RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470356.3

HMG20B-209, Transcript of high mobility group 20B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HMG20B, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20B-209ENST00000470356 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP47.72■■■■■ 5.23
HMG20B-209ENST00000470356 KCNA6P17658 529 aa47.72■■■■■ 5.23
HMG20B-209ENST00000470356 HDGFP51858 240 aaKnown RBP47.7■■■■■ 5.23
HMG20B-209ENST00000470356 ILDR2Q71H61 639 aa47.7■■■■■ 5.23
HMG20B-209ENST00000470356 RIMS2Q9UQ26 1411 aa47.67■■■■■ 5.22
HMG20B-209ENST00000470356 BCANQ96GW7 911 aa47.66■■■■■ 5.22
HMG20B-209ENST00000470356 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa47.63■■■■■ 5.22
HMG20B-209ENST00000470356 CHGAP10645 457 aaKnown RBP47.62■■■■■ 5.21
HMG20B-209ENST00000470356 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP47.61■■■■■ 5.21
HMG20B-209ENST00000470356 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP47.58■■■■■ 5.21
HMG20B-209ENST00000470356 TMEM94Q12767 1356 aa47.58■■■■■ 5.21
HMG20B-209ENST00000470356 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP47.55■■■■■ 5.2
HMG20B-209ENST00000470356 NWD1Q149M9 1564 aa47.54■■■■■ 5.2
HMG20B-209ENST00000470356 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP47.53■■■■■ 5.2
HMG20B-209ENST00000470356 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP47.52■■■■■ 5.2
HMG20B-209ENST00000470356 NAIPQ13075 1403 aa47.48■■■■■ 5.19
HMG20B-209ENST00000470356 TBX22Q9Y458 520 aa47.48■■■■■ 5.19
HMG20B-209ENST00000470356 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP47.47■■■■■ 5.19
HMG20B-209ENST00000470356 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa47.44■■■■■ 5.19
HMG20B-209ENST00000470356 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP47.43■■■■■ 5.18
HMG20B-209ENST00000470356 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP47.43■■■■■ 5.18
HMG20B-209ENST00000470356 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP47.42■■■■■ 5.18
HMG20B-209ENST00000470356 FAM135BQ49AJ0 1406 aa47.39■■■■■ 5.18
HMG20B-209ENST00000470356 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa47.39■■■■■ 5.18
HMG20B-209ENST00000470356 SOCS7O14512 581 aa47.38■■■■■ 5.18
HMG20B-209ENST00000470356 DIP2AQ14689 1571 aa47.34■■■■■ 5.17
HMG20B-209ENST00000470356 HFM1A2PYH4 1435 aa47.32■■■■■ 5.17
HMG20B-209ENST00000470356 MSH6P52701 1360 aa47.3■■■■■ 5.16
HMG20B-209ENST00000470356 PIK3R4Q99570 1358 aa47.3■■■■■ 5.16
HMG20B-209ENST00000470356 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa47.22■■■■■ 5.15
HMG20B-209ENST00000470356 TRPM2O94759 1503 aa47.22■■■■■ 5.15
HMG20B-209ENST00000470356 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP47.22■■■■■ 5.15
HMG20B-209ENST00000470356 CLTCL1P53675 1640 aa47.21■■■■■ 5.15
HMG20B-209ENST00000470356 TRIM52Q96A61 297 aa47.21■■■■■ 5.15
HMG20B-209ENST00000470356 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa47.21■■■■■ 5.15
HMG20B-209ENST00000470356 SLAIN2Q9P270 581 aa47.18■■■■■ 5.14
HMG20B-209ENST00000470356 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa47.14■■■■■ 5.14
HMG20B-209ENST00000470356 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa47.13■■■■■ 5.14
HMG20B-209ENST00000470356 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa47.13■■■■■ 5.14
HMG20B-209ENST00000470356 KIF1BO60333 1816 aa47.13■■■■■ 5.14
HMG20B-209ENST00000470356 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP47.12■■■■■ 5.13
HMG20B-209ENST00000470356 C14orf37Q86TY3 774 aa47.1■■■■■ 5.13
HMG20B-209ENST00000470356 PTPRUQ92729 1446 aa47.1■■■■■ 5.13
HMG20B-209ENST00000470356 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP47.09■■■■■ 5.13
HMG20B-209ENST00000470356 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa47.07■■■■■ 5.13
HMG20B-209ENST00000470356 C19orf44Q9H6X5 657 aa47.06■■■■■ 5.12
HMG20B-209ENST00000470356 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP47.02■■■■■ 5.12
