RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478272.1

TMTC4-208, Transcript of transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 4, human

TSL 2

Gene TMTC4, Length 798 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMTC4-208	ENST00000478272	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TMTC4-208	ENST00000478272	TRPM2	O94759	1503 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TMTC4-208	ENST00000478272	PKD2	Q13563	968 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TMTC4-208	ENST00000478272	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TMTC4-208	ENST00000478272	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TMTC4-208	ENST00000478272	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TMTC4-208	ENST00000478272	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TMTC4-208	ENST00000478272	PTPRT	O14522	1441 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TMTC4-208	ENST00000478272	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TMTC4-208	ENST00000478272	IDI1	Q13907	227 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TMTC4-208	ENST00000478272	KIF1B	O60333	1816 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TMTC4-208	ENST00000478272	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TMTC4-208	ENST00000478272	SLIT1	O75093	1534 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMTC4-208	ENST00000478272	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMTC4-208	ENST00000478272	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMTC4-208	ENST00000478272	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMTC4-208	ENST00000478272	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMTC4-208	ENST00000478272	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMTC4-208	ENST00000478272	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMTC4-208	ENST00000478272	IQGAP1	P46940	1657 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMTC4-208	ENST00000478272	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMTC4-208	ENST00000478272	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMTC4-208	ENST00000478272	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMTC4-208	ENST00000478272	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMTC4-208	ENST00000478272	HRC	P23327	699 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMTC4-208	ENST00000478272	ZFYVE9	O95405	1425 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TMTC4-208	ENST00000478272	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TMTC4-208	ENST00000478272	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TMTC4-208	ENST00000478272	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMTC4-208	ENST00000478272	MED14	O60244	1454 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMTC4-208	ENST00000478272	PPL	O60437	1756 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMTC4-208	ENST00000478272	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMTC4-208	ENST00000478272	LTK	P29376	864 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMTC4-208	ENST00000478272	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMTC4-208	ENST00000478272	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMTC4-208	ENST00000478272	IFT172	Q9UG01	1749 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TMTC4-208	ENST00000478272	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TMTC4-208	ENST00000478272	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TMTC4-208	ENST00000478272	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TMTC4-208	ENST00000478272	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TMTC4-208	ENST00000478272	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TMTC4-208	ENST00000478272	CAPN15	O75808	1086 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMTC4-208	ENST00000478272	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMTC4-208	ENST00000478272	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMTC4-208	ENST00000478272	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMTC4-208	ENST00000478272	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMTC4-208	ENST00000478272	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TMTC4-208	ENST00000478272	EID1	Q9Y6B2	187 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMTC4-208	ENST00000478272	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TMTC4-208	ENST00000478272	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMTC4-208	ENST00000478272	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMTC4-208	ENST00000478272	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TMTC4-208	ENST00000478272	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMTC4-208	ENST00000478272	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TMTC4-208	ENST00000478272	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMTC4-208	ENST00000478272	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMTC4-208	ENST00000478272	RGL3	Q3MIN7	710 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMTC4-208	ENST00000478272	DIP2A	Q14689	1571 aa		13.58	□□□□□ -0.23
TMTC4-208	ENST00000478272	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TMTC4-208	ENST00000478272	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
TMTC4-208	ENST00000478272	TOM1	O60784	492 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMTC4-208	ENST00000478272	BCAN	Q96GW7	911 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMTC4-208	ENST00000478272	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMTC4-208	ENST00000478272	NWD1	Q149M9	1564 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMTC4-208	ENST00000478272	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TMTC4-208	ENST00000478272	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TMTC4-208	ENST00000478272	ALK	Q9UM73	1620 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMTC4-208	ENST00000478272	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMTC4-208	ENST00000478272	MYOM2	P54296	1465 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMTC4-208	ENST00000478272	CPS1	P31327	1500 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMTC4-208	ENST00000478272	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TMTC4-208	ENST00000478272	PIP4K2B	P78356	416 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMTC4-208	ENST00000478272	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMTC4-208	ENST00000478272	DSG3	P32926	999 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	PIK3C2G	O75747	1445 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	PTPRU	Q92729	1446 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	MET	P08581	1390 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	HSPA1L	P34931	641 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	LAMC1	P11047	1609 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	TBX22	Q9Y458	520 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	ABCB7	O75027	752 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	NEUROD1	Q13562	356 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	KCNA6	P17658	529 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMTC4-208	ENST00000478272	PIK3R4	Q99570	1358 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMTC4-208	ENST00000478272	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TMTC4-208	ENST00000478272	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMTC4-208	ENST00000478272	TMEM94	Q12767	1356 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMTC4-208	ENST00000478272	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMTC4-208	ENST00000478272	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		13.43	□□□□□ -0.26

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