RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506437.1

ITGA3-208, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA3, Length 3,055 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-208ENST00000506437 PLEKHG5O94827 1062 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGA3-208ENST00000506437 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ITGA3-208ENST00000506437 CFAP70Q5T0N1 1121 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGA3-208ENST00000506437 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGA3-208ENST00000506437 TMEM132EQ6IEE7 984 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGA3-208ENST00000506437 MYO5BQ9ULV0 1848 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGA3-208ENST00000506437 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ITGA3-208ENST00000506437 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ITGA3-208ENST00000506437 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGA3-208ENST00000506437 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGA3-208ENST00000506437 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGA3-208ENST00000506437 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGA3-208ENST00000506437 TNRQ92752 1358 aa15.9■□□□□ 0.14
ITGA3-208ENST00000506437 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
ITGA3-208ENST00000506437 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa15.9■□□□□ 0.14
ITGA3-208ENST00000506437 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
ITGA3-208ENST00000506437 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.9■□□□□ 0.14
ITGA3-208ENST00000506437 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.89■□□□□ 0.13
ITGA3-208ENST00000506437 KIF1BO60333 1816 aa15.89■□□□□ 0.13
ITGA3-208ENST00000506437 C3P01024 1663 aa15.89■□□□□ 0.13
ITGA3-208ENST00000506437 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
ITGA3-208ENST00000506437 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
ITGA3-208ENST00000506437 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
ITGA3-208ENST00000506437 STK26Q9P289 416 aa15.87■□□□□ 0.13
ITGA3-208ENST00000506437 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.13
ITGA3-208ENST00000506437 PIK3C2BO00750 1634 aa15.86■□□□□ 0.13
ITGA3-208ENST00000506437 PRAG1Q86YV5 1406 aa15.85■□□□□ 0.13
ITGA3-208ENST00000506437 HSPA2P54652 639 aa15.84■□□□□ 0.13
ITGA3-208ENST00000506437 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
ITGA3-208ENST00000506437 LTKP29376 864 aa15.84■□□□□ 0.13
ITGA3-208ENST00000506437 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.83■□□□□ 0.12
ITGA3-208ENST00000506437 SLC26A8Q96RN1 970 aa15.83■□□□□ 0.12
ITGA3-208ENST00000506437 TRAK1Q9UPV9 953 aa15.83■□□□□ 0.12
ITGA3-208ENST00000506437 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa15.83■□□□□ 0.12
ITGA3-208ENST00000506437 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.82■□□□□ 0.12
ITGA3-208ENST00000506437 FKBP8Q14318 412 aa15.82■□□□□ 0.12
ITGA3-208ENST00000506437 ADGRB3O60242 1522 aa15.82■□□□□ 0.12
ITGA3-208ENST00000506437 SLC24A1O60721 1099 aa15.81■□□□□ 0.12
ITGA3-208ENST00000506437 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
ITGA3-208ENST00000506437 IL27Q8NEV9 243 aa15.81■□□□□ 0.12
ITGA3-208ENST00000506437 A2ML1A8K2U0 1454 aa15.81■□□□□ 0.12
ITGA3-208ENST00000506437 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.81■□□□□ 0.12
ITGA3-208ENST00000506437 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa15.8■□□□□ 0.12
ITGA3-208ENST00000506437 ADAMTSL3P82987 1691 aa15.8■□□□□ 0.12
ITGA3-208ENST00000506437 PTPRMP28827 1452 aa15.8■□□□□ 0.12
ITGA3-208ENST00000506437 USP47Q96K76 1375 aa15.79■□□□□ 0.12
ITGA3-208ENST00000506437 VGFO15240 615 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
ITGA3-208ENST00000506437 RIMS2Q9UQ26 1411 aa15.78■□□□□ 0.12
ITGA3-208ENST00000506437 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
ITGA3-208ENST00000506437 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa15.76■□□□□ 0.11
ITGA3-208ENST00000506437 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.75■□□□□ 0.11
ITGA3-208ENST00000506437 PKNOX2Q96KN3 472 aa15.75■□□□□ 0.11
ITGA3-208ENST00000506437 PPLO60437 1756 aa15.74■□□□□ 0.11
ITGA3-208ENST00000506437 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa15.73■□□□□ 0.11
ITGA3-208ENST00000506437 TMEM2Q9UHN6 1383 aa15.73■□□□□ 0.11
ITGA3-208ENST00000506437 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.73■□□□□ 0.11
ITGA3-208ENST00000506437 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.73■□□□□ 0.11
ITGA3-208ENST00000506437 NBR1Q14596 966 aa15.73■□□□□ 0.11
ITGA3-208ENST00000506437 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
ITGA3-208ENST00000506437 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
ITGA3-208ENST00000506437 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.72■□□□□ 0.11
ITGA3-208ENST00000506437 UBR1Q8IWV7 1749 aa15.72■□□□□ 0.11
ITGA3-208ENST00000506437 WAPLQ7Z5K2 1190 aa15.71■□□□□ 0.11
ITGA3-208ENST00000506437 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.71■□□□□ 0.11
ITGA3-208ENST00000506437 PIK3C2GO75747 1445 aa15.71■□□□□ 0.11
ITGA3-208ENST00000506437 EID1Q9Y6B2 187 aa15.71■□□□□ 0.11
ITGA3-208ENST00000506437 IFT172Q9UG01 1749 aa15.71■□□□□ 0.1
ITGA3-208ENST00000506437 MYO3AQ8NEV4 1616 aa15.7■□□□□ 0.1
ITGA3-208ENST00000506437 METP08581 1390 aa15.69■□□□□ 0.1
ITGA3-208ENST00000506437 ZFYVE9O95405 1425 aa15.68■□□□□ 0.1
ITGA3-208ENST00000506437 NUTM2FA1L443 756 aa15.68■□□□□ 0.1
ITGA3-208ENST00000506437 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
ITGA3-208ENST00000506437 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
ITGA3-208ENST00000506437 NLRP1Q9C000 1473 aa15.67■□□□□ 0.1
ITGA3-208ENST00000506437 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
ITGA3-208ENST00000506437 MYOM2P54296 1465 aa15.67■□□□□ 0.1
ITGA3-208ENST00000506437 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.66■□□□□ 0.1
ITGA3-208ENST00000506437 PRAM1Q96QH2 718 aa15.66■□□□□ 0.1
ITGA3-208ENST00000506437 TESK2Q96S53 571 aa15.65■□□□□ 0.1
ITGA3-208ENST00000506437 DISP3Q9P2K9 1392 aa15.64■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 ANKLE2Q86XL3 938 aa15.64■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP15.64■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 POGKQ9P215 609 aa15.64■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa15.64■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 NRXN1Q9ULB1 1477 aa15.63■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 ERICH6BQ5W0A0 696 aa15.63■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 ALKQ9UM73 1620 aa15.63■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa15.62■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 IQGAP1P46940 1657 aa15.62■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 GPRASP1Q5JY77 1395 aa15.62■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 CABP2Q9NPB3 220 aa15.6■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 ADGRB1O14514 1584 aa15.6■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 CCDC7Q96M83 1385 aa15.59■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 STAC3Q96MF2 364 aa15.59■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa15.59■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 PODXL2Q9NZ53 605 aa15.59■□□□□ 0.09
ITGA3-208ENST00000506437 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms