RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513542.1

SMAD1-AS1-201, SMAD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMAD1-AS1, Length 481 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LTKP29376 864 aa19.7■□□□□ 0.74
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ANKLE2Q86XL3 938 aa19.7■□□□□ 0.74
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa19.68■□□□□ 0.74
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TXNDC2Q86VQ3 553 aa19.67■□□□□ 0.74
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 EID1Q9Y6B2 187 aa19.64■□□□□ 0.73
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa19.64■□□□□ 0.73
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.63■□□□□ 0.73
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa19.61■□□□□ 0.73
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 STRCP1A6NGW2 1772 aa19.61■□□□□ 0.73
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa19.59■□□□□ 0.73
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RGL3Q3MIN7 710 aa19.58■□□□□ 0.72
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP19.58■□□□□ 0.72
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LTBP4Q8N2S1 1624 aa19.57■□□□□ 0.72
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DIP2AQ14689 1571 aa19.57■□□□□ 0.72
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa19.56■□□□□ 0.72
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HDGFP51858 240 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa19.54■□□□□ 0.72
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SLC26A8Q96RN1 970 aa19.53■□□□□ 0.72
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MYOM2P54296 1465 aa19.53■□□□□ 0.72
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 BCANQ96GW7 911 aa19.52■□□□□ 0.72
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NWD1Q149M9 1564 aa19.52■□□□□ 0.71
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.51■□□□□ 0.71
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa19.5■□□□□ 0.71
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NRXN1Q9ULB1 1477 aa19.49■□□□□ 0.71
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ALKQ9UM73 1620 aa19.49■□□□□ 0.71
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 VGFO15240 615 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PIK3C2GO75747 1445 aa19.48■□□□□ 0.71
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CPS1P31327 1500 aa19.46■□□□□ 0.71
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LAMC1P11047 1609 aa19.46■□□□□ 0.71
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa19.46■□□□□ 0.71
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TBX22Q9Y458 520 aa19.45■□□□□ 0.7
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NEUROD1Q13562 356 aa19.44■□□□□ 0.7
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 METP08581 1390 aa19.44■□□□□ 0.7
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PTPRUQ92729 1446 aa19.43■□□□□ 0.7
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DCAF11Q8TEB1 546 aa19.42■□□□□ 0.7
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LRRC7Q96NW7 1537 aa19.41■□□□□ 0.7
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa19.41■□□□□ 0.7
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PIK3R4Q99570 1358 aa19.41■□□□□ 0.7
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KCNA6P17658 529 aa19.39■□□□□ 0.69
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KNDC1Q76NI1 1749 aa19.38■□□□□ 0.69
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.38■□□□□ 0.69
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa19.38■□□□□ 0.69
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SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PRAG1Q86YV5 1406 aa19.36■□□□□ 0.69
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ADGRB1O14514 1584 aa19.36■□□□□ 0.69
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IQSEC2Q5JU85 1478 aa19.35■□□□□ 0.69
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CFAP70Q5T0N1 1121 aa19.34■□□□□ 0.69
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TONSLQ96HA7 1378 aa19.33■□□□□ 0.69
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa19.33■□□□□ 0.69
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.33■□□□□ 0.69
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa19.33■□□□□ 0.68
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TMEM94Q12767 1356 aa19.32■□□□□ 0.68
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NALCNQ8IZF0 1738 aa19.32■□□□□ 0.68
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 STAC3Q96MF2 364 aa19.32■□□□□ 0.68
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TMEM132EQ6IEE7 984 aa19.31■□□□□ 0.68
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PTCH1Q13635 1447 aa19.31■□□□□ 0.68
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TECPR2O15040 1411 aa19.29■□□□□ 0.68
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ROBO2Q9HCK4 1378 aa19.29■□□□□ 0.68
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 STK26Q9P289 416 aa19.26■□□□□ 0.67
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ABCC11Q96J66 1382 aa19.24■□□□□ 0.67
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DLC1Q96QB1 1528 aa19.24■□□□□ 0.67
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NBPF8Q3BBV2 869 aa19.23■□□□□ 0.67
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa19.22■□□□□ 0.67
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NBPF1Q3BBV0 1214 aa19.22■□□□□ 0.67
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa19.22■□□□□ 0.67
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa19.22■□□□□ 0.67
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RALGAPBQ86X10 1494 aa19.21■□□□□ 0.67
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MSH6P52701 1360 aa19.2■□□□□ 0.66
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19.19■□□□□ 0.66
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C14orf37Q86TY3 774 aa19.19■□□□□ 0.66
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 UBAP1LF5GYI3 381 aa19.18■□□□□ 0.66
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 WAPLQ7Z5K2 1190 aa19.18■□□□□ 0.66
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.17■□□□□ 0.66
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa19.17■□□□□ 0.66
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DCCP43146 1447 aa19.16■□□□□ 0.66
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 QRICH2Q9H0J4 1663 aa19.15■□□□□ 0.66
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FBXO41Q8TF61 875 aa19.15■□□□□ 0.66
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GPRASP1Q5JY77 1395 aa19.15■□□□□ 0.66
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ADGRB2O60241 1585 aa19.15■□□□□ 0.66
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