RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 ZFYVE9O95405 1425 aa34.38■■■■□ 3.09
POLR2F-211ENST00000488684 TMEM94Q12767 1356 aa34.38■■■■□ 3.09
POLR2F-211ENST00000488684 E9PCH4 1651 aa34.37■■■■□ 3.09
POLR2F-211ENST00000488684 BCANQ96GW7 911 aa34.36■■■■□ 3.09
POLR2F-211ENST00000488684 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.36■■■■□ 3.09
POLR2F-211ENST00000488684 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
POLR2F-211ENST00000488684 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
POLR2F-211ENST00000488684 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.34■■■■□ 3.09
POLR2F-211ENST00000488684 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.33■■■■□ 3.09
POLR2F-211ENST00000488684 NUP155O75694 1391 aa34.31■■■■□ 3.08
POLR2F-211ENST00000488684 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa34.31■■■■□ 3.08
POLR2F-211ENST00000488684 CHGAP10645 457 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
POLR2F-211ENST00000488684 NWD1Q149M9 1564 aa34.29■■■■□ 3.08
POLR2F-211ENST00000488684 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
POLR2F-211ENST00000488684 HDGFP51858 240 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
POLR2F-211ENST00000488684 FAM135BQ49AJ0 1406 aa34.26■■■■□ 3.07
POLR2F-211ENST00000488684 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
POLR2F-211ENST00000488684 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
POLR2F-211ENST00000488684 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP34.22■■■■□ 3.07
POLR2F-211ENST00000488684 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
POLR2F-211ENST00000488684 TBX22Q9Y458 520 aa34.21■■■■□ 3.07
POLR2F-211ENST00000488684 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
POLR2F-211ENST00000488684 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa34.16■■■■□ 3.06
POLR2F-211ENST00000488684 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa34.14■■■■□ 3.06
POLR2F-211ENST00000488684 MSH6P52701 1360 aa34.13■■■■□ 3.05
POLR2F-211ENST00000488684 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
POLR2F-211ENST00000488684 SLAIN2Q9P270 581 aa34.09■■■■□ 3.05
POLR2F-211ENST00000488684 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.06■■■■□ 3.04
POLR2F-211ENST00000488684 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
POLR2F-211ENST00000488684 DIP2AQ14689 1571 aa34.05■■■■□ 3.04
POLR2F-211ENST00000488684 PIK3R4Q99570 1358 aa34.04■■■■□ 3.04
POLR2F-211ENST00000488684 NAIPQ13075 1403 aa34.02■■■■□ 3.04
POLR2F-211ENST00000488684 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa34.02■■■■□ 3.04
POLR2F-211ENST00000488684 PTPRUQ92729 1446 aa34■■■■□ 3.03
POLR2F-211ENST00000488684 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa33.99■■■■□ 3.03
POLR2F-211ENST00000488684 C14orf37Q86TY3 774 aa33.97■■■■□ 3.03
POLR2F-211ENST00000488684 TRPM2O94759 1503 aa33.97■■■■□ 3.03
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
POLR2F-211ENST00000488684 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa33.95■■■■□ 3.03
POLR2F-211ENST00000488684 C19orf44Q9H6X5 657 aa33.94■■■■□ 3.02
POLR2F-211ENST00000488684 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
POLR2F-211ENST00000488684 CLTCL1P53675 1640 aa33.93■■■■□ 3.02
POLR2F-211ENST00000488684 PHLPP1O60346 1717 aa33.93■■■■□ 3.02
POLR2F-211ENST00000488684 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa33.91■■■■□ 3.02
POLR2F-211ENST00000488684 CADPS2Q86UW7 1296 aa33.89■■■■□ 3.02
POLR2F-211ENST00000488684 ATF3P18847 181 aa33.88■■■■□ 3.01
POLR2F-211ENST00000488684 METP08581 1390 aa33.86■■■■□ 3.01
POLR2F-211ENST00000488684 HFM1A2PYH4 1435 aa33.86■■■■□ 3.01
POLR2F-211ENST00000488684 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa33.85■■■■□ 3.01
POLR2F-211ENST00000488684 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
POLR2F-211ENST00000488684 TRIM52Q96A61 297 aa33.85■■■■□ 3.01
POLR2F-211ENST00000488684 JCADQ9P266 1359 aa33.85■■■■□ 3.01
POLR2F-211ENST00000488684 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
POLR2F-211ENST00000488684 POTEAQ6S8J7 498 aa33.83■■■■□ 3.01
POLR2F-211ENST00000488684 KIF1BO60333 1816 aa33.81■■■■□ 3
POLR2F-211ENST00000488684 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
POLR2F-211ENST00000488684 BRINP3Q76B58 766 aa33.76■■■□□ 2.99
POLR2F-211ENST00000488684 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
POLR2F-211ENST00000488684 DCCP43146 1447 aa33.75■■■□□ 2.99
POLR2F-211ENST00000488684 VGFO15240 615 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
POLR2F-211ENST00000488684 MST1RQ04912 1400 aa33.69■■■□□ 2.98
POLR2F-211ENST00000488684 LRP6O75581 1613 aa33.68■■■□□ 2.98
POLR2F-211ENST00000488684 FOXD1Q16676 465 aa33.67■■■□□ 2.98
POLR2F-211ENST00000488684 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa33.67■■■□□ 2.98
POLR2F-211ENST00000488684 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa33.65■■■□□ 2.98
POLR2F-211ENST00000488684 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa33.65■■■□□ 2.98
POLR2F-211ENST00000488684 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa33.63■■■□□ 2.97
POLR2F-211ENST00000488684 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
POLR2F-211ENST00000488684 SHPRHQ149N8 1683 aa33.63■■■□□ 2.97
POLR2F-211ENST00000488684 NALCNQ8IZF0 1738 aa33.62■■■□□ 2.97
POLR2F-211ENST00000488684 PPLO60437 1756 aa33.58■■■□□ 2.97
POLR2F-211ENST00000488684 ROBO2Q9HCK4 1378 aa33.58■■■□□ 2.97
POLR2F-211ENST00000488684 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
POLR2F-211ENST00000488684 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
POLR2F-211ENST00000488684 NHSL1Q5SYE7 1610 aa33.56■■■□□ 2.96
POLR2F-211ENST00000488684 PTCH1Q13635 1447 aa33.55■■■□□ 2.96
POLR2F-211ENST00000488684 SETD5Q9C0A6 1442 aa33.55■■■□□ 2.96
POLR2F-211ENST00000488684 MPHOSPH9Q99550 1183 aa33.53■■■□□ 2.96
POLR2F-211ENST00000488684 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP33.52■■■□□ 2.96
POLR2F-211ENST00000488684 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP33.52■■■□□ 2.96
POLR2F-211ENST00000488684 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP33.52■■■□□ 2.96
POLR2F-211ENST00000488684 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
POLR2F-211ENST00000488684 PRAG1Q86YV5 1406 aa33.5■■■□□ 2.95
POLR2F-211ENST00000488684 C1orf167Q5SNV9 1468 aa33.5■■■□□ 2.95
POLR2F-211ENST00000488684 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa33.49■■■□□ 2.95
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC144AA2RUR9 1427 aa33.48■■■□□ 2.95
POLR2F-211ENST00000488684 RGL3Q3MIN7 710 aa33.48■■■□□ 2.95
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
POLR2F-211ENST00000488684 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa33.46■■■□□ 2.95
POLR2F-211ENST00000488684 ORAI2Q96SN7 254 aa33.45■■■□□ 2.95
POLR2F-211ENST00000488684 PNPLA6Q8IY17 1366 aa33.41■■■□□ 2.94
POLR2F-211ENST00000488684 IFT172Q9UG01 1749 aa33.38■■■□□ 2.93
POLR2F-211ENST00000488684 LAMC1P11047 1609 aa33.38■■■□□ 2.93
POLR2F-211ENST00000488684 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa33.37■■■□□ 2.93
POLR2F-211ENST00000488684 AFF2P51816 1311 aa33.36■■■□□ 2.93
POLR2F-211ENST00000488684 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP33.35■■■□□ 2.93
POLR2F-211ENST00000488684 STK26Q9P289 416 aa33.35■■■□□ 2.93
POLR2F-211ENST00000488684 RXRBP28702 533 aa33.32■■■□□ 2.92
POLR2F-211ENST00000488684 TMEM132EQ6IEE7 984 aa33.32■■■□□ 2.92
POLR2F-211ENST00000488684 WAPLQ7Z5K2 1190 aa33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms