RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515737.5

SH3BP2-228, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,579 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-228ENST00000515737 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-228ENST00000515737 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-228ENST00000515737 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-228ENST00000515737 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-228ENST00000515737 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-228ENST00000515737 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-228ENST00000515737 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-228ENST00000515737 PPLO60437 1756 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-228ENST00000515737 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-228ENST00000515737 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-228ENST00000515737 ERVK-7P63135 1459 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP2-228ENST00000515737 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP2-228ENST00000515737 TESK2Q96S53 571 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP2-228ENST00000515737 CCER2I3L3R5 266 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-228ENST00000515737 IQGAP1P46940 1657 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-228ENST00000515737 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-228ENST00000515737 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-228ENST00000515737 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-228ENST00000515737 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-228ENST00000515737 PIK3C2GO75747 1445 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-228ENST00000515737 ZMYM3Q14202 1370 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-228ENST00000515737 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.33■■□□□ 1.32
SH3BP2-228ENST00000515737 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-228ENST00000515737 TMF1P82094 1093 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-228ENST00000515737 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-228ENST00000515737 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-228ENST00000515737 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-228ENST00000515737 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-228ENST00000515737 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-228ENST00000515737 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-228ENST00000515737 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-228ENST00000515737 ZFYVE9O95405 1425 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-228ENST00000515737 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-228ENST00000515737 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-228ENST00000515737 ADGRB1O14514 1584 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-228ENST00000515737 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-228ENST00000515737 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-228ENST00000515737 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-228ENST00000515737 CDCA8Q53HL2 280 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-228ENST00000515737 SLC24A1O60721 1099 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-228ENST00000515737 TNRQ92752 1358 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-228ENST00000515737 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2-228ENST00000515737 CCDC184Q52MB2 194 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-228ENST00000515737 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2-228ENST00000515737 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2-228ENST00000515737 PANK3Q9H999 370 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2-228ENST00000515737 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-228ENST00000515737 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-228ENST00000515737 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-228ENST00000515737 MRS2Q9HD23 443 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-228ENST00000515737 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-228ENST00000515737 STK26Q9P289 416 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-228ENST00000515737 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
SH3BP2-228ENST00000515737 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-228ENST00000515737 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-228ENST00000515737 C3P01024 1663 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-228ENST00000515737 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-228ENST00000515737 ALKQ9UM73 1620 aa23.07■■□□□ 1.28
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SH3BP2-228ENST00000515737 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-228ENST00000515737 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2-228ENST00000515737 RALBP1Q15311 655 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2-228ENST00000515737 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-228ENST00000515737 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-228ENST00000515737 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-228ENST00000515737 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-228ENST00000515737 MYOM1P52179 1685 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-228ENST00000515737 NLRP1Q9C000 1473 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-228ENST00000515737 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-228ENST00000515737 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
SH3BP2-228ENST00000515737 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-228ENST00000515737 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SH3BP2-228ENST00000515737 KNSTRNQ9Y448 316 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-228ENST00000515737 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-228ENST00000515737 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-228ENST00000515737 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-228ENST00000515737 PTPRMP28827 1452 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-228ENST00000515737 TMC1Q8TDI8 760 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-228ENST00000515737 PRAM1Q96QH2 718 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-228ENST00000515737 EVC2Q86UK5 1308 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-228ENST00000515737 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
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SH3BP2-228ENST00000515737 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
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SH3BP2-228ENST00000515737 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-228ENST00000515737 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-228ENST00000515737 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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SH3BP2-228ENST00000515737 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.92■■□□□ 1.26
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SH3BP2-228ENST00000515737 NLRP13Q86W25 1043 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-228ENST00000515737 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-228ENST00000515737 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-228ENST00000515737 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-228ENST00000515737 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-228ENST00000515737 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-228ENST00000515737 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-228ENST00000515737 METP08581 1390 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-228ENST00000515737 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-228ENST00000515737 CABP2Q9NPB3 220 aa22.89■■□□□ 1.25
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