RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 FAM117AQ9C073 453 aa10.39□□□□□ -0.75
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CCL20-204ENST00000489160 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CCL20-204ENST00000489160 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CCL20-204ENST00000489160 TMUB1Q9BVT8 246 aa10.38□□□□□ -0.75
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CCL20-204ENST00000489160 HDGFP51858 240 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
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CCL20-204ENST00000489160 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.22□□□□□ -0.77
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CCL20-204ENST00000489160 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CCL20-204ENST00000489160 DDX11L8A8MPP1 907 aa10.18□□□□□ -0.78
CCL20-204ENST00000489160 CD46P15529 392 aa10.18□□□□□ -0.78
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CCL20-204ENST00000489160 SPIRE2Q8WWL2 714 aa10.12□□□□□ -0.79
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CCL20-204ENST00000489160 APLP1P51693 650 aa10.08□□□□□ -0.8
CCL20-204ENST00000489160 KDM4AO75164 1064 aa10.07□□□□□ -0.8
CCL20-204ENST00000489160 USP46P62068 366 aa10.07□□□□□ -0.8
CCL20-204ENST00000489160 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.07□□□□□ -0.8
CCL20-204ENST00000489160 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.8
CCL20-204ENST00000489160 SPTLC1O15269 473 aa10.06□□□□□ -0.8
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CCL20-204ENST00000489160 FLIIQ13045 1269 aa10.05□□□□□ -0.8
CCL20-204ENST00000489160 TUSC1Q2TAM9 212 aa10.05□□□□□ -0.8
CCL20-204ENST00000489160 GRIPAP1Q4V328 841 aa10.05□□□□□ -0.8
CCL20-204ENST00000489160 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CCL20-204ENST00000489160 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.04□□□□□ -0.8
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CCL20-204ENST00000489160 ATP6V1AP38606 617 aa10.03□□□□□ -0.8
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CCL20-204ENST00000489160 NDUFV2P19404 249 aa10.01□□□□□ -0.81
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CCL20-204ENST00000489160 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.98□□□□□ -0.81
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CCL20-204ENST00000489160 MTRQ99707 1265 aa9.98□□□□□ -0.81
CCL20-204ENST00000489160 FDX1P10109 184 aa9.97□□□□□ -0.81
CCL20-204ENST00000489160 RFC5P40937 340 aa9.97□□□□□ -0.81
CCL20-204ENST00000489160 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CCL20-204ENST00000489160 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.97□□□□□ -0.81
CCL20-204ENST00000489160 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CCL20-204ENST00000489160 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.97□□□□□ -0.81
CCL20-204ENST00000489160 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.97□□□□□ -0.81
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