RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM2Q9UHN6 1383 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-208ENST00000462602 EID1Q9Y6B2 187 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 RIMS2Q9UQ26 1411 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 UBR1Q8IWV7 1749 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 ZFYVE9O95405 1425 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 MYOM2P54296 1465 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 TXNDC2Q86VQ3 553 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKLE2Q86XL3 938 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 SLIT1O75093 1534 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGAP23Q9P227 1491 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 MYO5BQ9ULV0 1848 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 PRAG1Q86YV5 1406 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 LTKP29376 864 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 PPLO60437 1756 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 NRXN1Q9ULB1 1477 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 NBPF8Q3BBV2 869 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 IFT172Q9UG01 1749 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 LMTK3Q96Q04 1460 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 BCANQ96GW7 911 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 PIK3C2GO75747 1445 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 HSPA2P54652 639 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 CFAP70Q5T0N1 1121 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 MED14O60244 1454 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 RALGAPBQ86X10 1494 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 TBX22Q9Y458 520 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 NBPF1Q3BBV0 1214 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 CARD11Q9BXL7 1154 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 GPRASP1Q5JY77 1395 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 LAMC1P11047 1609 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 ALKQ9UM73 1620 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC26A8Q96RN1 970 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 DIP2AQ14689 1571 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM132EQ6IEE7 984 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 PIK3R4Q99570 1358 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 METP08581 1390 aa13.25□□□□□ -0.29
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SH3BP4-208ENST00000462602 ADGRB1O14514 1584 aa13.24□□□□□ -0.29
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SH3BP4-208ENST00000462602 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCC11Q96J66 1382 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 USP47Q96K76 1375 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 STK26Q9P289 416 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 SIRT1Q96EB6 747 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 STRCQ7RTU9 1775 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC24A1O60721 1099 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNA6P17658 529 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 POGKQ9P215 609 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 TECPR2O15040 1411 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 PTPRUQ92729 1446 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 DLC1Q96QB1 1528 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM135BQ49AJ0 1406 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 PRAM1Q96QH2 718 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 PTCH1Q13635 1447 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 ROBO2Q9HCK4 1378 aa13.15□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 CPS1P31327 1500 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 KNDC1Q76NI1 1749 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 WAPLQ7Z5K2 1190 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 NWD1Q149M9 1564 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 TMF1P82094 1093 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 TESK2Q96S53 571 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 CDCA8Q53HL2 280 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa13.11□□□□□ -0.31
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