RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481622.1

UBE2E1-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E1, human

TSL 5

Gene UBE2E1, Length 432 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2E1-208	ENST00000481622	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
UBE2E1-208	ENST00000481622	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		29.11	■■■□□ 2.25
UBE2E1-208	ENST00000481622	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		29.11	■■■□□ 2.25
UBE2E1-208	ENST00000481622	ZFYVE9	O95405	1425 aa		29.09	■■■□□ 2.25
UBE2E1-208	ENST00000481622	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
UBE2E1-208	ENST00000481622	MSH6	P52701	1360 aa		29.07	■■■□□ 2.24
UBE2E1-208	ENST00000481622	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		29.06	■■■□□ 2.24
UBE2E1-208	ENST00000481622	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
UBE2E1-208	ENST00000481622	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		29.05	■■■□□ 2.24
UBE2E1-208	ENST00000481622	BCAN	Q96GW7	911 aa		29.05	■■■□□ 2.24
UBE2E1-208	ENST00000481622	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
UBE2E1-208	ENST00000481622	UNC13B	O14795	1591 aa		29.04	■■■□□ 2.24
UBE2E1-208	ENST00000481622	PHLPP1	O60346	1717 aa		29.03	■■■□□ 2.24
UBE2E1-208	ENST00000481622	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		29.03	■■■□□ 2.24
UBE2E1-208	ENST00000481622	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
UBE2E1-208	ENST00000481622	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
UBE2E1-208	ENST00000481622		E9PCH4	1651 aa		28.96	■■■□□ 2.23
UBE2E1-208	ENST00000481622	POTEA	Q6S8J7	498 aa		28.96	■■■□□ 2.23
UBE2E1-208	ENST00000481622	SLAIN2	Q9P270	581 aa		28.96	■■■□□ 2.23
UBE2E1-208	ENST00000481622	DIP2A	Q14689	1571 aa		28.95	■■■□□ 2.22
UBE2E1-208	ENST00000481622	JCAD	Q9P266	1359 aa		28.93	■■■□□ 2.22
UBE2E1-208	ENST00000481622	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
UBE2E1-208	ENST00000481622	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		28.93	■■■□□ 2.22
UBE2E1-208	ENST00000481622	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		28.92	■■■□□ 2.22
UBE2E1-208	ENST00000481622	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	28.91	■■■□□ 2.22
UBE2E1-208	ENST00000481622	TBX22	Q9Y458	520 aa		28.91	■■■□□ 2.22
UBE2E1-208	ENST00000481622	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		28.88	■■■□□ 2.21
UBE2E1-208	ENST00000481622	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
UBE2E1-208	ENST00000481622	ROCK1	Q13464	1354 aa		28.87	■■■□□ 2.21
UBE2E1-208	ENST00000481622	PIK3R4	Q99570	1358 aa		28.87	■■■□□ 2.21
UBE2E1-208	ENST00000481622	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
UBE2E1-208	ENST00000481622	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
UBE2E1-208	ENST00000481622	TRPM2	O94759	1503 aa		28.84	■■■□□ 2.21
UBE2E1-208	ENST00000481622	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
UBE2E1-208	ENST00000481622	C14orf37	Q86TY3	774 aa		28.83	■■■□□ 2.21
UBE2E1-208	ENST00000481622	SHPRH	Q149N8	1683 aa		28.8	■■■□□ 2.2
UBE2E1-208	ENST00000481622	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
UBE2E1-208	ENST00000481622	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		28.79	■■■□□ 2.2
UBE2E1-208	ENST00000481622	LRP6	O75581	1613 aa		28.78	■■■□□ 2.2
UBE2E1-208	ENST00000481622	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		28.77	■■■□□ 2.2
UBE2E1-208	ENST00000481622	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		28.77	■■■□□ 2.2
UBE2E1-208	ENST00000481622	ATF3	P18847	181 aa		28.76	■■■□□ 2.19
UBE2E1-208	ENST00000481622	NUP155	O75694	1391 aa		28.75	■■■□□ 2.19
UBE2E1-208	ENST00000481622	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		28.74	■■■□□ 2.19
UBE2E1-208	ENST00000481622	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
UBE2E1-208	ENST00000481622	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		28.72	■■■□□ 2.19
UBE2E1-208	ENST00000481622	DCC	P43146	1447 aa		28.72	■■■□□ 2.19
UBE2E1-208	ENST00000481622	PTPRU	Q92729	1446 aa		28.72	■■■□□ 2.19
UBE2E1-208	ENST00000481622	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		28.71	■■■□□ 2.19
