RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-218ENST00000479554 BCANQ96GW7 911 aa21.79■■□□□ 1.08
ATG4B-218ENST00000479554 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
ATG4B-218ENST00000479554 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
ATG4B-218ENST00000479554 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG4B-218ENST00000479554 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
ATG4B-218ENST00000479554 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ATG4B-218ENST00000479554 NWD1Q149M9 1564 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG4B-218ENST00000479554 KCNA6P17658 529 aa21.76■■□□□ 1.07
ATG4B-218ENST00000479554 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
ATG4B-218ENST00000479554 TMEM94Q12767 1356 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG4B-218ENST00000479554 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.73■■□□□ 1.07
ATG4B-218ENST00000479554 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
ATG4B-218ENST00000479554 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ATG4B-218ENST00000479554 NAIPQ13075 1403 aa21.72■■□□□ 1.07
ATG4B-218ENST00000479554 ILDR2Q71H61 639 aa21.72■■□□□ 1.07
ATG4B-218ENST00000479554 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
ATG4B-218ENST00000479554 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
ATG4B-218ENST00000479554 DIP2AQ14689 1571 aa21.68■■□□□ 1.06
ATG4B-218ENST00000479554 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
ATG4B-218ENST00000479554 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
ATG4B-218ENST00000479554 HFM1A2PYH4 1435 aa21.66■■□□□ 1.06
ATG4B-218ENST00000479554 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
ATG4B-218ENST00000479554 TBX22Q9Y458 520 aa21.65■■□□□ 1.06
ATG4B-218ENST00000479554 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.64■■□□□ 1.06
ATG4B-218ENST00000479554 TRPM2O94759 1503 aa21.64■■□□□ 1.05
ATG4B-218ENST00000479554 MSH6P52701 1360 aa21.62■■□□□ 1.05
ATG4B-218ENST00000479554 CLTCL1P53675 1640 aa21.62■■□□□ 1.05
ATG4B-218ENST00000479554 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.62■■□□□ 1.05
ATG4B-218ENST00000479554 PIK3R4Q99570 1358 aa21.6■■□□□ 1.05
ATG4B-218ENST00000479554 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.6■■□□□ 1.05
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ATG4B-218ENST00000479554 TRIM52Q96A61 297 aa21.59■■□□□ 1.05
ATG4B-218ENST00000479554 SOCS7O14512 581 aa21.58■■□□□ 1.05
ATG4B-218ENST00000479554 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.57■■□□□ 1.04
ATG4B-218ENST00000479554 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.57■■□□□ 1.04
ATG4B-218ENST00000479554 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.56■■□□□ 1.04
ATG4B-218ENST00000479554 KIF1BO60333 1816 aa21.55■■□□□ 1.04
ATG4B-218ENST00000479554 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.55■■□□□ 1.04
ATG4B-218ENST00000479554 C14orf37Q86TY3 774 aa21.53■■□□□ 1.04
ATG4B-218ENST00000479554 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ATG4B-218ENST00000479554 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-218ENST00000479554 PTPRUQ92729 1446 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-218ENST00000479554 SLAIN2Q9P270 581 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-218ENST00000479554 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-218ENST00000479554 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-218ENST00000479554 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-218ENST00000479554 PHLPP1O60346 1717 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-218ENST00000479554 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-218ENST00000479554 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-218ENST00000479554 METP08581 1390 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-218ENST00000479554 ATF3P18847 181 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG4B-218ENST00000479554 DCCP43146 1447 aa21.42■■□□□ 1.02
ATG4B-218ENST00000479554 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
ATG4B-218ENST00000479554 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-218ENST00000479554 FOXD1Q16676 465 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-218ENST00000479554 PPLO60437 1756 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-218ENST00000479554 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-218ENST00000479554 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.38■■□□□ 1.01
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ATG4B-218ENST00000479554 JCADQ9P266 1359 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-218ENST00000479554 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-218ENST00000479554 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-218ENST00000479554 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.36■■□□□ 1.01
ATG4B-218ENST00000479554 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.35■■□□□ 1.01
ATG4B-218ENST00000479554 MST1RQ04912 1400 aa21.34■■□□□ 1.01
ATG4B-218ENST00000479554 PTCH1Q13635 1447 aa21.34■■□□□ 1.01
ATG4B-218ENST00000479554 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.33■■□□□ 1.01
ATG4B-218ENST00000479554 BRINP3Q76B58 766 aa21.33■■□□□ 1.01
ATG4B-218ENST00000479554 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.33■■□□□ 1
ATG4B-218ENST00000479554 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
ATG4B-218ENST00000479554 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
ATG4B-218ENST00000479554 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.31■■□□□ 1
ATG4B-218ENST00000479554 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.3■■□□□ 1
ATG4B-218ENST00000479554 IFT172Q9UG01 1749 aa21.29■■□□□ 1
ATG4B-218ENST00000479554 SHPRHQ149N8 1683 aa21.29■■□□□ 1
ATG4B-218ENST00000479554 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.29■■□□□ 1
ATG4B-218ENST00000479554 RGL3Q3MIN7 710 aa21.28■■□□□ 1
ATG4B-218ENST00000479554 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.28■■□□□ 1
ATG4B-218ENST00000479554 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.27■■□□□ 1
ATG4B-218ENST00000479554 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.27■□□□□ 0.99
ATG4B-218ENST00000479554 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.26■□□□□ 0.99
ATG4B-218ENST00000479554 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.26■□□□□ 0.99
ATG4B-218ENST00000479554 LRP6O75581 1613 aa21.25■□□□□ 0.99
ATG4B-218ENST00000479554 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.22■□□□□ 0.99
ATG4B-218ENST00000479554 POTEAQ6S8J7 498 aa21.22■□□□□ 0.99
ATG4B-218ENST00000479554 PIK3C2GO75747 1445 aa21.21■□□□□ 0.99
ATG4B-218ENST00000479554 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
ATG4B-218ENST00000479554 TECPR2O15040 1411 aa21.18■□□□□ 0.98
ATG4B-218ENST00000479554 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.18■□□□□ 0.98
ATG4B-218ENST00000479554 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.18■□□□□ 0.98
ATG4B-218ENST00000479554 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
ATG4B-218ENST00000479554 LAMC1P11047 1609 aa21.16■□□□□ 0.98
ATG4B-218ENST00000479554 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
ATG4B-218ENST00000479554 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
ATG4B-218ENST00000479554 STK26Q9P289 416 aa21.16■□□□□ 0.98
ATG4B-218ENST00000479554 MYOM2P54296 1465 aa21.15■□□□□ 0.98
ATG4B-218ENST00000479554 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
ATG4B-218ENST00000479554 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
ATG4B-218ENST00000479554 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
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