RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521404.5

MEG3-217, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEG3, Length 1,426 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-217ENST00000521404 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
MEG3-217ENST00000521404 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
MEG3-217ENST00000521404 KCNA6P17658 529 aa23.66■■□□□ 1.38
MEG3-217ENST00000521404 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.65■■□□□ 1.38
MEG3-217ENST00000521404 TRIM52Q96A61 297 aa23.64■■□□□ 1.37
MEG3-217ENST00000521404 BCANQ96GW7 911 aa23.63■■□□□ 1.37
MEG3-217ENST00000521404 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.61■■□□□ 1.37
MEG3-217ENST00000521404 PIP4K2BP78356 416 aa23.6■■□□□ 1.37
MEG3-217ENST00000521404 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.6■■□□□ 1.37
MEG3-217ENST00000521404 TBX22Q9Y458 520 aa23.59■■□□□ 1.37
MEG3-217ENST00000521404 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
MEG3-217ENST00000521404 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.59■■□□□ 1.37
MEG3-217ENST00000521404 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
MEG3-217ENST00000521404 NWD1Q149M9 1564 aa23.56■■□□□ 1.36
MEG3-217ENST00000521404 ALKQ9UM73 1620 aa23.56■■□□□ 1.36
MEG3-217ENST00000521404 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
MEG3-217ENST00000521404 TRPM2O94759 1503 aa23.55■■□□□ 1.36
MEG3-217ENST00000521404 TMEM94Q12767 1356 aa23.55■■□□□ 1.36
MEG3-217ENST00000521404 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
MEG3-217ENST00000521404 PIK3R4Q99570 1358 aa23.54■■□□□ 1.36
MEG3-217ENST00000521404 DIP2AQ14689 1571 aa23.53■■□□□ 1.36
MEG3-217ENST00000521404 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
MEG3-217ENST00000521404 HSPA1LP34931 641 aa23.52■■□□□ 1.36
MEG3-217ENST00000521404 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.52■■□□□ 1.36
MEG3-217ENST00000521404 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.52■■□□□ 1.36
MEG3-217ENST00000521404 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.51■■□□□ 1.35
MEG3-217ENST00000521404 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.5■■□□□ 1.35
MEG3-217ENST00000521404 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
MEG3-217ENST00000521404 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
MEG3-217ENST00000521404 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
MEG3-217ENST00000521404 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.48■■□□□ 1.35
MEG3-217ENST00000521404 CLTCL1P53675 1640 aa23.48■■□□□ 1.35
MEG3-217ENST00000521404 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
MEG3-217ENST00000521404 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
MEG3-217ENST00000521404 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.44■■□□□ 1.34
MEG3-217ENST00000521404 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.44■■□□□ 1.34
MEG3-217ENST00000521404 MSH6P52701 1360 aa23.44■■□□□ 1.34
MEG3-217ENST00000521404 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.42■■□□□ 1.34
MEG3-217ENST00000521404 KIF1BO60333 1816 aa23.41■■□□□ 1.34
MEG3-217ENST00000521404 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.41■■□□□ 1.34
MEG3-217ENST00000521404 HRCP23327 699 aa23.41■■□□□ 1.34
MEG3-217ENST00000521404 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
MEG3-217ENST00000521404 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
MEG3-217ENST00000521404 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.4■■□□□ 1.34
MEG3-217ENST00000521404 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.39■■□□□ 1.33
MEG3-217ENST00000521404 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.37■■□□□ 1.33
MEG3-217ENST00000521404 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.35■■□□□ 1.33
MEG3-217ENST00000521404 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.34■■□□□ 1.33
MEG3-217ENST00000521404 PTPRUQ92729 1446 aa23.34■■□□□ 1.33
MEG3-217ENST00000521404 SLAIN2Q9P270 581 aa23.34■■□□□ 1.33
MEG3-217ENST00000521404 FOXD1Q16676 465 aa23.33■■□□□ 1.33
MEG3-217ENST00000521404 C14orf37Q86TY3 774 aa23.33■■□□□ 1.33
MEG3-217ENST00000521404 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.33■■□□□ 1.32
MEG3-217ENST00000521404 METP08581 1390 aa23.31■■□□□ 1.32
MEG3-217ENST00000521404 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
MEG3-217ENST00000521404 ATF3P18847 181 aa23.29■■□□□ 1.32
MEG3-217ENST00000521404 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
MEG3-217ENST00000521404 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.28■■□□□ 1.32
MEG3-217ENST00000521404 DCCP43146 1447 aa23.27■■□□□ 1.32
MEG3-217ENST00000521404 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.26■■□□□ 1.31
MEG3-217ENST00000521404 ILDR2Q71H61 639 aa23.25■■□□□ 1.31
MEG3-217ENST00000521404 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.25■■□□□ 1.31
MEG3-217ENST00000521404 PPLO60437 1756 aa23.23■■□□□ 1.31
MEG3-217ENST00000521404 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
MEG3-217ENST00000521404 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.22■■□□□ 1.31
MEG3-217ENST00000521404 PTCH1Q13635 1447 aa23.21■■□□□ 1.31
MEG3-217ENST00000521404 RGL3Q3MIN7 710 aa23.2■■□□□ 1.3
MEG3-217ENST00000521404 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.18■■□□□ 1.3
MEG3-217ENST00000521404 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
MEG3-217ENST00000521404 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
MEG3-217ENST00000521404 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.16■■□□□ 1.3
MEG3-217ENST00000521404 SOCS7O14512 581 aa23.16■■□□□ 1.3
MEG3-217ENST00000521404 JCADQ9P266 1359 aa23.14■■□□□ 1.29
MEG3-217ENST00000521404 PHLPP1O60346 1717 aa23.13■■□□□ 1.29
MEG3-217ENST00000521404 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.13■■□□□ 1.29
MEG3-217ENST00000521404 BRINP3Q76B58 766 aa23.13■■□□□ 1.29
MEG3-217ENST00000521404 MST1RQ04912 1400 aa23.13■■□□□ 1.29
MEG3-217ENST00000521404 IFT172Q9UG01 1749 aa23.13■■□□□ 1.29
MEG3-217ENST00000521404 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
MEG3-217ENST00000521404 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
MEG3-217ENST00000521404 PIK3C2GO75747 1445 aa23.11■■□□□ 1.29
MEG3-217ENST00000521404 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
MEG3-217ENST00000521404 TECPR2O15040 1411 aa23.08■■□□□ 1.29
MEG3-217ENST00000521404 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.07■■□□□ 1.28
MEG3-217ENST00000521404 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
MEG3-217ENST00000521404 MYOM2P54296 1465 aa23.07■■□□□ 1.28
MEG3-217ENST00000521404 ABCC11Q96J66 1382 aa23.06■■□□□ 1.28
MEG3-217ENST00000521404 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.06■■□□□ 1.28
MEG3-217ENST00000521404 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.06■■□□□ 1.28
MEG3-217ENST00000521404 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
MEG3-217ENST00000521404 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.06■■□□□ 1.28
MEG3-217ENST00000521404 STAC3Q96MF2 364 aa23.05■■□□□ 1.28
MEG3-217ENST00000521404 NEUROD1Q13562 356 aa23.03■■□□□ 1.28
MEG3-217ENST00000521404 SIRT1Q96EB6 747 aa23.03■■□□□ 1.28
MEG3-217ENST00000521404 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.02■■□□□ 1.28
MEG3-217ENST00000521404 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
MEG3-217ENST00000521404 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23■■□□□ 1.27
MEG3-217ENST00000521404 SIN3AQ96ST3 1273 aa23■■□□□ 1.27
MEG3-217ENST00000521404 STK26Q9P289 416 aa23■■□□□ 1.27
MEG3-217ENST00000521404 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
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