UBE2E1-208	ENST00000481622	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.18
UBE2E1-208	ENST00000481622	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		28.7	■■■□□ 2.18
UBE2E1-208	ENST00000481622	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
UBE2E1-208	ENST00000481622	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		28.65	■■■□□ 2.18
UBE2E1-208	ENST00000481622	BRINP3	Q76B58	766 aa		28.65	■■■□□ 2.18
UBE2E1-208	ENST00000481622	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		28.63	■■■□□ 2.17
UBE2E1-208	ENST00000481622	ITGAE	P38570	1179 aa		28.61	■■■□□ 2.17
UBE2E1-208	ENST00000481622	MST1R	Q04912	1400 aa		28.6	■■■□□ 2.17
UBE2E1-208	ENST00000481622	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		28.58	■■■□□ 2.17
UBE2E1-208	ENST00000481622	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
UBE2E1-208	ENST00000481622	CLTCL1	P53675	1640 aa		28.56	■■■□□ 2.16
UBE2E1-208	ENST00000481622	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		28.56	■■■□□ 2.16
UBE2E1-208	ENST00000481622	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		28.55	■■■□□ 2.16
UBE2E1-208	ENST00000481622	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		28.55	■■■□□ 2.16
UBE2E1-208	ENST00000481622	MET	P08581	1390 aa		28.55	■■■□□ 2.16
UBE2E1-208	ENST00000481622	TRIM52	Q96A61	297 aa		28.55	■■■□□ 2.16
UBE2E1-208	ENST00000481622	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
UBE2E1-208	ENST00000481622	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
UBE2E1-208	ENST00000481622	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
UBE2E1-208	ENST00000481622	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
UBE2E1-208	ENST00000481622	KIF1B	O60333	1816 aa		28.53	■■■□□ 2.16
UBE2E1-208	ENST00000481622	RXRB	P28702	533 aa		28.5	■■■□□ 2.15
UBE2E1-208	ENST00000481622	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	28.5	■■■□□ 2.15
UBE2E1-208	ENST00000481622	AFF2	P51816	1311 aa		28.47	■■■□□ 2.15
UBE2E1-208	ENST00000481622	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
UBE2E1-208	ENST00000481622	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		28.44	■■■□□ 2.14
UBE2E1-208	ENST00000481622	LAMC1	P11047	1609 aa		28.43	■■■□□ 2.14
UBE2E1-208	ENST00000481622	PTCH1	Q13635	1447 aa		28.43	■■■□□ 2.14
UBE2E1-208	ENST00000481622	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
UBE2E1-208	ENST00000481622	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		28.4	■■■□□ 2.14
UBE2E1-208	ENST00000481622	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.14
UBE2E1-208	ENST00000481622	NAIP	Q13075	1403 aa		28.38	■■■□□ 2.13
UBE2E1-208	ENST00000481622	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		28.37	■■■□□ 2.13
UBE2E1-208	ENST00000481622	C8orf37	Q96NL8	207 aa		28.37	■■■□□ 2.13
UBE2E1-208	ENST00000481622	RGS12	O14924	1447 aa		28.36	■■■□□ 2.13
UBE2E1-208	ENST00000481622	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
UBE2E1-208	ENST00000481622	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	28.33	■■■□□ 2.13
UBE2E1-208	ENST00000481622	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		28.33	■■■□□ 2.13
UBE2E1-208	ENST00000481622	PPL	O60437	1756 aa		28.32	■■■□□ 2.12
UBE2E1-208	ENST00000481622	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
UBE2E1-208	ENST00000481622	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
UBE2E1-208	ENST00000481622	HFM1	A2PYH4	1435 aa		28.28	■■■□□ 2.12
UBE2E1-208	ENST00000481622	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
UBE2E1-208	ENST00000481622	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		28.27	■■■□□ 2.12
UBE2E1-208	ENST00000481622	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
UBE2E1-208	ENST00000481622	ADAMTS2	O95450	1211 aa		28.26	■■■□□ 2.11
UBE2E1-208	ENST00000481622	NGLY1	Q96IV0	654 aa		28.26	■■■□□ 2.11
UBE2E1-208	ENST00000481622	ORAI2	Q96SN7	254 aa		28.25	■■■□□ 2.11
UBE2E1-208	ENST00000481622	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		28.24	■■■□□ 2.11
UBE2E1-208	ENST00000481622	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	28.2	■■■□□ 2.1
UBE2E1-208	ENST00000481622	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		28.17	■■■□□ 2.1

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