RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476204.5

HOXB-AS3-208, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXB-AS3, Length 539 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-208ENST00000476204 STRCQ7RTU9 1775 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-208ENST00000476204 STAC3Q96MF2 364 aa28.2■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MED14O60244 1454 aa28.2■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RGL3Q3MIN7 710 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BCANQ96GW7 911 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZFYVE9O95405 1425 aa28.16■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.16■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TBX22Q9Y458 520 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-208ENST00000476204 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NEUROD1Q13562 356 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IQGAP1P46940 1657 aa28.01■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.97■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KCNA6P17658 529 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PIK3R4Q99570 1358 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PPLO60437 1756 aa27.94■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-208ENST00000476204 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.92■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.92■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.9■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MYOM2P54296 1465 aa27.89■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DIP2AQ14689 1571 aa27.88■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TONSLQ96HA7 1378 aa27.86■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IFT172Q9UG01 1749 aa27.85■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-208ENST00000476204 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.85■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CERKQ8TCT0 537 aa27.83■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PIK3C2GO75747 1445 aa27.83■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CPS1P31327 1500 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ALKQ9UM73 1620 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-208ENST00000476204 METP08581 1390 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SIRT1Q96EB6 747 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ABCC11Q96J66 1382 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PTPRUQ92729 1446 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.7■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LAMC1P11047 1609 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-208ENST00000476204 STK26Q9P289 416 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NWD1Q149M9 1564 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TMEM94Q12767 1356 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-208ENST00000476204 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-208ENST00000476204 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TOM1O60784 492 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.62■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.62■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C14orf37Q86TY3 774 aa27.62■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TECPR2O15040 1411 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PTCH1Q13635 1447 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-208ENST00000476204 POGKQ9P215 609 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MSH6P52701 1360 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.58■■■□□ 2
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
HOXB-AS3-208ENST00000476204 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.57■■■□□ 2
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.56■■■□□ 2
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ADGRB1O14514 1584 aa27.56■■■□□ 2
HOXB-AS3-208ENST00000476204 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.55■■■□□ 2
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.54■■■□□ 2
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ATF3P18847 181 aa27.54■■■□□ 2
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FBXO41Q8TF61 875 aa27.53■■■□□ 2
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.52■■■□□ 2
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PRAM1Q96QH2 718 aa27.52■■■□□ 2
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DLC1Q96QB1 1528 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLAIN2Q9P270 581 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.45■■□□□ 1.99
HOXB-AS3-208ENST00000476204 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms