RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480940.1

PHF20-210, Transcript of PHD finger protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene PHF20, Length 643 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20-210ENST00000480940 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PHF20-210ENST00000480940 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.74□□□□□ -1.01
PHF20-210ENST00000480940 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.73□□□□□ -1.01
PHF20-210ENST00000480940 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PHF20-210ENST00000480940 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PHF20-210ENST00000480940 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.72□□□□□ -1.01
PHF20-210ENST00000480940 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PHF20-210ENST00000480940 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PHF20-210ENST00000480940 STAC3Q96MF2 364 aa8.7□□□□□ -1.02
PHF20-210ENST00000480940 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.69□□□□□ -1.02
PHF20-210ENST00000480940 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PHF20-210ENST00000480940 MS4A1P11836 297 aa8.68□□□□□ -1.02
PHF20-210ENST00000480940 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.67□□□□□ -1.02
PHF20-210ENST00000480940 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PHF20-210ENST00000480940 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PHF20-210ENST00000480940 FAM117AQ9C073 453 aa8.66□□□□□ -1.02
PHF20-210ENST00000480940 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.65□□□□□ -1.02
PHF20-210ENST00000480940 SLC10A3P09131 477 aa8.65□□□□□ -1.02
PHF20-210ENST00000480940 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.65□□□□□ -1.02
PHF20-210ENST00000480940 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PHF20-210ENST00000480940 CD46P15529 392 aa8.64□□□□□ -1.03
PHF20-210ENST00000480940 SLF2Q8IX21 1173 aa8.64□□□□□ -1.03
PHF20-210ENST00000480940 WNT2BQ93097 391 aa8.64□□□□□ -1.03
PHF20-210ENST00000480940 LRCH3Q96II8 777 aa8.64□□□□□ -1.03
PHF20-210ENST00000480940 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.63□□□□□ -1.03
PHF20-210ENST00000480940 BCAMP50895 628 aa8.63□□□□□ -1.03
PHF20-210ENST00000480940 SULF1Q8IWU6 871 aa8.63□□□□□ -1.03
PHF20-210ENST00000480940 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.62□□□□□ -1.03
PHF20-210ENST00000480940 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PHF20-210ENST00000480940 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.62□□□□□ -1.03
PHF20-210ENST00000480940 RNF40O75150 1001 aa8.61□□□□□ -1.03
PHF20-210ENST00000480940 RDH13Q8NBN7 331 aa8.61□□□□□ -1.03
PHF20-210ENST00000480940 IL27Q8NEV9 243 aa8.61□□□□□ -1.03
PHF20-210ENST00000480940 SLC4A3P48751 1232 aa8.6□□□□□ -1.03
PHF20-210ENST00000480940 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.6□□□□□ -1.03
PHF20-210ENST00000480940 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.6□□□□□ -1.03
PHF20-210ENST00000480940 GCGRP47871 477 aa8.59□□□□□ -1.03
PHF20-210ENST00000480940 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.59□□□□□ -1.03
PHF20-210ENST00000480940 HPS5Q9UPZ3 1129 aa8.59□□□□□ -1.03
PHF20-210ENST00000480940 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PHF20-210ENST00000480940 CFHP08603 1231 aa8.57□□□□□ -1.04
PHF20-210ENST00000480940 PPP4CP60510 307 aa8.56□□□□□ -1.04
PHF20-210ENST00000480940 WBP1LQ9NX94 342 aa8.56□□□□□ -1.04
PHF20-210ENST00000480940 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.55□□□□□ -1.04
PHF20-210ENST00000480940 NECTIN2Q92692 538 aa8.55□□□□□ -1.04
PHF20-210ENST00000480940 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.55□□□□□ -1.04
PHF20-210ENST00000480940 KDM4AO75164 1064 aa8.54□□□□□ -1.04
PHF20-210ENST00000480940 APLP1P51693 650 aa8.54□□□□□ -1.04
PHF20-210ENST00000480940 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.54□□□□□ -1.04
PHF20-210ENST00000480940 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.53□□□□□ -1.04
PHF20-210ENST00000480940 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 PTPN5P54829 565 aa8.52□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.52□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 FUT2Q10981 343 aa8.51□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.51□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.51□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.51□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.5□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 HOXA2O43364 376 aa8.5□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 USP46P62068 366 aa8.5□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.5□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 HCSTQ9UBK5 93 aa8.5□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 NDUFV2P19404 249 aa8.49□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 HLA-CQ95604 372 aa8.49□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 PRR14Q9BWN1 585 aa8.49□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 GOPCQ9HD26 462 aa8.49□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.49□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.49□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 SPTLC1O15269 473 aa8.48□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 ATP6V1AP38606 617 aa8.48□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.48□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.48□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.47□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PHF20-210ENST00000480940 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 GUCA2AQ02747 115 aa8.46□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 MORN1Q5T089 497 aa8.46□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.46□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 FDX1P10109 184 aa8.45□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.45□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.45□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 GJA5P36382 358 aa8.44□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.44□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.44□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.44□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 COPS2P61201 443 aa8.42□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.42□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.42□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.41□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.41□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 MTRQ99707 1265 aa8.41□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 NR1I2O75469 434 aa8.4□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 QPCTQ16769 361 aa8.4□□□□□ -1.06
PHF20-210ENST00000480940 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.4□□□□□ -1.06
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