RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478653.6

NBPF3-210, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 3

Gene NBPF3, Length 1,417 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-210ENST00000478653 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
NBPF3-210ENST00000478653 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.19■■■□□ 2.42
NBPF3-210ENST00000478653 UNC13BO14795 1591 aa30.19■■■□□ 2.42
NBPF3-210ENST00000478653 ZFYVE9O95405 1425 aa30.19■■■□□ 2.42
NBPF3-210ENST00000478653 BCANQ96GW7 911 aa30.19■■■□□ 2.42
NBPF3-210ENST00000478653 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.17■■■□□ 2.42
NBPF3-210ENST00000478653 MSH6P52701 1360 aa30.14■■■□□ 2.42
NBPF3-210ENST00000478653 ROCK1Q13464 1354 aa30.14■■■□□ 2.42
NBPF3-210ENST00000478653 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.14■■■□□ 2.42
NBPF3-210ENST00000478653 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.14■■■□□ 2.42
NBPF3-210ENST00000478653 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
NBPF3-210ENST00000478653 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.13■■■□□ 2.41
NBPF3-210ENST00000478653 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.11■■■□□ 2.41
NBPF3-210ENST00000478653 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.1■■■□□ 2.41
NBPF3-210ENST00000478653 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
NBPF3-210ENST00000478653 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.07■■■□□ 2.4
NBPF3-210ENST00000478653 TBX22Q9Y458 520 aa30.06■■■□□ 2.4
NBPF3-210ENST00000478653 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.06■■■□□ 2.4
NBPF3-210ENST00000478653 E9PCH4 1651 aa30.06■■■□□ 2.4
NBPF3-210ENST00000478653 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
NBPF3-210ENST00000478653 DIP2AQ14689 1571 aa30.04■■■□□ 2.4
NBPF3-210ENST00000478653 SLAIN2Q9P270 581 aa30.03■■■□□ 2.4
NBPF3-210ENST00000478653 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
NBPF3-210ENST00000478653 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
NBPF3-210ENST00000478653 PIK3R4Q99570 1358 aa30.01■■■□□ 2.39
NBPF3-210ENST00000478653 NUP155O75694 1391 aa29.97■■■□□ 2.39
NBPF3-210ENST00000478653 PHLPP1O60346 1717 aa29.96■■■□□ 2.39
NBPF3-210ENST00000478653 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.96■■■□□ 2.39
NBPF3-210ENST00000478653 JCADQ9P266 1359 aa29.95■■■□□ 2.39
NBPF3-210ENST00000478653 TRPM2O94759 1503 aa29.92■■■□□ 2.38
NBPF3-210ENST00000478653 C14orf37Q86TY3 774 aa29.92■■■□□ 2.38
NBPF3-210ENST00000478653 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.9■■■□□ 2.38
NBPF3-210ENST00000478653 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.89■■■□□ 2.38
NBPF3-210ENST00000478653 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
NBPF3-210ENST00000478653 ATF3P18847 181 aa29.87■■■□□ 2.37
NBPF3-210ENST00000478653 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
NBPF3-210ENST00000478653 POTEAQ6S8J7 498 aa29.86■■■□□ 2.37
NBPF3-210ENST00000478653 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
NBPF3-210ENST00000478653 ITGAEP38570 1179 aa29.85■■■□□ 2.37
NBPF3-210ENST00000478653 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.83■■■□□ 2.37
NBPF3-210ENST00000478653 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
NBPF3-210ENST00000478653 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.82■■■□□ 2.36
NBPF3-210ENST00000478653 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.81■■■□□ 2.36
NBPF3-210ENST00000478653 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.81■■■□□ 2.36
NBPF3-210ENST00000478653 DCCP43146 1447 aa29.8■■■□□ 2.36
NBPF3-210ENST00000478653 PTPRUQ92729 1446 aa29.77■■■□□ 2.36
NBPF3-210ENST00000478653 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
NBPF3-210ENST00000478653 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.75■■■□□ 2.35
NBPF3-210ENST00000478653 SHPRHQ149N8 1683 aa29.74■■■□□ 2.35
NBPF3-210ENST00000478653 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
NBPF3-210ENST00000478653 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
NBPF3-210ENST00000478653 BRINP3Q76B58 766 aa29.7■■■□□ 2.34
NBPF3-210ENST00000478653 LRP6O75581 1613 aa29.7■■■□□ 2.34
NBPF3-210ENST00000478653 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
NBPF3-210ENST00000478653 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
NBPF3-210ENST00000478653 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
NBPF3-210ENST00000478653 CLTCL1P53675 1640 aa29.65■■■□□ 2.34
NBPF3-210ENST00000478653 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.65■■■□□ 2.34
NBPF3-210ENST00000478653 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.65■■■□□ 2.34
NBPF3-210ENST00000478653 METP08581 1390 aa29.64■■■□□ 2.34
NBPF3-210ENST00000478653 MST1RQ04912 1400 aa29.64■■■□□ 2.33
NBPF3-210ENST00000478653 NAIPQ13075 1403 aa29.62■■■□□ 2.33
NBPF3-210ENST00000478653 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.62■■■□□ 2.33
NBPF3-210ENST00000478653 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.61■■■□□ 2.33
NBPF3-210ENST00000478653 KIF1BO60333 1816 aa29.61■■■□□ 2.33
NBPF3-210ENST00000478653 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
NBPF3-210ENST00000478653 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.6■■■□□ 2.33
NBPF3-210ENST00000478653 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
NBPF3-210ENST00000478653 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
NBPF3-210ENST00000478653 PTCH1Q13635 1447 aa29.53■■■□□ 2.32
NBPF3-210ENST00000478653 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.53■■■□□ 2.32
NBPF3-210ENST00000478653 HFM1A2PYH4 1435 aa29.52■■■□□ 2.32
NBPF3-210ENST00000478653 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.51■■■□□ 2.32
NBPF3-210ENST00000478653 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
NBPF3-210ENST00000478653 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
NBPF3-210ENST00000478653 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
NBPF3-210ENST00000478653 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
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NBPF3-210ENST00000478653 RXRBP28702 533 aa29.49■■■□□ 2.31
NBPF3-210ENST00000478653 TRIM52Q96A61 297 aa29.48■■■□□ 2.31
NBPF3-210ENST00000478653 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.45■■■□□ 2.31
NBPF3-210ENST00000478653 AFF2P51816 1311 aa29.45■■■□□ 2.3
NBPF3-210ENST00000478653 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.44■■■□□ 2.3
NBPF3-210ENST00000478653 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
NBPF3-210ENST00000478653 LAMC1P11047 1609 aa29.44■■■□□ 2.3
NBPF3-210ENST00000478653 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.41■■■□□ 2.3
NBPF3-210ENST00000478653 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.3
NBPF3-210ENST00000478653 PPLO60437 1756 aa29.39■■■□□ 2.3
NBPF3-210ENST00000478653 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
NBPF3-210ENST00000478653 C8orf37Q96NL8 207 aa29.37■■■□□ 2.29
NBPF3-210ENST00000478653 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
NBPF3-210ENST00000478653 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
NBPF3-210ENST00000478653 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
NBPF3-210ENST00000478653 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.3■■■□□ 2.28
NBPF3-210ENST00000478653 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.3■■■□□ 2.28
NBPF3-210ENST00000478653 ORAI2Q96SN7 254 aa29.29■■■□□ 2.28
NBPF3-210ENST00000478653 NGLY1Q96IV0 654 aa29.28■■■□□ 2.28
NBPF3-210ENST00000478653 RGS12O14924 1447 aa29.26■■■□□ 2.27
NBPF3-210ENST00000478653 ADAMTS2O95450 1211 aa29.26■■■□□ 2.27
NBPF3-210ENST00000478653 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.25■■■□□ 2.27
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