RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM2Q9UHN6 1383 aa13.46□□□□□ -0.25
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SH3BP4-208ENST00000462602 RIMS2Q9UQ26 1411 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 UBR1Q8IWV7 1749 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 ZFYVE9O95405 1425 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 MYOM2P54296 1465 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 TXNDC2Q86VQ3 553 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKLE2Q86XL3 938 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 SLIT1O75093 1534 aa13.42□□□□□ -0.26
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SH3BP4-208ENST00000462602 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa13.4□□□□□ -0.26
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SH3BP4-208ENST00000462602 LMTK3Q96Q04 1460 aa13.37□□□□□ -0.27
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SH3BP4-208ENST00000462602 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa13.37□□□□□ -0.27
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SH3BP4-208ENST00000462602 HSPA2P54652 639 aa13.35□□□□□ -0.27
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SH3BP4-208ENST00000462602 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.33□□□□□ -0.28
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SH3BP4-208ENST00000462602 MED14O60244 1454 aa13.32□□□□□ -0.28
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SH3BP4-208ENST00000462602 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
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SH3BP4-208ENST00000462602 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
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SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 LAMC1P11047 1609 aa13.29□□□□□ -0.28
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SH3BP4-208ENST00000462602 SLC26A8Q96RN1 970 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa13.28□□□□□ -0.28
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SH3BP4-208ENST00000462602 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa13.26□□□□□ -0.29
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SH3BP4-208ENST00000462602 ABCC11Q96J66 1382 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 USP47Q96K76 1375 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 STK26Q9P289 416 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.23□□□□□ -0.29
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SH3BP4-208ENST00000462602 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 STRCQ7RTU9 1775 aa13.22□□□□□ -0.29
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SH3BP4-208ENST00000462602 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
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SH3BP4-208ENST00000462602 PTCH1Q13635 1447 aa13.16□□□□□ -0.3
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SH3BP4-208ENST00000462602 NWD1Q149M9 1564 aa13.13□□□□□ -0.31
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SH3BP4-208ENST00000462602 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa13.13□□□□□ -0.31
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SH3BP4-208ENST00000462602 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 TESK2Q96S53 571 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 CDCA8Q53HL2 280 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
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SH3BP4-208ENST00000462602 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa13.11□□□□□ -0.31
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