HMG20B-209ENST00000470356 CADPS2Q86UW7 1296 aa47■■■■■ 5.11
HMG20B-209ENST00000470356 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP46.99■■■■■ 5.11
HMG20B-209ENST00000470356 METP08581 1390 aa46.98■■■■■ 5.11
HMG20B-209ENST00000470356 ATF3P18847 181 aa46.97■■■■■ 5.11
HMG20B-209ENST00000470356 PHLPP1O60346 1717 aa46.93■■■■■ 5.1
HMG20B-209ENST00000470356 VGFO15240 615 aaPredicted RBP46.9■■■■■ 5.1
HMG20B-209ENST00000470356 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa46.89■■■■■ 5.1
HMG20B-209ENST00000470356 DCCP43146 1447 aa46.85■■■■■ 5.09
HMG20B-209ENST00000470356 FOXD1Q16676 465 aa46.84■■■■■ 5.09
HMG20B-209ENST00000470356 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP46.83■■■■■ 5.09
HMG20B-209ENST00000470356 JCADQ9P266 1359 aa46.8■■■■■ 5.08
HMG20B-209ENST00000470356 MPHOSPH9Q99550 1183 aa46.79■■■■■ 5.08
HMG20B-209ENST00000470356 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP46.79■■■■■ 5.08
HMG20B-209ENST00000470356 PPLO60437 1756 aa46.77■■■■■ 5.08
HMG20B-209ENST00000470356 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP46.74■■■■■ 5.07
HMG20B-209ENST00000470356 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP46.74■■■■■ 5.07
HMG20B-209ENST00000470356 BRINP3Q76B58 766 aa46.72■■■■■ 5.07
HMG20B-209ENST00000470356 CCDC144AA2RUR9 1427 aa46.71■■■■■ 5.07
HMG20B-209ENST00000470356 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP46.71■■■■■ 5.07
HMG20B-209ENST00000470356 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa46.71■■■■■ 5.07
HMG20B-209ENST00000470356 MST1RQ04912 1400 aa46.67■■■■■ 5.06
HMG20B-209ENST00000470356 PTCH1Q13635 1447 aa46.63■■■■■ 5.06
HMG20B-209ENST00000470356 SETD5Q9C0A6 1442 aa46.62■■■■■ 5.05
HMG20B-209ENST00000470356 NALCNQ8IZF0 1738 aa46.62■■■■■ 5.05
HMG20B-209ENST00000470356 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa46.62■■■■■ 5.05
HMG20B-209ENST00000470356 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa46.6■■■■■ 5.05
HMG20B-209ENST00000470356 PRAG1Q86YV5 1406 aa46.6■■■■■ 5.05
HMG20B-209ENST00000470356 ROBO2Q9HCK4 1378 aa46.59■■■■■ 5.05
HMG20B-209ENST00000470356 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa46.58■■■■■ 5.05
HMG20B-209ENST00000470356 RGL3Q3MIN7 710 aa46.58■■■■■ 5.05
HMG20B-209ENST00000470356 POTEAQ6S8J7 498 aa46.55■■■■■ 5.04
HMG20B-209ENST00000470356 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa46.54■■■■■ 5.04
HMG20B-209ENST00000470356 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa46.54■■■■■ 5.04
HMG20B-209ENST00000470356 SHPRHQ149N8 1683 aa46.54■■■■■ 5.04
HMG20B-209ENST00000470356 IFT172Q9UG01 1749 aa46.5■■■■■ 5.03
HMG20B-209ENST00000470356 NHSL1Q5SYE7 1610 aa46.5■■■■■ 5.03
HMG20B-209ENST00000470356 LRP6O75581 1613 aa46.46■■■■■ 5.03
HMG20B-209ENST00000470356 C1orf167Q5SNV9 1468 aa46.44■■■■■ 5.02
HMG20B-209ENST00000470356 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa46.43■■■■■ 5.02
HMG20B-209ENST00000470356 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP46.4■■■■■ 5.02
HMG20B-209ENST00000470356 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP46.39■■■■■ 5.02
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HMG20B-209ENST00000470356 PIK3C2GO75747 1445 aa46.36■■■■■ 5.01
HMG20B-209ENST00000470356 TECPR2O15040 1411 aa46.33■■■■■ 5.01
HMG20B-209ENST00000470356 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP46.33■■■■■ 5.01
HMG20B-209ENST00000470356 LAMC1P11047 1609 aa46.3■■■■■ 5
HMG20B-209ENST00000470356 ORAI2Q96SN7 254 aa46.3■■■■■ 5
HMG20B-209ENST00000470356 STK26Q9P289 416 aa46.3■■■■■ 5
HMG20B-209ENST00000470356 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP46.29■■■■■ 5
HMG20B-209ENST00000470356 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP46.29■■■■■ 5
HMG20B-209ENST00000470356 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP46.29■■■■■ 5
HMG20B-209ENST00000470356 ABCC11Q96J66 1382 aa46.29■■■■■ 5
HMG20B-209ENST00000470356 TMEM132EQ6IEE7 984 aa46.28■■■■■ 5
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