RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.08■■□□□ 1.77
SKIV2L-211ENST00000485349 ZFYVE9O95405 1425 aa26.07■■□□□ 1.76
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM94Q12767 1356 aa26.05■■□□□ 1.76
SKIV2L-211ENST00000485349 KCNA6P17658 529 aa26.03■■□□□ 1.76
SKIV2L-211ENST00000485349 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
SKIV2L-211ENST00000485349 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.02■■□□□ 1.76
SKIV2L-211ENST00000485349 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
SKIV2L-211ENST00000485349 ITGAEP38570 1179 aa26■■□□□ 1.75
SKIV2L-211ENST00000485349 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SKIV2L-211ENST00000485349 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.99■■□□□ 1.75
SKIV2L-211ENST00000485349 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SKIV2L-211ENST00000485349 BCANQ96GW7 911 aa25.98■■□□□ 1.75
SKIV2L-211ENST00000485349 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.96■■□□□ 1.75
SKIV2L-211ENST00000485349 NUP155O75694 1391 aa25.95■■□□□ 1.75
SKIV2L-211ENST00000485349 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SKIV2L-211ENST00000485349 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.94■■□□□ 1.74
SKIV2L-211ENST00000485349 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SKIV2L-211ENST00000485349 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SKIV2L-211ENST00000485349 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.91■■□□□ 1.74
SKIV2L-211ENST00000485349 DIP2AQ14689 1571 aa25.9■■□□□ 1.74
SKIV2L-211ENST00000485349 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.88■■□□□ 1.73
SKIV2L-211ENST00000485349 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SKIV2L-211ENST00000485349 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SKIV2L-211ENST00000485349 MSH6P52701 1360 aa25.87■■□□□ 1.73
SKIV2L-211ENST00000485349 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.73
SKIV2L-211ENST00000485349 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
SKIV2L-211ENST00000485349 TBX22Q9Y458 520 aa25.84■■□□□ 1.73
SKIV2L-211ENST00000485349 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.81■■□□□ 1.72
SKIV2L-211ENST00000485349 PHLPP1O60346 1717 aa25.81■■□□□ 1.72
SKIV2L-211ENST00000485349 TRPM2O94759 1503 aa25.81■■□□□ 1.72
SKIV2L-211ENST00000485349 CLTCL1P53675 1640 aa25.78■■□□□ 1.72
SKIV2L-211ENST00000485349 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
SKIV2L-211ENST00000485349 PIK3R4Q99570 1358 aa25.78■■□□□ 1.72
SKIV2L-211ENST00000485349 SLAIN2Q9P270 581 aa25.77■■□□□ 1.72
SKIV2L-211ENST00000485349 NAIPQ13075 1403 aa25.76■■□□□ 1.71
SKIV2L-211ENST00000485349 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.76■■□□□ 1.71
SKIV2L-211ENST00000485349 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.76■■□□□ 1.71
SKIV2L-211ENST00000485349 PTPRUQ92729 1446 aa25.75■■□□□ 1.71
SKIV2L-211ENST00000485349 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SKIV2L-211ENST00000485349 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
SKIV2L-211ENST00000485349 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
SKIV2L-211ENST00000485349 C14orf37Q86TY3 774 aa25.71■■□□□ 1.71
SKIV2L-211ENST00000485349 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.71■■□□□ 1.71
SKIV2L-211ENST00000485349 KIF1BO60333 1816 aa25.7■■□□□ 1.71
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
SKIV2L-211ENST00000485349 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.68■■□□□ 1.7
SKIV2L-211ENST00000485349 HFM1A2PYH4 1435 aa25.65■■□□□ 1.7
SKIV2L-211ENST00000485349 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.65■■□□□ 1.7
SKIV2L-211ENST00000485349 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
SKIV2L-211ENST00000485349 JCADQ9P266 1359 aa25.65■■□□□ 1.7
SKIV2L-211ENST00000485349 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.64■■□□□ 1.7
SKIV2L-211ENST00000485349 ATF3P18847 181 aa25.63■■□□□ 1.69
SKIV2L-211ENST00000485349 METP08581 1390 aa25.63■■□□□ 1.69
SKIV2L-211ENST00000485349 DCCP43146 1447 aa25.6■■□□□ 1.69
SKIV2L-211ENST00000485349 SHPRHQ149N8 1683 aa25.59■■□□□ 1.69
SKIV2L-211ENST00000485349 POTEAQ6S8J7 498 aa25.59■■□□□ 1.69
SKIV2L-211ENST00000485349 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
SKIV2L-211ENST00000485349 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.59■■□□□ 1.69
SKIV2L-211ENST00000485349 LRP6O75581 1613 aa25.58■■□□□ 1.69
SKIV2L-211ENST00000485349 TRIM52Q96A61 297 aa25.57■■□□□ 1.68
SKIV2L-211ENST00000485349 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.56■■□□□ 1.68
SKIV2L-211ENST00000485349 MST1RQ04912 1400 aa25.54■■□□□ 1.68
SKIV2L-211ENST00000485349 BRINP3Q76B58 766 aa25.54■■□□□ 1.68
SKIV2L-211ENST00000485349 PPLO60437 1756 aa25.54■■□□□ 1.68
SKIV2L-211ENST00000485349 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.53■■□□□ 1.68
SKIV2L-211ENST00000485349 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.53■■□□□ 1.68
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
SKIV2L-211ENST00000485349 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.5■■□□□ 1.67
SKIV2L-211ENST00000485349 PTCH1Q13635 1447 aa25.47■■□□□ 1.67
SKIV2L-211ENST00000485349 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SKIV2L-211ENST00000485349 FOXD1Q16676 465 aa25.44■■□□□ 1.66
SKIV2L-211ENST00000485349 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SKIV2L-211ENST00000485349 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.43■■□□□ 1.66
SKIV2L-211ENST00000485349 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.43■■□□□ 1.66
SKIV2L-211ENST00000485349 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.42■■□□□ 1.66
SKIV2L-211ENST00000485349 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.42■■□□□ 1.66
SKIV2L-211ENST00000485349 IFT172Q9UG01 1749 aa25.41■■□□□ 1.66
SKIV2L-211ENST00000485349 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.39■■□□□ 1.65
SKIV2L-211ENST00000485349 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.37■■□□□ 1.65
SKIV2L-211ENST00000485349 LAMC1P11047 1609 aa25.37■■□□□ 1.65
SKIV2L-211ENST00000485349 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SKIV2L-211ENST00000485349 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SKIV2L-211ENST00000485349 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SKIV2L-211ENST00000485349 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.35■■□□□ 1.65
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SKIV2L-211ENST00000485349 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.32■■□□□ 1.64
SKIV2L-211ENST00000485349 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.32■■□□□ 1.64
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SKIV2L-211ENST00000485349 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.31■■□□□ 1.64
SKIV2L-211ENST00000485349 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.31■■□□□ 1.64
SKIV2L-211ENST00000485349 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.29■■□□□ 1.64
SKIV2L-211ENST00000485349 RGL3Q3MIN7 710 aa25.28■■□□□ 1.64
SKIV2L-211ENST00000485349 ORAI2Q96SN7 254 aa25.28■■□□□ 1.64
SKIV2L-211ENST00000485349 AFF2P51816 1311 aa25.27■■□□□ 1.64
SKIV2L-211ENST00000485349 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.25■■□□□ 1.63
SKIV2L-211ENST00000485349 PIK3C2GO75747 1445 aa25.25■■□□□ 1.63
SKIV2L-211ENST00000485349 TECPR2O15040 1411 aa25.24■■□□□ 1.63
SKIV2L-211ENST00000485349 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms