RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486447.1

CRIPT-202, Transcript of CXXC repeat containing interactor of PDZ3 domain, humanhuman

TSL 5

Gene CRIPT, Length 1,724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIPT-202ENST00000486447 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.12■■■□□ 2.25
CRIPT-202ENST00000486447 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
CRIPT-202ENST00000486447 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.12■■■□□ 2.25
CRIPT-202ENST00000486447 KIF1BO60333 1816 aa29.11■■■□□ 2.25
CRIPT-202ENST00000486447 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.1■■■□□ 2.25
CRIPT-202ENST00000486447 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CRIPT-202ENST00000486447 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CRIPT-202ENST00000486447 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.08■■■□□ 2.25
CRIPT-202ENST00000486447 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
CRIPT-202ENST00000486447 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.24
CRIPT-202ENST00000486447 MED14O60244 1454 aa29.06■■■□□ 2.24
CRIPT-202ENST00000486447 NEUROD1Q13562 356 aa29.05■■■□□ 2.24
CRIPT-202ENST00000486447 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
CRIPT-202ENST00000486447 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.03■■■□□ 2.24
CRIPT-202ENST00000486447 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.03■■■□□ 2.24
CRIPT-202ENST00000486447 BCANQ96GW7 911 aa29.03■■■□□ 2.24
CRIPT-202ENST00000486447 SLC26A8Q96RN1 970 aa29■■■□□ 2.23
CRIPT-202ENST00000486447 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.99■■■□□ 2.23
CRIPT-202ENST00000486447 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
CRIPT-202ENST00000486447 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.97■■■□□ 2.23
CRIPT-202ENST00000486447 IQGAP1P46940 1657 aa28.96■■■□□ 2.23
CRIPT-202ENST00000486447 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.95■■■□□ 2.23
CRIPT-202ENST00000486447 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIPT-202ENST00000486447 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
CRIPT-202ENST00000486447 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CRIPT-202ENST00000486447 PPLO60437 1756 aa28.91■■■□□ 2.22
CRIPT-202ENST00000486447 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.91■■■□□ 2.22
CRIPT-202ENST00000486447 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.89■■■□□ 2.21
CRIPT-202ENST00000486447 TBX22Q9Y458 520 aa28.87■■■□□ 2.21
CRIPT-202ENST00000486447 IFT172Q9UG01 1749 aa28.86■■■□□ 2.21
CRIPT-202ENST00000486447 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.84■■■□□ 2.21
CRIPT-202ENST00000486447 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.83■■■□□ 2.21
CRIPT-202ENST00000486447 MYOM2P54296 1465 aa28.81■■■□□ 2.2
CRIPT-202ENST00000486447 METP08581 1390 aa28.81■■■□□ 2.2
CRIPT-202ENST00000486447 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.8■■■□□ 2.2
CRIPT-202ENST00000486447 PIK3C2GO75747 1445 aa28.79■■■□□ 2.2
CRIPT-202ENST00000486447 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.79■■■□□ 2.2
CRIPT-202ENST00000486447 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.78■■■□□ 2.2
CRIPT-202ENST00000486447 STAC3Q96MF2 364 aa28.77■■■□□ 2.2
CRIPT-202ENST00000486447 ALKQ9UM73 1620 aa28.76■■■□□ 2.2
CRIPT-202ENST00000486447 KCNA6P17658 529 aa28.76■■■□□ 2.19
CRIPT-202ENST00000486447 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
CRIPT-202ENST00000486447 PTPRUQ92729 1446 aa28.75■■■□□ 2.19
CRIPT-202ENST00000486447 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.75■■■□□ 2.19
CRIPT-202ENST00000486447 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.74■■■□□ 2.19
CRIPT-202ENST00000486447 TONSLQ96HA7 1378 aa28.74■■■□□ 2.19
CRIPT-202ENST00000486447 DIP2AQ14689 1571 aa28.73■■■□□ 2.19
CRIPT-202ENST00000486447 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIPT-202ENST00000486447 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIPT-202ENST00000486447 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
CRIPT-202ENST00000486447 PIK3R4Q99570 1358 aa28.7■■■□□ 2.18
CRIPT-202ENST00000486447 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
CRIPT-202ENST00000486447 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.68■■■□□ 2.18
CRIPT-202ENST00000486447 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.66■■■□□ 2.18
CRIPT-202ENST00000486447 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CRIPT-202ENST00000486447 CERKQ8TCT0 537 aa28.65■■■□□ 2.18
CRIPT-202ENST00000486447 STK26Q9P289 416 aa28.65■■■□□ 2.18
CRIPT-202ENST00000486447 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
CRIPT-202ENST00000486447 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.64■■■□□ 2.17
CRIPT-202ENST00000486447 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.63■■■□□ 2.17
CRIPT-202ENST00000486447 NWD1Q149M9 1564 aa28.62■■■□□ 2.17
CRIPT-202ENST00000486447 CPS1P31327 1500 aa28.62■■■□□ 2.17
CRIPT-202ENST00000486447 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.61■■■□□ 2.17
CRIPT-202ENST00000486447 TMEM94Q12767 1356 aa28.58■■■□□ 2.17
CRIPT-202ENST00000486447 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CRIPT-202ENST00000486447 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CRIPT-202ENST00000486447 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.57■■■□□ 2.16
CRIPT-202ENST00000486447 ADGRB1O14514 1584 aa28.56■■■□□ 2.16
CRIPT-202ENST00000486447 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.56■■■□□ 2.16
CRIPT-202ENST00000486447 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CRIPT-202ENST00000486447 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CRIPT-202ENST00000486447 LAMC1P11047 1609 aa28.54■■■□□ 2.16
CRIPT-202ENST00000486447 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.54■■■□□ 2.16
CRIPT-202ENST00000486447 ABCC11Q96J66 1382 aa28.53■■■□□ 2.16
CRIPT-202ENST00000486447 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.53■■■□□ 2.16
CRIPT-202ENST00000486447 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.48■■■□□ 2.15
CRIPT-202ENST00000486447 TECPR2O15040 1411 aa28.48■■■□□ 2.15
CRIPT-202ENST00000486447 PTCH1Q13635 1447 aa28.48■■■□□ 2.15
CRIPT-202ENST00000486447 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
CRIPT-202ENST00000486447 C14orf37Q86TY3 774 aa28.46■■■□□ 2.15
CRIPT-202ENST00000486447 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
CRIPT-202ENST00000486447 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.46■■■□□ 2.15
CRIPT-202ENST00000486447 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.46■■■□□ 2.15
CRIPT-202ENST00000486447 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.14
CRIPT-202ENST00000486447 PRAM1Q96QH2 718 aa28.45■■■□□ 2.14
CRIPT-202ENST00000486447 SIRT1Q96EB6 747 aa28.43■■■□□ 2.14
CRIPT-202ENST00000486447 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.41■■■□□ 2.14
CRIPT-202ENST00000486447 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.41■■■□□ 2.14
CRIPT-202ENST00000486447 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.4■■■□□ 2.14
CRIPT-202ENST00000486447 POGKQ9P215 609 aa28.4■■■□□ 2.14
CRIPT-202ENST00000486447 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.39■■■□□ 2.14
CRIPT-202ENST00000486447 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.39■■■□□ 2.14
CRIPT-202ENST00000486447 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.39■■■□□ 2.14
CRIPT-202ENST00000486447 MSH6P52701 1360 aa28.39■■■□□ 2.14
CRIPT-202ENST00000486447 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.39■■■□□ 2.13
CRIPT-202ENST00000486447 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.38■■■□□ 2.13
CRIPT-202ENST00000486447 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.38■■■□□ 2.13
CRIPT-202ENST00000486447 DLC1Q96QB1 1528 aa28.36■■■□□ 2.13
CRIPT-202ENST00000486447 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.34■■■□□ 2.13
CRIPT-202ENST00000486447 TOM1O60784 492 aa28.33■■■□□ 2.13
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