RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473084.1

TOR1A-202, Transcript of torsin family 1 member A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TOR1A, Length 1,668 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1A-202ENST00000473084 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.45■■■□□ 2.14
TOR1A-202ENST00000473084 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.44■■■□□ 2.14
TOR1A-202ENST00000473084 IFT172Q9UG01 1749 aa28.44■■■□□ 2.14
TOR1A-202ENST00000473084 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.44■■■□□ 2.14
TOR1A-202ENST00000473084 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.44■■■□□ 2.14
TOR1A-202ENST00000473084 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.43■■■□□ 2.14
TOR1A-202ENST00000473084 PPLO60437 1756 aa28.43■■■□□ 2.14
TOR1A-202ENST00000473084 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
TOR1A-202ENST00000473084 ZFYVE9O95405 1425 aa28.41■■■□□ 2.14
TOR1A-202ENST00000473084 MYOM2P54296 1465 aa28.39■■■□□ 2.13
TOR1A-202ENST00000473084 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.38■■■□□ 2.13
TOR1A-202ENST00000473084 LTKP29376 864 aa28.38■■■□□ 2.13
TOR1A-202ENST00000473084 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.37■■■□□ 2.13
TOR1A-202ENST00000473084 SLIT1O75093 1534 aa28.36■■■□□ 2.13
TOR1A-202ENST00000473084 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
TOR1A-202ENST00000473084 HSPA2P54652 639 aa28.35■■■□□ 2.13
TOR1A-202ENST00000473084 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.35■■■□□ 2.13
TOR1A-202ENST00000473084 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.35■■■□□ 2.13
TOR1A-202ENST00000473084 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.33■■■□□ 2.13
TOR1A-202ENST00000473084 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.32■■■□□ 2.12
TOR1A-202ENST00000473084 STAC3Q96MF2 364 aa28.31■■■□□ 2.12
TOR1A-202ENST00000473084 EID1Q9Y6B2 187 aa28.31■■■□□ 2.12
TOR1A-202ENST00000473084 PIK3C2GO75747 1445 aa28.3■■■□□ 2.12
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TOR1A-202ENST00000473084 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
TOR1A-202ENST00000473084 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.28■■■□□ 2.12
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TOR1A-202ENST00000473084 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.26■■■□□ 2.12
TOR1A-202ENST00000473084 BCANQ96GW7 911 aa28.26■■■□□ 2.12
TOR1A-202ENST00000473084 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.25■■■□□ 2.11
TOR1A-202ENST00000473084 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.24■■■□□ 2.11
TOR1A-202ENST00000473084 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.23■■■□□ 2.11
TOR1A-202ENST00000473084 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.23■■■□□ 2.11
TOR1A-202ENST00000473084 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
TOR1A-202ENST00000473084 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
TOR1A-202ENST00000473084 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.2■■■□□ 2.11
TOR1A-202ENST00000473084 IQGAP1P46940 1657 aa28.2■■■□□ 2.1
TOR1A-202ENST00000473084 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.18■■■□□ 2.1
TOR1A-202ENST00000473084 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
TOR1A-202ENST00000473084 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.18■■■□□ 2.1
TOR1A-202ENST00000473084 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.17■■■□□ 2.1
TOR1A-202ENST00000473084 ALKQ9UM73 1620 aa28.17■■■□□ 2.1
TOR1A-202ENST00000473084 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.16■■■□□ 2.1
TOR1A-202ENST00000473084 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
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TOR1A-202ENST00000473084 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
TOR1A-202ENST00000473084 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.13■■■□□ 2.09
TOR1A-202ENST00000473084 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.13■■■□□ 2.09
TOR1A-202ENST00000473084 LAMC1P11047 1609 aa28.11■■■□□ 2.09
TOR1A-202ENST00000473084 ADGRB1O14514 1584 aa28.11■■■□□ 2.09
TOR1A-202ENST00000473084 METP08581 1390 aa28.11■■■□□ 2.09
TOR1A-202ENST00000473084 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.11■■■□□ 2.09
TOR1A-202ENST00000473084 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
TOR1A-202ENST00000473084 MED14O60244 1454 aa28.1■■■□□ 2.09
TOR1A-202ENST00000473084 STRCQ7RTU9 1775 aa28.08■■■□□ 2.09
TOR1A-202ENST00000473084 STK26Q9P289 416 aa28.07■■■□□ 2.08
TOR1A-202ENST00000473084 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
TOR1A-202ENST00000473084 TBX22Q9Y458 520 aa28.04■■■□□ 2.08
TOR1A-202ENST00000473084 USP47Q96K76 1375 aa28.04■■■□□ 2.08
TOR1A-202ENST00000473084 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.03■■■□□ 2.08
TOR1A-202ENST00000473084 DIP2AQ14689 1571 aa28.01■■■□□ 2.07
TOR1A-202ENST00000473084 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
TOR1A-202ENST00000473084 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
TOR1A-202ENST00000473084 PTPRUQ92729 1446 aa28■■■□□ 2.07
TOR1A-202ENST00000473084 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.99■■■□□ 2.07
TOR1A-202ENST00000473084 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
TOR1A-202ENST00000473084 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.94■■■□□ 2.06
TOR1A-202ENST00000473084 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.94■■■□□ 2.06
TOR1A-202ENST00000473084 ABCC11Q96J66 1382 aa27.91■■■□□ 2.06
TOR1A-202ENST00000473084 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.91■■■□□ 2.06
TOR1A-202ENST00000473084 KCNA6P17658 529 aa27.9■■■□□ 2.06
TOR1A-202ENST00000473084 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
TOR1A-202ENST00000473084 PIK3R4Q99570 1358 aa27.89■■■□□ 2.06
TOR1A-202ENST00000473084 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.89■■■□□ 2.06
TOR1A-202ENST00000473084 PRAM1Q96QH2 718 aa27.89■■■□□ 2.06
TOR1A-202ENST00000473084 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
TOR1A-202ENST00000473084 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.89■■■□□ 2.05
TOR1A-202ENST00000473084 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
TOR1A-202ENST00000473084 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.88■■■□□ 2.05
TOR1A-202ENST00000473084 TECPR2O15040 1411 aa27.87■■■□□ 2.05
TOR1A-202ENST00000473084 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
TOR1A-202ENST00000473084 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
TOR1A-202ENST00000473084 POGKQ9P215 609 aa27.85■■■□□ 2.05
TOR1A-202ENST00000473084 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TOR1A-202ENST00000473084 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.84■■■□□ 2.05
TOR1A-202ENST00000473084 CPS1P31327 1500 aa27.84■■■□□ 2.05
TOR1A-202ENST00000473084 DLC1Q96QB1 1528 aa27.84■■■□□ 2.05
TOR1A-202ENST00000473084 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.84■■■□□ 2.05
TOR1A-202ENST00000473084 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TOR1A-202ENST00000473084 TESK2Q96S53 571 aa27.82■■■□□ 2.04
TOR1A-202ENST00000473084 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
TOR1A-202ENST00000473084 PTCH1Q13635 1447 aa27.8■■■□□ 2.04
TOR1A-202ENST00000473084 NWD1Q149M9 1564 aa27.8■■■□□ 2.04
TOR1A-202ENST00000473084 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.79■■■□□ 2.04
TOR1A-202ENST00000473084 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.79■■■□□ 2.04
TOR1A-202ENST00000473084 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.79■■■□□ 2.04
TOR1A-202ENST00000473084 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
TOR1A-202ENST00000473084 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
TOR1A-202ENST00000473084 SIRT1Q96EB6 747 aa27.76■■■□□ 2.03
TOR1A-202ENST00000473084 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.74■■■□□ 2.03
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