RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513573.1

CDH18-AS1-201, CDH18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH18-AS1, Length 424 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.66■■■□□ 2.66
CDH18-AS1-201ENST00000513573 JCADQ9P266 1359 aa31.66■■■□□ 2.66
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa31.63■■■□□ 2.65
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa31.63■■■□□ 2.65
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PHLPP1O60346 1717 aa31.62■■■□□ 2.65
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ADGRL2O95490 1459 aa31.6■■■□□ 2.65
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.6■■■□□ 2.65
CDH18-AS1-201ENST00000513573 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TBX22Q9Y458 520 aa31.57■■■□□ 2.64
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa31.53■■■□□ 2.64
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa31.52■■■□□ 2.64
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RIMS2Q9UQ26 1411 aa31.52■■■□□ 2.64
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HDGFP51858 240 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LRP6O75581 1613 aa31.51■■■□□ 2.63
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.5■■■□□ 2.63
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BCANQ96GW7 911 aa31.49■■■□□ 2.63
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa31.48■■■□□ 2.63
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.47■■■□□ 2.63
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.46■■■□□ 2.63
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PIK3R4Q99570 1358 aa31.45■■■□□ 2.63
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C19orf44Q9H6X5 657 aa31.44■■■□□ 2.62
CDH18-AS1-201ENST00000513573 APLP2Q06481 763 aa31.43■■■□□ 2.62
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP31.43■■■□□ 2.62
CDH18-AS1-201ENST00000513573 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP31.43■■■□□ 2.62
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CADPS2Q86UW7 1296 aa31.42■■■□□ 2.62
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SHPRHQ149N8 1683 aa31.41■■■□□ 2.62
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DIP2AQ14689 1571 aa31.4■■■□□ 2.62
CDH18-AS1-201ENST00000513573 UNC13BO14795 1591 aa31.34■■■□□ 2.61
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ATF3P18847 181 aa31.33■■■□□ 2.61
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BRINP3Q76B58 766 aa31.32■■■□□ 2.6
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PTPRUQ92729 1446 aa31.31■■■□□ 2.6
CDH18-AS1-201ENST00000513573 E9PCH4 1651 aa31.3■■■□□ 2.6
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DCCP43146 1447 aa31.3■■■□□ 2.6
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C14orf37Q86TY3 774 aa31.29■■■□□ 2.6
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa31.28■■■□□ 2.6
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RXRBP28702 533 aa31.27■■■□□ 2.6
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRPM2O94759 1503 aa31.27■■■□□ 2.6
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.26■■■□□ 2.6
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRIM52Q96A61 297 aa31.26■■■□□ 2.59
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CHGAP10645 457 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.22■■■□□ 2.59
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa31.2■■■□□ 2.59
CDH18-AS1-201ENST00000513573 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.58
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ROCK1Q13464 1354 aa31.19■■■□□ 2.58
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MST1RQ04912 1400 aa31.19■■■□□ 2.58
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa31.19■■■□□ 2.58
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NHSL1Q5SYE7 1610 aa31.17■■■□□ 2.58
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa31.17■■■□□ 2.58
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AFF2P51816 1311 aa31.16■■■□□ 2.58
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa31.12■■■□□ 2.57
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NUP155O75694 1391 aa31.08■■■□□ 2.57
CDH18-AS1-201ENST00000513573 METP08581 1390 aa31.08■■■□□ 2.57
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PNPLA6Q8IY17 1366 aa31.07■■■□□ 2.56
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RGS12O14924 1447 aa31.06■■■□□ 2.56
CDH18-AS1-201ENST00000513573 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa31.05■■■□□ 2.56
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LAMC1P11047 1609 aa31.02■■■□□ 2.56
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C8orf37Q96NL8 207 aa30.99■■■□□ 2.55
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa30.97■■■□□ 2.55
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.96■■■□□ 2.55
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30.95■■■□□ 2.54
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.93■■■□□ 2.54
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NGLY1Q96IV0 654 aa30.9■■■□□ 2.54
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.9■■■□□ 2.54
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PTCH1Q13635 1447 aa30.88■■■□□ 2.53
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CLTCL1P53675 1640 aa30.85■■■□□ 2.53
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ADAMTS2O95450 1211 aa30.84■■■□□ 2.53
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ATAD2Q6PL18 1390 aa30.83■■■□□ 2.53
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ORAI2Q96SN7 254 aa30.83■■■□□ 2.53
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EP400Q96L91 3159 aa30.83■■■□□ 2.53
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.81■■■□□ 2.52
CDH18-AS1-201ENST00000513573 USP21Q9UK80 565 aa30.81■■■□□ 2.52
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
CDH18-AS1-201ENST00000513573 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ATRNO75882 1429 aa30.8■■■□□ 2.52
CDH18-AS1-201ENST00000513573 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ITGAEP38570 1179 aa30.74■■■□□ 2.51
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MYOM2P54296 1465 aa30.74■■■□□ 2.51
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KIF1BO60333 1816 aa30.73■■■□□ 2.51
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BCL9LQ86UU0 1499 aa30.72■■■□□ 2.51
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