RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512731.5

MMP23B-210, Transcript of matrix metallopeptidase 23B, humanhuman

TSL 2

Gene MMP23B, Length 1,531 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP23B-210ENST00000512731 IQGAP1P46940 1657 aa37.54■■■■□ 3.6
MMP23B-210ENST00000512731 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa37.52■■■■□ 3.6
MMP23B-210ENST00000512731 HDGFP51858 240 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
MMP23B-210ENST00000512731 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa37.45■■■■□ 3.58
MMP23B-210ENST00000512731 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa37.44■■■■□ 3.58
MMP23B-210ENST00000512731 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP37.44■■■■□ 3.58
MMP23B-210ENST00000512731 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
MMP23B-210ENST00000512731 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.43■■■■□ 3.58
MMP23B-210ENST00000512731 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa37.4■■■■□ 3.58
MMP23B-210ENST00000512731 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
MMP23B-210ENST00000512731 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
MMP23B-210ENST00000512731 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
MMP23B-210ENST00000512731 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa37.34■■■■□ 3.57
MMP23B-210ENST00000512731 PPLO60437 1756 aa37.33■■■■□ 3.57
MMP23B-210ENST00000512731 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
MMP23B-210ENST00000512731 IFT172Q9UG01 1749 aa37.29■■■■□ 3.56
MMP23B-210ENST00000512731 LTBP4Q8N2S1 1624 aa37.29■■■■□ 3.56
MMP23B-210ENST00000512731 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa37.27■■■■□ 3.56
MMP23B-210ENST00000512731 RGL3Q3MIN7 710 aa37.27■■■■□ 3.56
MMP23B-210ENST00000512731 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa37.25■■■■□ 3.55
MMP23B-210ENST00000512731 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa37.25■■■■□ 3.55
MMP23B-210ENST00000512731 DIP2AQ14689 1571 aa37.25■■■■□ 3.55
MMP23B-210ENST00000512731 BCANQ96GW7 911 aa37.24■■■■□ 3.55
MMP23B-210ENST00000512731 SLC26A8Q96RN1 970 aa37.23■■■■□ 3.55
MMP23B-210ENST00000512731 VGFO15240 615 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
MMP23B-210ENST00000512731 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
MMP23B-210ENST00000512731 TBX22Q9Y458 520 aa37.16■■■■□ 3.54
MMP23B-210ENST00000512731 CPS1P31327 1500 aa37.16■■■■□ 3.54
MMP23B-210ENST00000512731 STRCP1A6NGW2 1772 aa37.16■■■■□ 3.54
MMP23B-210ENST00000512731 MYOM2P54296 1465 aa37.15■■■■□ 3.54
MMP23B-210ENST00000512731 NWD1Q149M9 1564 aa37.12■■■■□ 3.53
MMP23B-210ENST00000512731 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa37.11■■■■□ 3.53
MMP23B-210ENST00000512731 PIK3R4Q99570 1358 aa37.1■■■■□ 3.53
MMP23B-210ENST00000512731 NRXN1Q9ULB1 1477 aa37.09■■■■□ 3.53
MMP23B-210ENST00000512731 PIK3C2GO75747 1445 aa37.08■■■■□ 3.53
MMP23B-210ENST00000512731 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
MMP23B-210ENST00000512731 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.53
MMP23B-210ENST00000512731 ALKQ9UM73 1620 aa37.06■■■■□ 3.52
MMP23B-210ENST00000512731 CERKQ8TCT0 537 aa37.06■■■■□ 3.52
MMP23B-210ENST00000512731 KCNA6P17658 529 aa37.05■■■■□ 3.52
MMP23B-210ENST00000512731 SIN3AQ96ST3 1273 aa37.05■■■■□ 3.52
MMP23B-210ENST00000512731 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
MMP23B-210ENST00000512731 IQSEC2Q5JU85 1478 aa37.02■■■■□ 3.52
MMP23B-210ENST00000512731 METP08581 1390 aa37.01■■■■□ 3.52
MMP23B-210ENST00000512731 STAC3Q96MF2 364 aa37■■■■□ 3.51
MMP23B-210ENST00000512731 LRRC7Q96NW7 1537 aa37■■■■□ 3.51
MMP23B-210ENST00000512731 DCAF11Q8TEB1 546 aa37■■■■□ 3.51
MMP23B-210ENST00000512731 PTPRUQ92729 1446 aa36.99■■■■□ 3.51
MMP23B-210ENST00000512731 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
MMP23B-210ENST00000512731 LAMC1P11047 1609 aa36.95■■■■□ 3.51
MMP23B-210ENST00000512731 NEUROD1Q13562 356 aa36.95■■■■□ 3.5
MMP23B-210ENST00000512731 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.92■■■■□ 3.5
MMP23B-210ENST00000512731 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.9■■■■□ 3.5
MMP23B-210ENST00000512731 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.9■■■■□ 3.5
MMP23B-210ENST00000512731 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
MMP23B-210ENST00000512731 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
MMP23B-210ENST00000512731 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.87■■■■□ 3.49
MMP23B-210ENST00000512731 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.86■■■■□ 3.49
MMP23B-210ENST00000512731 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.86■■■■□ 3.49
MMP23B-210ENST00000512731 TMEM94Q12767 1356 aa36.86■■■■□ 3.49
MMP23B-210ENST00000512731 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
MMP23B-210ENST00000512731 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.83■■■■□ 3.49
MMP23B-210ENST00000512731 PTCH1Q13635 1447 aa36.81■■■■□ 3.48
MMP23B-210ENST00000512731 ADGRB1O14514 1584 aa36.78■■■■□ 3.48
MMP23B-210ENST00000512731 TONSLQ96HA7 1378 aa36.78■■■■□ 3.48
MMP23B-210ENST00000512731 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.77■■■■□ 3.48
MMP23B-210ENST00000512731 TECPR2O15040 1411 aa36.77■■■■□ 3.48
MMP23B-210ENST00000512731 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
MMP23B-210ENST00000512731 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.76■■■■□ 3.48
MMP23B-210ENST00000512731 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.76■■■■□ 3.48
MMP23B-210ENST00000512731 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
MMP23B-210ENST00000512731 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
MMP23B-210ENST00000512731 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.75■■■■□ 3.47
MMP23B-210ENST00000512731 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
MMP23B-210ENST00000512731 ABCC11Q96J66 1382 aa36.72■■■■□ 3.47
MMP23B-210ENST00000512731 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.72■■■■□ 3.47
MMP23B-210ENST00000512731 FBXO41Q8TF61 875 aa36.72■■■■□ 3.47
MMP23B-210ENST00000512731 MSH6P52701 1360 aa36.67■■■■□ 3.46
MMP23B-210ENST00000512731 STK26Q9P289 416 aa36.66■■■■□ 3.46
MMP23B-210ENST00000512731 UBAP1LF5GYI3 381 aa36.64■■■■□ 3.46
MMP23B-210ENST00000512731 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.62■■■■□ 3.45
MMP23B-210ENST00000512731 DLC1Q96QB1 1528 aa36.62■■■■□ 3.45
MMP23B-210ENST00000512731 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.62■■■■□ 3.45
MMP23B-210ENST00000512731 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.61■■■■□ 3.45
MMP23B-210ENST00000512731 TOM1O60784 492 aa36.61■■■■□ 3.45
MMP23B-210ENST00000512731 C14orf37Q86TY3 774 aa36.61■■■■□ 3.45
MMP23B-210ENST00000512731 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.61■■■■□ 3.45
MMP23B-210ENST00000512731 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
MMP23B-210ENST00000512731 DCCP43146 1447 aa36.59■■■■□ 3.45
MMP23B-210ENST00000512731 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.59■■■■□ 3.45
MMP23B-210ENST00000512731 SIRT1Q96EB6 747 aa36.57■■■■□ 3.44
MMP23B-210ENST00000512731 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.55■■■■□ 3.44
MMP23B-210ENST00000512731 NBPF8Q3BBV2 869 aa36.54■■■■□ 3.44
MMP23B-210ENST00000512731 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.54■■■■□ 3.44
MMP23B-210ENST00000512731 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.54■■■■□ 3.44
MMP23B-210ENST00000512731 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.53■■■■□ 3.44
MMP23B-210ENST00000512731 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.51■■■■□ 3.44
MMP23B-210ENST00000512731 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
MMP23B-210ENST00000512731 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
MMP23B-210ENST00000512731 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.49■■■■□ 3.43
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