RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 RGL3Q3MIN7 710 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 USP47Q96K76 1375 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 SYNMO15061 1565 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 CERKQ8TCT0 537 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 IQSEC2Q5JU85 1478 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 PIK3C2BO00750 1634 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 STAC3Q96MF2 364 aa14.54□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 MED14O60244 1454 aa14.54□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 LAMC1P11047 1609 aa14.54□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 IQGAP1P46940 1657 aa14.54□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.53□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF1BO60333 1816 aa14.52□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 GPRASP1Q5JY77 1395 aa14.52□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 WASHC2AQ641Q2 1341 aa14.52□□□□□ -0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 ADGRB3O60242 1522 aa14.51□□□□□ -0.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SLIT1O75093 1534 aa14.51□□□□□ -0.09
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.51□□□□□ -0.09
GTPBP1-211ENST00000487538 NOS1P29475 1434 aa14.51□□□□□ -0.09
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC7Q96M83 1385 aa14.51□□□□□ -0.09
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
GTPBP1-211ENST00000487538 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GTPBP1-211ENST00000487538 MYOM2P54296 1465 aa14.5□□□□□ -0.09
GTPBP1-211ENST00000487538 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
GTPBP1-211ENST00000487538 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.47□□□□□ -0.09
GTPBP1-211ENST00000487538 IFT172Q9UG01 1749 aa14.47□□□□□ -0.09
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF7Q2M1P5 1343 aa14.46□□□□□ -0.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
GTPBP1-211ENST00000487538 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
GTPBP1-211ENST00000487538 CPS1P31327 1500 aa14.46□□□□□ -0.1
GTPBP1-211ENST00000487538 NBPF1Q3BBV0 1214 aa14.45□□□□□ -0.1
GTPBP1-211ENST00000487538 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.45□□□□□ -0.1
GTPBP1-211ENST00000487538 ANP32CO43423 234 aa14.44□□□□□ -0.1
GTPBP1-211ENST00000487538 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
GTPBP1-211ENST00000487538 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.44□□□□□ -0.1
GTPBP1-211ENST00000487538 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa14.43□□□□□ -0.1
GTPBP1-211ENST00000487538 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa14.42□□□□□ -0.1
GTPBP1-211ENST00000487538 ALKQ9UM73 1620 aa14.42□□□□□ -0.1
GTPBP1-211ENST00000487538 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.42□□□□□ -0.1
GTPBP1-211ENST00000487538 PPLO60437 1756 aa14.42□□□□□ -0.1
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa14.41□□□□□ -0.1
GTPBP1-211ENST00000487538 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.41□□□□□ -0.1
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.41□□□□□ -0.1
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.4□□□□□ -0.1
GTPBP1-211ENST00000487538 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
GTPBP1-211ENST00000487538 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.39□□□□□ -0.11
GTPBP1-211ENST00000487538 CCER2I3L3R5 266 aa14.38□□□□□ -0.11
GTPBP1-211ENST00000487538 ZFYVE9O95405 1425 aa14.38□□□□□ -0.11
GTPBP1-211ENST00000487538 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa14.37□□□□□ -0.11
GTPBP1-211ENST00000487538 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
GTPBP1-211ENST00000487538 LTKP29376 864 aa14.37□□□□□ -0.11
GTPBP1-211ENST00000487538 IDI1Q13907 227 aa14.37□□□□□ -0.11
GTPBP1-211ENST00000487538 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.36□□□□□ -0.11
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
GTPBP1-211ENST00000487538 NWD1Q149M9 1564 aa14.36□□□□□ -0.11
GTPBP1-211ENST00000487538 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa14.36□□□□□ -0.11
GTPBP1-211ENST00000487538 PIK3C2GO75747 1445 aa14.36□□□□□ -0.11
GTPBP1-211ENST00000487538 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.34□□□□□ -0.11
GTPBP1-211ENST00000487538 TESK2Q96S53 571 aa14.34□□□□□ -0.11
GTPBP1-211ENST00000487538 POLR3GLQ9BT43 218 aa14.34□□□□□ -0.11
GTPBP1-211ENST00000487538 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
GTPBP1-211ENST00000487538 TMF1P82094 1093 aa14.31□□□□□ -0.12
GTPBP1-211ENST00000487538 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
GTPBP1-211ENST00000487538 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.31□□□□□ -0.12
GTPBP1-211ENST00000487538 TXNDC2Q86VQ3 553 aa14.3□□□□□ -0.12
GTPBP1-211ENST00000487538 ADGRB1O14514 1584 aa14.3□□□□□ -0.12
GTPBP1-211ENST00000487538 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.29□□□□□ -0.12
GTPBP1-211ENST00000487538 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
GTPBP1-211ENST00000487538 DIP2AQ14689 1571 aa14.28□□□□□ -0.12
GTPBP1-211ENST00000487538 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.28□□□□□ -0.12
GTPBP1-211ENST00000487538 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa14.27□□□□□ -0.12
GTPBP1-211ENST00000487538 UBAP1LF5GYI3 381 aa14.27□□□□□ -0.13
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC24A1O60721 1099 aa14.27□□□□□ -0.13
GTPBP1-211ENST00000487538 CDCA8Q53HL2 280 aa14.27□□□□□ -0.13
GTPBP1-211ENST00000487538 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
GTPBP1-211ENST00000487538 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.27□□□□□ -0.13
GTPBP1-211ENST00000487538 EID1Q9Y6B2 187 aa14.27□□□□□ -0.13
GTPBP1-211ENST00000487538 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
GTPBP1-211ENST00000487538 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.25□□□□□ -0.13
GTPBP1-211ENST00000487538 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.24□□□□□ -0.13
GTPBP1-211ENST00000487538 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
GTPBP1-211ENST00000487538 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
GTPBP1-211ENST00000487538 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
GTPBP1-211ENST00000487538 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
GTPBP1-211ENST00000487538 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.21□□□□□ -0.13
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC26A8Q96RN1 970 aa14.21□□□□□ -0.13
GTPBP1-211ENST00000487538 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.2□□□□□ -0.14
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.2□□□□□ -0.14
GTPBP1-211ENST00000487538 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM94Q12767 1356 aa14.2□□□□□ -0.14
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
GTPBP1-211ENST00000487538 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.19□□□□□ -0.14
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAK1Q9UPV9 953 aa14.19□□□□□ -0.14
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