RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475978.1

SH3BP5L-202, Transcript of SH3 binding domain protein 5 like, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP5L, Length 4,122 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP5L-202ENST00000475978 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
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SH3BP5L-202ENST00000475978 RARSP54136 660 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP5L-202ENST00000475978 ANKRD45Q5TZF3 282 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP5L-202ENST00000475978 CFAP70Q5T0N1 1121 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP5L-202ENST00000475978 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP5L-202ENST00000475978 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP5L-202ENST00000475978 GGT6Q6P531 493 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP5L-202ENST00000475978 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP5L-202ENST00000475978 MTHFSP49914 203 aa17.78■□□□□ 0.44
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