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.48■■□□□ 1.19
MSC-AS1-208ENST00000522519 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
MSC-AS1-208ENST00000522519 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.46■■□□□ 1.19
MSC-AS1-208ENST00000522519 STK26Q9P289 416 aa22.45■■□□□ 1.18
MSC-AS1-208ENST00000522519 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.45■■□□□ 1.18
MSC-AS1-208ENST00000522519 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.44■■□□□ 1.18
MSC-AS1-208ENST00000522519 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.43■■□□□ 1.18
MSC-AS1-208ENST00000522519 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.43■■□□□ 1.18
MSC-AS1-208ENST00000522519 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.42■■□□□ 1.18
MSC-AS1-208ENST00000522519 MSH6P52701 1360 aa22.41■■□□□ 1.18
MSC-AS1-208ENST00000522519 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.4■■□□□ 1.18
MSC-AS1-208ENST00000522519 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.4■■□□□ 1.18
MSC-AS1-208ENST00000522519 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.39■■□□□ 1.17
MSC-AS1-208ENST00000522519 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.39■■□□□ 1.17
MSC-AS1-208ENST00000522519 DCCP43146 1447 aa22.39■■□□□ 1.17
MSC-AS1-208ENST00000522519 ADGRB2O60241 1585 aa22.38■■□□□ 1.17
MSC-AS1-208ENST00000522519 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
MSC-AS1-208ENST00000522519 SIRT1Q96EB6 747 aa22.38■■□□□ 1.17
MSC-AS1-208ENST00000522519 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.38■■□□□ 1.17
MSC-AS1-208ENST00000522519 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.37■■□□□ 1.17
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