RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 DISP1Q96F81 1524 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 HSPA6P17066 643 aa6.82□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa6.82□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 KDM5CP41229 1560 aa6.82□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 C14orf37Q86TY3 774 aa6.81□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 HOMEZQ8IX15 550 aa6.81□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 NGLY1Q96IV0 654 aa6.81□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 SGIP1Q9BQI5 828 aa6.81□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 TNS2Q63HR2 1409 aa6.81□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 PYGBP11216 843 aa6.8□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 FAM161AQ3B820 660 aa6.8□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 SHPRHQ149N8 1683 aa6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 PCNTO95613 3336 aa6.78□□□□□ -1.32
SHQ1-208ENST00000482785 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 FGD6Q6ZV73 1430 aa6.76□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 ARID3CA6NKF2 412 aa6.76□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 CD44P16070 742 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 CLCN6P51797 869 aa6.76□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.76□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 NINLQ9Y2I6 1382 aa6.76□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 ZMYM3Q14202 1370 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 LMOD2Q6P5Q4 547 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 C8orf37Q96NL8 207 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 STK24Q9Y6E0 443 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 MROH2AA6NES4 1674 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 IQGAP1P46940 1657 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 WDR70Q9NW82 654 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 AGLP35573 1532 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 CNTLNQ9NXG0 1405 aa6.74□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 A2ML1A8K2U0 1454 aa6.73□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.73□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 IQGAP2Q13576 1575 aa6.73□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 MED14O60244 1454 aa6.73□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 GABBR2O75899 941 aa6.72□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.72□□□□□ -1.33
SHQ1-208ENST00000482785 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.71□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 CFAP74Q9C0B2 1584 aa6.7□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa6.7□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 DEPDC5O75140 1603 aa6.7□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 CCDC61Q9Y6R9 512 aa6.7□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.7□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 BRWD3Q6RI45 1802 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 ATP10BO94823 1461 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 SCAPERQ9BY12 1400 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 ABCC1P33527 1531 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 SLAIN2Q9P270 581 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 KDM5DQ9BY66 1539 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 MPNDQ8N594 471 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 ITSN2Q9NZM3 1697 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 TMEM94Q12767 1356 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 DIP2AQ14689 1571 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 REREQ9P2R6 1566 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 MAP3K1Q13233 1512 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 BAG6P46379 1132 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 USP21Q9UK80 565 aa6.65□□□□□ -1.34
SHQ1-208ENST00000482785 PLCH2O75038 1416 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 UNC13BO14795 1591 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 APLP1P51693 650 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 SPON1Q9HCB6 807 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 ATRNO75882 1429 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 UGGT2Q9NYU1 1516 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 ABCA6Q8N139 1617 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 FAM83GA6ND36 823 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-208ENST00000482785 NEUROD2Q15784 382 aa6.63□□□□□ -1.35
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