RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491075.1

CLIP2-208, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein 2, human

TSL 1 (best)

Gene CLIP2, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLIP2-208	ENST00000491075	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.21	■■■□□ 2.75
CLIP2-208	ENST00000491075	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.19	■■■□□ 2.74
CLIP2-208	ENST00000491075	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.17	■■■□□ 2.74
CLIP2-208	ENST00000491075	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
CLIP2-208	ENST00000491075	MSH6	P52701	1360 aa		32.16	■■■□□ 2.74
CLIP2-208	ENST00000491075	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.16	■■■□□ 2.74
CLIP2-208	ENST00000491075	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
CLIP2-208	ENST00000491075	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.14	■■■□□ 2.74
CLIP2-208	ENST00000491075	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.13	■■■□□ 2.73
CLIP2-208	ENST00000491075	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		32.13	■■■□□ 2.73
CLIP2-208	ENST00000491075	PHLPP1	O60346	1717 aa		32.12	■■■□□ 2.73
CLIP2-208	ENST00000491075	UNC13B	O14795	1591 aa		32.1	■■■□□ 2.73
CLIP2-208	ENST00000491075	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.09	■■■□□ 2.73
CLIP2-208	ENST00000491075	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
CLIP2-208	ENST00000491075	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
CLIP2-208	ENST00000491075	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
CLIP2-208	ENST00000491075	POTEA	Q6S8J7	498 aa		32.06	■■■□□ 2.72
CLIP2-208	ENST00000491075	SLAIN2	Q9P270	581 aa		32.05	■■■□□ 2.72
CLIP2-208	ENST00000491075	DIP2A	Q14689	1571 aa		32.02	■■■□□ 2.72
CLIP2-208	ENST00000491075		E9PCH4	1651 aa		32.02	■■■□□ 2.72
CLIP2-208	ENST00000491075	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		32.01	■■■□□ 2.72
CLIP2-208	ENST00000491075	JCAD	Q9P266	1359 aa		32.01	■■■□□ 2.71
CLIP2-208	ENST00000491075	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
CLIP2-208	ENST00000491075	TBX22	Q9Y458	520 aa		31.99	■■■□□ 2.71
CLIP2-208	ENST00000491075	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	31.98	■■■□□ 2.71
CLIP2-208	ENST00000491075	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		31.97	■■■□□ 2.71
CLIP2-208	ENST00000491075	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
CLIP2-208	ENST00000491075	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		31.93	■■■□□ 2.7
CLIP2-208	ENST00000491075	PIK3R4	Q99570	1358 aa		31.93	■■■□□ 2.7
CLIP2-208	ENST00000491075	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
CLIP2-208	ENST00000491075	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
CLIP2-208	ENST00000491075	ROCK1	Q13464	1354 aa		31.9	■■■□□ 2.7
CLIP2-208	ENST00000491075	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
CLIP2-208	ENST00000491075	C14orf37	Q86TY3	774 aa		31.89	■■■□□ 2.7
CLIP2-208	ENST00000491075	TRPM2	O94759	1503 aa		31.89	■■■□□ 2.7
CLIP2-208	ENST00000491075	SHPRH	Q149N8	1683 aa		31.86	■■■□□ 2.69
CLIP2-208	ENST00000491075	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		31.86	■■■□□ 2.69
CLIP2-208	ENST00000491075	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		31.85	■■■□□ 2.69
CLIP2-208	ENST00000491075	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		31.84	■■■□□ 2.69
CLIP2-208	ENST00000491075	LRP6	O75581	1613 aa		31.83	■■■□□ 2.69
CLIP2-208	ENST00000491075	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
CLIP2-208	ENST00000491075	ATF3	P18847	181 aa		31.82	■■■□□ 2.68
CLIP2-208	ENST00000491075	NUP155	O75694	1391 aa		31.78	■■■□□ 2.68
CLIP2-208	ENST00000491075	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		31.77	■■■□□ 2.68
CLIP2-208	ENST00000491075	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
CLIP2-208	ENST00000491075	DCC	P43146	1447 aa		31.76	■■■□□ 2.68
CLIP2-208	ENST00000491075	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		31.76	■■■□□ 2.67
CLIP2-208	ENST00000491075	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
CLIP2-208	ENST00000491075	PTPRU	Q92729	1446 aa		31.75	■■■□□ 2.67
CLIP2-208	ENST00000491075	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		31.75	■■■□□ 2.67
CLIP2-208	ENST00000491075	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		31.75	■■■□□ 2.67
CLIP2-208	ENST00000491075	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
CLIP2-208	ENST00000491075	BRINP3	Q76B58	766 aa		31.69	■■■□□ 2.66
CLIP2-208	ENST00000491075	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		31.69	■■■□□ 2.66
CLIP2-208	ENST00000491075	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		31.67	■■■□□ 2.66
CLIP2-208	ENST00000491075	MST1R	Q04912	1400 aa		31.63	■■■□□ 2.65
CLIP2-208	ENST00000491075	ITGAE	P38570	1179 aa		31.62	■■■□□ 2.65
CLIP2-208	ENST00000491075	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		31.62	■■■□□ 2.65
CLIP2-208	ENST00000491075	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	31.59	■■■□□ 2.65
CLIP2-208	ENST00000491075	TRIM52	Q96A61	297 aa		31.59	■■■□□ 2.65
CLIP2-208	ENST00000491075	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		31.58	■■■□□ 2.65
CLIP2-208	ENST00000491075	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	31.58	■■■□□ 2.65
CLIP2-208	ENST00000491075	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		31.58	■■■□□ 2.65
CLIP2-208	ENST00000491075	MET	P08581	1390 aa		31.57	■■■□□ 2.64
CLIP2-208	ENST00000491075	CLTCL1	P53675	1640 aa		31.57	■■■□□ 2.64
CLIP2-208	ENST00000491075	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		31.57	■■■□□ 2.64
CLIP2-208	ENST00000491075	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	31.56	■■■□□ 2.64
CLIP2-208	ENST00000491075	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	31.56	■■■□□ 2.64
CLIP2-208	ENST00000491075	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	31.56	■■■□□ 2.64
CLIP2-208	ENST00000491075	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	31.56	■■■□□ 2.64
CLIP2-208	ENST00000491075	KIF1B	O60333	1816 aa		31.55	■■■□□ 2.64
CLIP2-208	ENST00000491075	RXRB	P28702	533 aa		31.55	■■■□□ 2.64
CLIP2-208	ENST00000491075	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	31.51	■■■□□ 2.63
CLIP2-208	ENST00000491075	AFF2	P51816	1311 aa		31.5	■■■□□ 2.63
CLIP2-208	ENST00000491075	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		31.46	■■■□□ 2.63
CLIP2-208	ENST00000491075	LAMC1	P11047	1609 aa		31.46	■■■□□ 2.63
CLIP2-208	ENST00000491075	PTCH1	Q13635	1447 aa		31.43	■■■□□ 2.62
CLIP2-208	ENST00000491075	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		31.4	■■■□□ 2.62
CLIP2-208	ENST00000491075	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
CLIP2-208	ENST00000491075	C8orf37	Q96NL8	207 aa		31.4	■■■□□ 2.62
CLIP2-208	ENST00000491075	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	31.37	■■■□□ 2.61
CLIP2-208	ENST00000491075	RGS12	O14924	1447 aa		31.37	■■■□□ 2.61
CLIP2-208	ENST00000491075	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		31.37	■■■□□ 2.61
CLIP2-208	ENST00000491075	NAIP	Q13075	1403 aa		31.36	■■■□□ 2.61
CLIP2-208	ENST00000491075	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	31.35	■■■□□ 2.61
CLIP2-208	ENST00000491075	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	31.34	■■■□□ 2.61
CLIP2-208	ENST00000491075	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	31.34	■■■□□ 2.61
CLIP2-208	ENST00000491075	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
CLIP2-208	ENST00000491075	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		31.32	■■■□□ 2.6
CLIP2-208	ENST00000491075	PPL	O60437	1756 aa		31.32	■■■□□ 2.6
CLIP2-208	ENST00000491075	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
CLIP2-208	ENST00000491075	NGLY1	Q96IV0	654 aa		31.28	■■■□□ 2.6
CLIP2-208	ENST00000491075	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		31.27	■■■□□ 2.6
CLIP2-208	ENST00000491075	HFM1	A2PYH4	1435 aa		31.27	■■■□□ 2.6
CLIP2-208	ENST00000491075	ADAMTS2	O95450	1211 aa		31.27	■■■□□ 2.6
CLIP2-208	ENST00000491075	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
CLIP2-208	ENST00000491075	ORAI2	Q96SN7	254 aa		31.25	■■■□□ 2.59
CLIP2-208	ENST00000491075	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		31.23	■■■□□ 2.59
CLIP2-208	ENST00000491075	USP21	Q9UK80	565 aa		31.18	■■■□□ 2.58
CLIP2-208	ENST00000491075	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		31.17	■■■□□ 2.58

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