RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517550.1

HOXA-AS2-201, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXA-AS2, Length 2,022 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-201ENST00000517550 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXA-AS2-201ENST00000517550 MADDQ8WXG6 1647 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA-AS2-201ENST00000517550 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA-AS2-201ENST00000517550 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 NUDCQ9Y266 331 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 DISP3Q9P2K9 1392 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 CFAP70Q5T0N1 1121 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 CHGAP10645 457 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 NOS1P29475 1434 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 STAC3Q96MF2 364 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 LAMC1P11047 1609 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 NEURL4Q96JN8 1562 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 MROH2AA6NES4 1674 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ADGRB3O60242 1522 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 IDI1Q13907 227 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ERICH6Q7L0X2 663 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
HOXA-AS2-201ENST00000517550 SYNMO15061 1565 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXA-AS2-201ENST00000517550 MYOM2P54296 1465 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXA-AS2-201ENST00000517550 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
HOXA-AS2-201ENST00000517550 TMC1Q8TDI8 760 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXA-AS2-201ENST00000517550 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
HOXA-AS2-201ENST00000517550 NRXN1Q9ULB1 1477 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
HOXA-AS2-201ENST00000517550 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
HOXA-AS2-201ENST00000517550 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
HOXA-AS2-201ENST00000517550 RALBP1Q15311 655 aa15.8■□□□□ 0.12
HOXA-AS2-201ENST00000517550 BCL11AQ9H165 835 aa15.8■□□□□ 0.12
HOXA-AS2-201ENST00000517550 KIF1BO60333 1816 aa15.79■□□□□ 0.12
HOXA-AS2-201ENST00000517550 MLECQ14165 292 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXA-AS2-201ENST00000517550 TMF1P82094 1093 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXA-AS2-201ENST00000517550 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
HOXA-AS2-201ENST00000517550 IQGAP1P46940 1657 aa15.77■□□□□ 0.12
HOXA-AS2-201ENST00000517550 IFT172Q9UG01 1749 aa15.77■□□□□ 0.12
HOXA-AS2-201ENST00000517550 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.77■□□□□ 0.11
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PIK3C2BO00750 1634 aa15.76■□□□□ 0.11
HOXA-AS2-201ENST00000517550 TMEM132EQ6IEE7 984 aa15.76■□□□□ 0.11
HOXA-AS2-201ENST00000517550 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PANK3Q9H999 370 aa15.76■□□□□ 0.11
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PIK3C2GO75747 1445 aa15.76■□□□□ 0.11
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15.76■□□□□ 0.11
HOXA-AS2-201ENST00000517550 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
HOXA-AS2-201ENST00000517550 AGLP35573 1532 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXA-AS2-201ENST00000517550 REREQ9P2R6 1566 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXA-AS2-201ENST00000517550 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXA-AS2-201ENST00000517550 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
HOXA-AS2-201ENST00000517550 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXA-AS2-201ENST00000517550 TRAK1Q9UPV9 953 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXA-AS2-201ENST00000517550 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PPLO60437 1756 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ADGRB1O14514 1584 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXA-AS2-201ENST00000517550 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ERVK-7P63135 1459 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXA-AS2-201ENST00000517550 NLRP13Q86W25 1043 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXA-AS2-201ENST00000517550 VGFO15240 615 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PDE3BQ13370 1112 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA-AS2-201ENST00000517550 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXA-AS2-201ENST00000517550 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXA-AS2-201ENST00000517550 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXA-AS2-201ENST00000517550 INSRP06213 1382 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA-AS2-201ENST00000517550 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA-AS2-201ENST00000517550 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA-AS2-201ENST00000517550 RRP1P56182 461 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
HOXA-AS2-201ENST00000517550 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
HOXA-AS2-201ENST00000517550 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa15.65■□□□□ 0.1
HOXA-AS2-201ENST00000517550 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.65■□□□□ 0.1
HOXA-AS2-201ENST00000517550 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ZMYM3Q14202 1370 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 RCAN3Q9UKA8 241 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ZFYVE9O95405 1425 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 CDCA8Q53HL2 280 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 MYO5BQ9ULV0 1848 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 CARD14Q9BXL6 1004 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 A2ML1A8K2U0 1454 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 STK26Q9P289 416 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 MYO3AQ8NEV4 1616 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 MYOM1P52179 1685 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 EXOC6Q8TAG9 804 aa15.58■□□□□ 0.09
HOXA-AS2-201ENST00000517550 KNSTRNQ9Y448 316 aa15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms