RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518681.5

MIB2-231, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene MIB2, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-231	ENST00000518681	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	24.67	■■□□□ 1.54
MIB2-231	ENST00000518681	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		24.65	■■□□□ 1.54
MIB2-231	ENST00000518681	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		24.64	■■□□□ 1.53
MIB2-231	ENST00000518681	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		24.64	■■□□□ 1.53
MIB2-231	ENST00000518681	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	24.64	■■□□□ 1.53
MIB2-231	ENST00000518681	SLFN5	Q08AF3	891 aa		24.63	■■□□□ 1.53
MIB2-231	ENST00000518681	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		24.62	■■□□□ 1.53
MIB2-231	ENST00000518681	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		24.61	■■□□□ 1.53
MIB2-231	ENST00000518681	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		24.61	■■□□□ 1.53
MIB2-231	ENST00000518681	CHD1	O14646	1710 aa		24.61	■■□□□ 1.53
MIB2-231	ENST00000518681	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	24.61	■■□□□ 1.53
MIB2-231	ENST00000518681	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	24.6	■■□□□ 1.53
MIB2-231	ENST00000518681	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	24.6	■■□□□ 1.53
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF521	Q96K83	1311 aa		24.59	■■□□□ 1.53
MIB2-231	ENST00000518681	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	24.59	■■□□□ 1.53
MIB2-231	ENST00000518681	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	24.59	■■□□□ 1.53
MIB2-231	ENST00000518681	PLCH2	O75038	1416 aa		24.58	■■□□□ 1.53
MIB2-231	ENST00000518681	CDCA8	Q53HL2	280 aa		24.58	■■□□□ 1.53
MIB2-231	ENST00000518681	PANK1	Q8TE04	598 aa		24.58	■■□□□ 1.53
MIB2-231	ENST00000518681	C8orf34	Q49A92	452 aa		24.58	■■□□□ 1.53
MIB2-231	ENST00000518681	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		24.58	■■□□□ 1.53
MIB2-231	ENST00000518681	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	24.57	■■□□□ 1.52
MIB2-231	ENST00000518681	ATP10A	O60312	1499 aa		24.57	■■□□□ 1.52
MIB2-231	ENST00000518681	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		24.57	■■□□□ 1.52
MIB2-231	ENST00000518681	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		24.56	■■□□□ 1.52
MIB2-231	ENST00000518681	COG6	Q9Y2V7	657 aa		24.56	■■□□□ 1.52
MIB2-231	ENST00000518681	IGHD	P01880	384 aa		24.56	■■□□□ 1.52
MIB2-231	ENST00000518681	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	24.55	■■□□□ 1.52
MIB2-231	ENST00000518681	ABCC2	Q92887	1545 aa		24.55	■■□□□ 1.52
MIB2-231	ENST00000518681	FAM161A	Q3B820	660 aa		24.55	■■□□□ 1.52
MIB2-231	ENST00000518681	PLXNC1	O60486	1568 aa		24.54	■■□□□ 1.52
MIB2-231	ENST00000518681	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		24.54	■■□□□ 1.52
MIB2-231	ENST00000518681	NFKBIB	Q15653	356 aa		24.53	■■□□□ 1.52
MIB2-231	ENST00000518681	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	24.53	■■□□□ 1.52
MIB2-231	ENST00000518681	TNN	Q9UQP3	1299 aa		24.53	■■□□□ 1.52
MIB2-231	ENST00000518681	MADD	Q8WXG6	1647 aa		24.53	■■□□□ 1.52
MIB2-231	ENST00000518681	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		24.53	■■□□□ 1.52
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		24.52	■■□□□ 1.52
MIB2-231	ENST00000518681	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		24.51	■■□□□ 1.51
MIB2-231	ENST00000518681	LAMC1	P11047	1609 aa		24.51	■■□□□ 1.51
MIB2-231	ENST00000518681	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		24.5	■■□□□ 1.51
MIB2-231	ENST00000518681	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		24.49	■■□□□ 1.51
MIB2-231	ENST00000518681	CLTCL1	P53675	1640 aa		24.48	■■□□□ 1.51
MIB2-231	ENST00000518681	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	24.48	■■□□□ 1.51
MIB2-231	ENST00000518681	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	24.48	■■□□□ 1.51
MIB2-231	ENST00000518681	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		24.47	■■□□□ 1.51
MIB2-231	ENST00000518681	SEC24B	O95487	1268 aa		24.46	■■□□□ 1.51
MIB2-231	ENST00000518681	ABCC1	P33527	1531 aa		24.45	■■□□□ 1.51
MIB2-231	ENST00000518681	MORC1	Q86VD1	984 aa		24.45	■■□□□ 1.5
MIB2-231	ENST00000518681	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	24.45	■■□□□ 1.5
MIB2-231	ENST00000518681		E9PSI1	815 aa		24.44	■■□□□ 1.5
MIB2-231	ENST00000518681	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	24.44	■■□□□ 1.5
MIB2-231	ENST00000518681	INSR	P06213	1382 aa		24.44	■■□□□ 1.5
MIB2-231	ENST00000518681	KANK1	Q14678	1352 aa		24.44	■■□□□ 1.5
MIB2-231	ENST00000518681	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	24.44	■■□□□ 1.5
MIB2-231	ENST00000518681	WWC1	Q8IX03	1113 aa		24.44	■■□□□ 1.5
MIB2-231	ENST00000518681	GGT6	Q6P531	493 aa		24.43	■■□□□ 1.5
MIB2-231	ENST00000518681	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	24.43	■■□□□ 1.5
MIB2-231	ENST00000518681	IQGAP1	P46940	1657 aa		24.43	■■□□□ 1.5
MIB2-231	ENST00000518681	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	24.43	■■□□□ 1.5
MIB2-231	ENST00000518681	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	24.43	■■□□□ 1.5
MIB2-231	ENST00000518681	PIK3C2G	O75747	1445 aa		24.42	■■□□□ 1.5
MIB2-231	ENST00000518681	USP35	Q9P2H5	1018 aa		24.4	■■□□□ 1.5
MIB2-231	ENST00000518681	TRPM2	O94759	1503 aa		24.4	■■□□□ 1.5
MIB2-231	ENST00000518681	ERVK-7	P63135	1459 aa		24.4	■■□□□ 1.5
MIB2-231	ENST00000518681	SYNM	O15061	1565 aa		24.4	■■□□□ 1.5
MIB2-231	ENST00000518681	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	24.39	■■□□□ 1.5
MIB2-231	ENST00000518681	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	24.39	■■□□□ 1.49
MIB2-231	ENST00000518681	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		24.38	■■□□□ 1.49
MIB2-231	ENST00000518681	RLBP1	P12271	317 aa		24.37	■■□□□ 1.49
MIB2-231	ENST00000518681	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	24.37	■■□□□ 1.49
MIB2-231	ENST00000518681	MYOM1	P52179	1685 aa		24.37	■■□□□ 1.49
MIB2-231	ENST00000518681	GSE1	Q14687	1217 aa		24.37	■■□□□ 1.49
MIB2-231	ENST00000518681	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		24.37	■■□□□ 1.49
MIB2-231	ENST00000518681	PTPRT	O14522	1441 aa		24.36	■■□□□ 1.49
MIB2-231	ENST00000518681	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		24.36	■■□□□ 1.49
MIB2-231	ENST00000518681	MTHFS	P49914	203 aa		24.35	■■□□□ 1.49
MIB2-231	ENST00000518681	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		24.35	■■□□□ 1.49
MIB2-231	ENST00000518681	NOS1	P29475	1434 aa		24.34	■■□□□ 1.49
MIB2-231	ENST00000518681	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		24.34	■■□□□ 1.49
MIB2-231	ENST00000518681	FANCA	O15360	1455 aa		24.33	■■□□□ 1.49
MIB2-231	ENST00000518681	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	24.33	■■□□□ 1.49
MIB2-231	ENST00000518681	SHROOM2	Q13796	1616 aa		24.33	■■□□□ 1.48
MIB2-231	ENST00000518681	ARX	Q96QS3	562 aa		24.32	■■□□□ 1.48
MIB2-231	ENST00000518681	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		24.32	■■□□□ 1.48
MIB2-231	ENST00000518681	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	24.31	■■□□□ 1.48
MIB2-231	ENST00000518681	CEP152	O94986	1710 aa		24.3	■■□□□ 1.48
MIB2-231	ENST00000518681	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	24.3	■■□□□ 1.48
MIB2-231	ENST00000518681	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	24.3	■■□□□ 1.48
MIB2-231	ENST00000518681	STK26	Q9P289	416 aa		24.29	■■□□□ 1.48
MIB2-231	ENST00000518681	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	24.29	■■□□□ 1.48
MIB2-231	ENST00000518681	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	24.29	■■□□□ 1.48
MIB2-231	ENST00000518681	CABP2	Q9NPB3	220 aa		24.28	■■□□□ 1.48
MIB2-231	ENST00000518681	ADGRL1	O94910	1474 aa		24.28	■■□□□ 1.48
MIB2-231	ENST00000518681	ATP7A	Q04656	1500 aa		24.28	■■□□□ 1.48
MIB2-231	ENST00000518681	ABCA6	Q8N139	1617 aa		24.27	■■□□□ 1.48
MIB2-231	ENST00000518681	USP19	O94966	1318 aa		24.27	■■□□□ 1.48
MIB2-231	ENST00000518681	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		24.27	■■□□□ 1.48
MIB2-231	ENST00000518681	RUNDC1	Q96C34	613 aa		24.26	■■□□□ 1.47
MIB2-231	ENST00000518681	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		24.26	■■□□□ 1.47

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