RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.19■■□□□ 1.62
ITGA3-211ENST00000508100 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ITGA3-211ENST00000508100 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
ITGA3-211ENST00000508100 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
ITGA3-211ENST00000508100 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.13■■□□□ 1.61
ITGA3-211ENST00000508100 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.13■■□□□ 1.61
ITGA3-211ENST00000508100 MSH6P52701 1360 aa25.12■■□□□ 1.61
ITGA3-211ENST00000508100 ZFYVE9O95405 1425 aa25.12■■□□□ 1.61
ITGA3-211ENST00000508100 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.61
ITGA3-211ENST00000508100 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.1■■□□□ 1.61
ITGA3-211ENST00000508100 ROCK1Q13464 1354 aa25.1■■□□□ 1.61
ITGA3-211ENST00000508100 UNC13BO14795 1591 aa25.1■■□□□ 1.61
ITGA3-211ENST00000508100 NWD1Q149M9 1564 aa25.1■■□□□ 1.61
ITGA3-211ENST00000508100 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.09■■□□□ 1.61
ITGA3-211ENST00000508100 TBX22Q9Y458 520 aa25.08■■□□□ 1.61
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.08■■□□□ 1.6
ITGA3-211ENST00000508100 ITGAEP38570 1179 aa25.07■■□□□ 1.6
ITGA3-211ENST00000508100 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.07■■□□□ 1.6
ITGA3-211ENST00000508100 SLAIN2Q9P270 581 aa25.06■■□□□ 1.6
ITGA3-211ENST00000508100 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ITGA3-211ENST00000508100 C14orf37Q86TY3 774 aa25.04■■□□□ 1.6
ITGA3-211ENST00000508100 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ITGA3-211ENST00000508100 NUP155O75694 1391 aa25.04■■□□□ 1.6
ITGA3-211ENST00000508100 E9PCH4 1651 aa25.03■■□□□ 1.6
ITGA3-211ENST00000508100 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ITGA3-211ENST00000508100 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.01■■□□□ 1.59
ITGA3-211ENST00000508100 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.98■■□□□ 1.59
ITGA3-211ENST00000508100 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
ITGA3-211ENST00000508100 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.96■■□□□ 1.59
ITGA3-211ENST00000508100 PIK3R4Q99570 1358 aa24.95■■□□□ 1.59
ITGA3-211ENST00000508100 DIP2AQ14689 1571 aa24.94■■□□□ 1.58
ITGA3-211ENST00000508100 PHLPP1O60346 1717 aa24.93■■□□□ 1.58
ITGA3-211ENST00000508100 ATF3P18847 181 aa24.93■■□□□ 1.58
ITGA3-211ENST00000508100 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.93■■□□□ 1.58
ITGA3-211ENST00000508100 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.93■■□□□ 1.58
ITGA3-211ENST00000508100 JCADQ9P266 1359 aa24.93■■□□□ 1.58
ITGA3-211ENST00000508100 POTEAQ6S8J7 498 aa24.92■■□□□ 1.58
ITGA3-211ENST00000508100 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.91■■□□□ 1.58
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
ITGA3-211ENST00000508100 TRPM2O94759 1503 aa24.89■■□□□ 1.57
ITGA3-211ENST00000508100 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
ITGA3-211ENST00000508100 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.83■■□□□ 1.57
ITGA3-211ENST00000508100 PTPRUQ92729 1446 aa24.82■■□□□ 1.56
ITGA3-211ENST00000508100 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ITGA3-211ENST00000508100 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.82■■□□□ 1.56
ITGA3-211ENST00000508100 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
ITGA3-211ENST00000508100 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.77■■□□□ 1.56
ITGA3-211ENST00000508100 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ITGA3-211ENST00000508100 BRINP3Q76B58 766 aa24.77■■□□□ 1.56
ITGA3-211ENST00000508100 DCCP43146 1447 aa24.76■■□□□ 1.55
ITGA3-211ENST00000508100 METP08581 1390 aa24.75■■□□□ 1.55
ITGA3-211ENST00000508100 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.75■■□□□ 1.55
ITGA3-211ENST00000508100 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ITGA3-211ENST00000508100 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
ITGA3-211ENST00000508100 TRIM52Q96A61 297 aa24.72■■□□□ 1.55
ITGA3-211ENST00000508100 NAIPQ13075 1403 aa24.71■■□□□ 1.55
ITGA3-211ENST00000508100 LRP6O75581 1613 aa24.71■■□□□ 1.55
ITGA3-211ENST00000508100 CLTCL1P53675 1640 aa24.71■■□□□ 1.55
ITGA3-211ENST00000508100 SHPRHQ149N8 1683 aa24.69■■□□□ 1.54
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ITGA3-211ENST00000508100 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
ITGA3-211ENST00000508100 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
ITGA3-211ENST00000508100 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.68■■□□□ 1.54
ITGA3-211ENST00000508100 MST1RQ04912 1400 aa24.68■■□□□ 1.54
ITGA3-211ENST00000508100 KIF1BO60333 1816 aa24.68■■□□□ 1.54
ITGA3-211ENST00000508100 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
ITGA3-211ENST00000508100 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.66■■□□□ 1.54
ITGA3-211ENST00000508100 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
ITGA3-211ENST00000508100 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.65■■□□□ 1.54
ITGA3-211ENST00000508100 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
ITGA3-211ENST00000508100 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.62■■□□□ 1.53
ITGA3-211ENST00000508100 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
ITGA3-211ENST00000508100 HFM1A2PYH4 1435 aa24.61■■□□□ 1.53
ITGA3-211ENST00000508100 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.61■■□□□ 1.53
ITGA3-211ENST00000508100 RXRBP28702 533 aa24.6■■□□□ 1.53
ITGA3-211ENST00000508100 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.58■■□□□ 1.53
ITGA3-211ENST00000508100 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
ITGA3-211ENST00000508100 AFF2P51816 1311 aa24.57■■□□□ 1.52
ITGA3-211ENST00000508100 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.56■■□□□ 1.52
ITGA3-211ENST00000508100 PTCH1Q13635 1447 aa24.55■■□□□ 1.52
ITGA3-211ENST00000508100 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.54■■□□□ 1.52
ITGA3-211ENST00000508100 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.53■■□□□ 1.52
ITGA3-211ENST00000508100 C8orf37Q96NL8 207 aa24.53■■□□□ 1.52
ITGA3-211ENST00000508100 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.53■■□□□ 1.52
ITGA3-211ENST00000508100 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.51
ITGA3-211ENST00000508100 ORAI2Q96SN7 254 aa24.49■■□□□ 1.51
ITGA3-211ENST00000508100 FOXD1Q16676 465 aa24.48■■□□□ 1.51
ITGA3-211ENST00000508100 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
ITGA3-211ENST00000508100 ADAMTS2O95450 1211 aa24.47■■□□□ 1.51
ITGA3-211ENST00000508100 NGLY1Q96IV0 654 aa24.47■■□□□ 1.51
ITGA3-211ENST00000508100 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
ITGA3-211ENST00000508100 PPLO60437 1756 aa24.47■■□□□ 1.51
ITGA3-211ENST00000508100 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.46■■□□□ 1.51
ITGA3-211ENST00000508100 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
ITGA3-211ENST00000508100 RGL3Q3MIN7 710 aa24.45■■□□□ 1.5
ITGA3-211ENST00000508100 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.44■■□□□ 1.5
ITGA3-211ENST00000508100 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
ITGA3-211ENST00000508100 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.41■■□□□ 1.5
ITGA3-211ENST00000508100 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.41■■□□□ 1.5
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