RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470944.1

SOD1-203, Transcript of superoxide dismutase 1, humanhuman

TSL 2

Gene SOD1, Length 1,746 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD1-203ENST00000470944 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41.58■■■■■ 4.25
SOD1-203ENST00000470944 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.57■■■■■ 4.25
SOD1-203ENST00000470944 ZFYVE9O95405 1425 aa41.57■■■■■ 4.25
SOD1-203ENST00000470944 IFT172Q9UG01 1749 aa41.56■■■■■ 4.24
SOD1-203ENST00000470944 PPLO60437 1756 aa41.54■■■■■ 4.24
SOD1-203ENST00000470944 SLIT1O75093 1534 aa41.54■■■■■ 4.24
SOD1-203ENST00000470944 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.54■■■■■ 4.24
SOD1-203ENST00000470944 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa41.51■■■■■ 4.24
SOD1-203ENST00000470944 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
SOD1-203ENST00000470944 LTKP29376 864 aa41.49■■■■■ 4.23
SOD1-203ENST00000470944 HSPA2P54652 639 aa41.49■■■■■ 4.23
SOD1-203ENST00000470944 MYOM2P54296 1465 aa41.48■■■■■ 4.23
SOD1-203ENST00000470944 VGFO15240 615 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
SOD1-203ENST00000470944 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
SOD1-203ENST00000470944 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.45■■■■■ 4.23
SOD1-203ENST00000470944 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
SOD1-203ENST00000470944 NBPF8Q3BBV2 869 aa41.43■■■■■ 4.22
SOD1-203ENST00000470944 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.43■■■■■ 4.22
SOD1-203ENST00000470944 NRXN1Q9ULB1 1477 aa41.41■■■■■ 4.22
SOD1-203ENST00000470944 STAC3Q96MF2 364 aa41.41■■■■■ 4.22
SOD1-203ENST00000470944 HDGFP51858 240 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
SOD1-203ENST00000470944 EID1Q9Y6B2 187 aa41.41■■■■■ 4.22
SOD1-203ENST00000470944 PRAG1Q86YV5 1406 aa41.41■■■■■ 4.22
SOD1-203ENST00000470944 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.22
SOD1-203ENST00000470944 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.36■■■■■ 4.21
SOD1-203ENST00000470944 PIK3C2GO75747 1445 aa41.35■■■■■ 4.21
SOD1-203ENST00000470944 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.32■■■■■ 4.21
SOD1-203ENST00000470944 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
SOD1-203ENST00000470944 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa41.29■■■■■ 4.2
SOD1-203ENST00000470944 CFAP70Q5T0N1 1121 aa41.26■■■■■ 4.2
SOD1-203ENST00000470944 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa41.24■■■■■ 4.19
SOD1-203ENST00000470944 BCANQ96GW7 911 aa41.24■■■■■ 4.19
SOD1-203ENST00000470944 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
SOD1-203ENST00000470944 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa41.23■■■■■ 4.19
SOD1-203ENST00000470944 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
SOD1-203ENST00000470944 IQGAP1P46940 1657 aa41.21■■■■■ 4.19
SOD1-203ENST00000470944 NBPF1Q3BBV0 1214 aa41.2■■■■■ 4.19
SOD1-203ENST00000470944 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa41.2■■■■■ 4.19
SOD1-203ENST00000470944 MED14O60244 1454 aa41.2■■■■■ 4.19
SOD1-203ENST00000470944 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa41.19■■■■■ 4.19
SOD1-203ENST00000470944 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
SOD1-203ENST00000470944 ALKQ9UM73 1620 aa41.18■■■■■ 4.18
SOD1-203ENST00000470944 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.17■■■■■ 4.18
SOD1-203ENST00000470944 RALGAPBQ86X10 1494 aa41.16■■■■■ 4.18
SOD1-203ENST00000470944 STRCQ7RTU9 1775 aa41.16■■■■■ 4.18
SOD1-203ENST00000470944 TMEM132EQ6IEE7 984 aa41.11■■■■■ 4.17
SOD1-203ENST00000470944 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa41.11■■■■■ 4.17
SOD1-203ENST00000470944 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
SOD1-203ENST00000470944 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
SOD1-203ENST00000470944 LAMC1P11047 1609 aa41.09■■■■■ 4.17
SOD1-203ENST00000470944 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa41.09■■■■■ 4.17
SOD1-203ENST00000470944 METP08581 1390 aa41.07■■■■■ 4.17
SOD1-203ENST00000470944 ADGRB1O14514 1584 aa41.07■■■■■ 4.17
SOD1-203ENST00000470944 TBX22Q9Y458 520 aa41.06■■■■■ 4.16
SOD1-203ENST00000470944 GPRASP1Q5JY77 1395 aa41.04■■■■■ 4.16
SOD1-203ENST00000470944 DIP2AQ14689 1571 aa41.02■■■■■ 4.16
SOD1-203ENST00000470944 CARD11Q9BXL7 1154 aa41.01■■■■■ 4.16
SOD1-203ENST00000470944 STK26Q9P289 416 aa40.93■■■■■ 4.14
SOD1-203ENST00000470944 PTPRUQ92729 1446 aa40.93■■■■■ 4.14
SOD1-203ENST00000470944 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
SOD1-203ENST00000470944 TRAK1Q9UPV9 953 aa40.88■■■■■ 4.13
SOD1-203ENST00000470944 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
SOD1-203ENST00000470944 PIK3R4Q99570 1358 aa40.86■■■■■ 4.13
SOD1-203ENST00000470944 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.84■■■■■ 4.13
SOD1-203ENST00000470944 USP47Q96K76 1375 aa40.84■■■■■ 4.13
SOD1-203ENST00000470944 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa40.84■■■■■ 4.13
SOD1-203ENST00000470944 ABCC11Q96J66 1382 aa40.81■■■■■ 4.12
SOD1-203ENST00000470944 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
SOD1-203ENST00000470944 KCNA6P17658 529 aa40.78■■■■■ 4.12
SOD1-203ENST00000470944 TECPR2O15040 1411 aa40.77■■■■■ 4.12
SOD1-203ENST00000470944 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP40.77■■■■■ 4.12
SOD1-203ENST00000470944 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
SOD1-203ENST00000470944 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.11
SOD1-203ENST00000470944 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.11
SOD1-203ENST00000470944 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.75■■■■■ 4.11
SOD1-203ENST00000470944 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
SOD1-203ENST00000470944 KNDC1Q76NI1 1749 aa40.73■■■■■ 4.11
SOD1-203ENST00000470944 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa40.73■■■■■ 4.11
SOD1-203ENST00000470944 DLC1Q96QB1 1528 aa40.72■■■■■ 4.11
SOD1-203ENST00000470944 NWD1Q149M9 1564 aa40.72■■■■■ 4.11
SOD1-203ENST00000470944 CPS1P31327 1500 aa40.71■■■■■ 4.11
SOD1-203ENST00000470944 WAPLQ7Z5K2 1190 aa40.71■■■■■ 4.11
SOD1-203ENST00000470944 PRAM1Q96QH2 718 aa40.71■■■■■ 4.11
SOD1-203ENST00000470944 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
SOD1-203ENST00000470944 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa40.7■■■■■ 4.11
SOD1-203ENST00000470944 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
SOD1-203ENST00000470944 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.68■■■■■ 4.1
SOD1-203ENST00000470944 PTCH1Q13635 1447 aa40.68■■■■■ 4.1
SOD1-203ENST00000470944 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP40.67■■■■■ 4.1
SOD1-203ENST00000470944 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
SOD1-203ENST00000470944 FAM135BQ49AJ0 1406 aa40.65■■■■■ 4.1
SOD1-203ENST00000470944 SIRT1Q96EB6 747 aa40.64■■■■■ 4.1
SOD1-203ENST00000470944 POGKQ9P215 609 aa40.64■■■■■ 4.1
SOD1-203ENST00000470944 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
SOD1-203ENST00000470944 TESK2Q96S53 571 aa40.59■■■■■ 4.09
SOD1-203ENST00000470944 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
SOD1-203ENST00000470944 QRICH2Q9H0J4 1663 aa40.55■■■■■ 4.08
SOD1-203ENST00000470944 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
SOD1-203ENST00000470944 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
SOD1-203ENST00000470944 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
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