RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489485.5

CLDN11-209, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 2

Gene CLDN11, Length 1,854 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-209ENST00000489485 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.53■□□□□ 0.88
CLDN11-209ENST00000489485 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.53■□□□□ 0.88
CLDN11-209ENST00000489485 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CLDN11-209ENST00000489485 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CLDN11-209ENST00000489485 EID1Q9Y6B2 187 aa20.52■□□□□ 0.88
CLDN11-209ENST00000489485 SLIT1O75093 1534 aa20.52■□□□□ 0.88
CLDN11-209ENST00000489485 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.52■□□□□ 0.88
CLDN11-209ENST00000489485 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
CLDN11-209ENST00000489485 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.52■□□□□ 0.87
CLDN11-209ENST00000489485 PPLO60437 1756 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN11-209ENST00000489485 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN11-209ENST00000489485 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN11-209ENST00000489485 IFT172Q9UG01 1749 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN11-209ENST00000489485 ZFYVE9O95405 1425 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN11-209ENST00000489485 LTKP29376 864 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN11-209ENST00000489485 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
CLDN11-209ENST00000489485 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CLDN11-209ENST00000489485 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CLDN11-209ENST00000489485 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN11-209ENST00000489485 BCANQ96GW7 911 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN11-209ENST00000489485 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CLDN11-209ENST00000489485 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CLDN11-209ENST00000489485 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.45■□□□□ 0.87
CLDN11-209ENST00000489485 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.45■□□□□ 0.86
CLDN11-209ENST00000489485 STAC3Q96MF2 364 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN11-209ENST00000489485 MYOM2P54296 1465 aa20.43■□□□□ 0.86
CLDN11-209ENST00000489485 STRCQ7RTU9 1775 aa20.41■□□□□ 0.86
CLDN11-209ENST00000489485 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.39■□□□□ 0.85
CLDN11-209ENST00000489485 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CLDN11-209ENST00000489485 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.37■□□□□ 0.85
CLDN11-209ENST00000489485 PIK3C2GO75747 1445 aa20.37■□□□□ 0.85
CLDN11-209ENST00000489485 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.37■□□□□ 0.85
CLDN11-209ENST00000489485 IQGAP1P46940 1657 aa20.37■□□□□ 0.85
CLDN11-209ENST00000489485 MED14O60244 1454 aa20.37■□□□□ 0.85
CLDN11-209ENST00000489485 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.37■□□□□ 0.85
CLDN11-209ENST00000489485 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.35■□□□□ 0.85
CLDN11-209ENST00000489485 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.35■□□□□ 0.85
CLDN11-209ENST00000489485 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.34■□□□□ 0.85
CLDN11-209ENST00000489485 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.34■□□□□ 0.85
CLDN11-209ENST00000489485 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CLDN11-209ENST00000489485 ALKQ9UM73 1620 aa20.32■□□□□ 0.84
CLDN11-209ENST00000489485 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.32■□□□□ 0.84
CLDN11-209ENST00000489485 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.31■□□□□ 0.84
CLDN11-209ENST00000489485 LAMC1P11047 1609 aa20.3■□□□□ 0.84
CLDN11-209ENST00000489485 TBX22Q9Y458 520 aa20.29■□□□□ 0.84
CLDN11-209ENST00000489485 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.29■□□□□ 0.84
CLDN11-209ENST00000489485 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.28■□□□□ 0.84
CLDN11-209ENST00000489485 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.28■□□□□ 0.84
CLDN11-209ENST00000489485 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CLDN11-209ENST00000489485 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.28■□□□□ 0.84
CLDN11-209ENST00000489485 DIP2AQ14689 1571 aa20.27■□□□□ 0.84
CLDN11-209ENST00000489485 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CLDN11-209ENST00000489485 METP08581 1390 aa20.26■□□□□ 0.83
CLDN11-209ENST00000489485 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.23■□□□□ 0.83
CLDN11-209ENST00000489485 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.22■□□□□ 0.83
CLDN11-209ENST00000489485 STK26Q9P289 416 aa20.22■□□□□ 0.83
CLDN11-209ENST00000489485 ADGRB1O14514 1584 aa20.21■□□□□ 0.83
CLDN11-209ENST00000489485 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.21■□□□□ 0.83
CLDN11-209ENST00000489485 PIK3R4Q99570 1358 aa20.2■□□□□ 0.82
CLDN11-209ENST00000489485 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CLDN11-209ENST00000489485 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.2■□□□□ 0.82
CLDN11-209ENST00000489485 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CLDN11-209ENST00000489485 PTPRUQ92729 1446 aa20.18■□□□□ 0.82
CLDN11-209ENST00000489485 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.18■□□□□ 0.82
CLDN11-209ENST00000489485 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CLDN11-209ENST00000489485 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.16■□□□□ 0.82
CLDN11-209ENST00000489485 KCNA6P17658 529 aa20.16■□□□□ 0.82
CLDN11-209ENST00000489485 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CLDN11-209ENST00000489485 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.13■□□□□ 0.81
CLDN11-209ENST00000489485 ABCC11Q96J66 1382 aa20.13■□□□□ 0.81
CLDN11-209ENST00000489485 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CLDN11-209ENST00000489485 NWD1Q149M9 1564 aa20.12■□□□□ 0.81
CLDN11-209ENST00000489485 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.11■□□□□ 0.81
CLDN11-209ENST00000489485 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-209ENST00000489485 TECPR2O15040 1411 aa20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-209ENST00000489485 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-209ENST00000489485 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.09■□□□□ 0.81
CLDN11-209ENST00000489485 PRAM1Q96QH2 718 aa20.09■□□□□ 0.81
CLDN11-209ENST00000489485 POGKQ9P215 609 aa20.09■□□□□ 0.81
CLDN11-209ENST00000489485 USP47Q96K76 1375 aa20.09■□□□□ 0.81
CLDN11-209ENST00000489485 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
CLDN11-209ENST00000489485 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CLDN11-209ENST00000489485 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CLDN11-209ENST00000489485 CPS1P31327 1500 aa20.09■□□□□ 0.81
CLDN11-209ENST00000489485 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CLDN11-209ENST00000489485 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CLDN11-209ENST00000489485 PTCH1Q13635 1447 aa20.08■□□□□ 0.8
CLDN11-209ENST00000489485 DLC1Q96QB1 1528 aa20.07■□□□□ 0.8
CLDN11-209ENST00000489485 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
CLDN11-209ENST00000489485 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.05■□□□□ 0.8
CLDN11-209ENST00000489485 SIRT1Q96EB6 747 aa20.05■□□□□ 0.8
CLDN11-209ENST00000489485 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.05■□□□□ 0.8
CLDN11-209ENST00000489485 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CLDN11-209ENST00000489485 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.04■□□□□ 0.8
CLDN11-209ENST00000489485 C14orf37Q86TY3 774 aa20.04■□□□□ 0.8
CLDN11-209ENST00000489485 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CLDN11-209ENST00000489485 TMEM94Q12767 1356 aa20.02■□□□□ 0.8
CLDN11-209ENST00000489485 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CLDN11-209ENST00000489485 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.02■□□□□ 0.8
CLDN11-209ENST00000489485 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms